Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G025201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S412
Pfam -
Panther DB PTHR22814 PTHR22814:SF114
NCBI CDD KOG1603; Copper chaperone
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03380 : Heavy metal transport/detoxification superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g05750.1 : heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G069601 - -
2 Sobic.003G353050 - -
3 Sobic.007G059800 expressed protein -
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14 Sobic.002G143600 expressed protein -
15 Sobic.009G235801 - -
16 Sobic.004G061300 expressed protein -
17 Sobic.008G192200 - -
18 Sobic.008G192100 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@expressed protein -
19 Sobic.002G333200 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.K042700 OsMADS70 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic001G025201--Sobic002G069601 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic001G025201--Sobic003G353050 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic001G025201--Sobic007G059800 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic001G025201--Sobic003G318400 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic001G025201--Sobic003G286650 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic001G025201--Sobic005G181700 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic001G025201--Sobic004G201200 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic001G025201--Sobic004G295200 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic001G025201--Sobic004G026900 Sobic002G069601--Sobic003G318400 Sobic002G069601--Sobic005G181700 Sobic002G069601--Sobic007G059800 Sobic002G069601--Sobic001G025201 Sobic002G069601--Sobic003G353050 Sobic008G192200 Sobic008G192200 Sobic002G069601--Sobic008G192200 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic002G069601--Sobic001G272300 Sobic003G353050--Sobic001G025201 Sobic003G353050--Sobic002G069601 Sobic003G353050--Sobic003G286650 Sobic002G333200 Sobic002G333200 Sobic003G353050--Sobic002G333200 Sobic006G259501 Sobic006G259501 Sobic003G353050--Sobic006G259501 Sobic003G353050--Sobic008G192200 Sobic003G353050--Sobic001G272300 Sobic007G059800--Sobic005G181700 Sobic007G059800--Sobic004G201200 Sobic007G059800--Sobic003G318400 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic007G059800--Sobic005G057600 Sobic007G059800--Sobic002G069601 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic007G059800--Sobic001G062200 Sobic007G059800--Sobic001G025201 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic007G059800--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic007G059800--Sobic004G286450 Sobic003G318400--Sobic002G069601 Sobic003G318400--Sobic005G181700 Sobic003G318400--Sobic007G059800 Sobic003G318400--Sobic004G201200 Sobic003G318400--Sobic001G025201 Sobic003G318400--Sobic003G353050 Sobic003G318400--Sobic003G286650 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic003G318400--Sobic001G267950 Sobic003G318400--Sobic005G057600 Sobic003G286650--Sobic003G353050 Sobic003G286650--Sobic001G025201 Sobic003G286650--Sobic002G069601 Sobic003G286650--Sobic002G333200 Sobic003G286650--Sobic004G026900 Sobic003G286650--Sobic003G318400 Sobic003G286650--Sobic007G059800 Sobic003G286650--Sobic005G181700 Sobic010G262650 Sobic010G262650 Sobic003G286650--Sobic010G262650 Sobic005G181700--Sobic007G059800 Sobic005G181700--Sobic003G318400 Sobic005G181700--Sobic004G201200 Sobic005G181700--Sobic002G069601 Sobic005G181700--Sobic005G057600 Sobic005G181700--Sobic001G062200 Sobic005G181700--Sobic001G025201 Sobic005G181700--Sobic003G372950 Sobic005G181700--Sobic004G286450 Sobic004G201200--Sobic007G059800 Sobic004G201200--Sobic005G181700 Sobic004G201200--Sobic005G057600 Sobic004G201200--Sobic003G318400 Sobic004G201200--Sobic001G062200 Sobic004G201200--Sobic002G069601 Sobic004G201200--Sobic003G372950 Sobic004G201200--Sobic004G286450 Sobic004G201200--Sobic001G025201 Sobic006G262001 Sobic006G262001 Sobic004G295200--Sobic006G262001 Sobic004G295200--Sobic001G025201 Sobic004G295200--Sobic007G059800 Sobic004G295200--Sobic002G069601 Sobic004G295200--Sobic003G318400 Sobic004G295200--Sobic003G353050 Sobic002G323800 Sobic002G323800 Sobic004G295200--Sobic002G323800 Sobic004G295200--Sobic005G181700 Sobic004G295200--Sobic004G201200 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic004G026900--Sobic004G061300 Sobic004G026900--Sobic003G286650 Sobic004G026900--Sobic001G025201 Sobic004G026900--Sobic003G353050 Sobic004G026900--Sobic007G059800 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic004G026900--Sobic009G178000 Sobic004G026900--Sobic002G069601 Sobic004G026900--Sobic003G318400 Sobic004G026900--Sobic005G181700
Octagon: transcription factors


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