Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G345300.1
Synonym Sb04g037230
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XVW7
Pfam -
Panther DB PTHR33414 PTHR33414:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G20610 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g57210.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022607 , Zm00025a032804
Brachypodium KQK01362
Barley HORVU0Hr1G017610.4 , HORVU0Hr1G017610.3 , HORVU0Hr1G017610.2
Wheat TraesCSU02G160700 , TraesCSU02G081400 , TraesCS6D02G377700
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G185000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G025201 - -
3 Sobic.003G353050 - -
4 Sobic.003G286650 - -
5 Sobic.001G418300 - -
6 Sobic.007G059800 expressed protein -
7 Sobic.004G295200 expressed protein -
8 Sobic.006G107332 - -
9 Sobic.002G143600 expressed protein -
10 Sobic.002G323800 expressed protein -
11 Sobic.004G201200 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed -
12 Sobic.005G181700 NB-ARC domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G069601 - -
14 Sobic.004G026900 ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G055300 expressed protein -
16 Sobic.003G318400 - -
17 Sobic.002G235000 expressed protein -
18 Sobic.006G259501 - -
19 Sobic.005G057600 expressed protein -
20 Sobic.006G262001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G345300 Sobic004G345300 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic004G345300--Sobic002G185000 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic004G345300--Sobic001G025201 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic004G345300--Sobic003G353050 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic004G345300--Sobic003G286650 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic004G345300--Sobic001G418300 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic004G345300--Sobic007G059800 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic004G345300--Sobic004G295200 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic004G345300--Sobic006G107332 Sobic002G143600 Sobic002G143600 Sobic004G345300--Sobic002G143600 Sobic002G185000--Sobic006G107332 Sobic002G185000--Sobic001G418300 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic002G185000--Sobic001G055300 Sobic002G185000--Sobic001G025201 Sobic002G185000--Sobic007G059800 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic002G185000--Sobic010G133800 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic002G185000--Sobic003G372950 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic002G185000--Sobic004G026900 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic002G185000--Sobic004G201200 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic001G025201--Sobic002G069601 Sobic001G025201--Sobic003G353050 Sobic001G025201--Sobic007G059800 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic001G025201--Sobic003G318400 Sobic001G025201--Sobic003G286650 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic001G025201--Sobic005G181700 Sobic001G025201--Sobic004G201200 Sobic001G025201--Sobic004G295200 Sobic001G025201--Sobic004G026900 Sobic003G353050--Sobic001G025201 Sobic003G353050--Sobic002G069601 Sobic003G353050--Sobic003G286650 Sobic002G333200 Sobic002G333200 Sobic003G353050--Sobic002G333200 Sobic006G259501 Sobic006G259501 Sobic003G353050--Sobic006G259501 Sobic008G192200 Sobic008G192200 Sobic003G353050--Sobic008G192200 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic003G353050--Sobic001G272300 Sobic003G286650--Sobic003G353050 Sobic003G286650--Sobic001G025201 Sobic003G286650--Sobic002G069601 Sobic003G286650--Sobic002G333200 Sobic003G286650--Sobic004G026900 Sobic003G286650--Sobic003G318400 Sobic003G286650--Sobic007G059800 Sobic003G286650--Sobic005G181700 Sobic010G262650 Sobic010G262650 Sobic003G286650--Sobic010G262650 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic001G418300--Sobic005G199500 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic001G418300--Sobic006G018500 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic001G418300--Sobic001G267950 Sobic001G418300--Sobic003G353050 Sobic001G418300--Sobic002G185000 Sobic001G472900 Sobic001G472900 Sobic001G418300--Sobic001G472900 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic001G418300--Sobic009G214700 Sobic001G418300--Sobic002G333200 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic001G418300--Sobic003G076300 Sobic007G059800--Sobic005G181700 Sobic007G059800--Sobic004G201200 Sobic007G059800--Sobic003G318400 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic007G059800--Sobic005G057600 Sobic007G059800--Sobic002G069601 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic007G059800--Sobic001G062200 Sobic007G059800--Sobic001G025201 Sobic007G059800--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic007G059800--Sobic004G286450 Sobic006G262001 Sobic006G262001 Sobic004G295200--Sobic006G262001 Sobic004G295200--Sobic001G025201 Sobic004G295200--Sobic007G059800 Sobic004G295200--Sobic002G069601 Sobic004G295200--Sobic003G318400 Sobic004G295200--Sobic003G353050 Sobic002G323800 Sobic002G323800 Sobic004G295200--Sobic002G323800 Sobic004G295200--Sobic005G181700 Sobic004G295200--Sobic004G201200 Sobic006G107332--Sobic001G055300 Sobic006G107332--Sobic002G185000 Sobic006G107332--Sobic003G372950 Sobic006G107332--Sobic005G057600 Sobic006G107332--Sobic004G286450 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic006G107332--Sobic003G064000 Sobic006G107332--Sobic007G059800 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic006G107332--Sobic008G154200 Sobic006G107332--Sobic004G201200 Sobic002G143600--Sobic003G353050 Sobic002G143600--Sobic002G333200 Sobic008G192100 Sobic008G192100 Sobic002G143600--Sobic008G192100 Sobic002G341400 Sobic002G341400 Sobic002G143600--Sobic002G341400 Sobic002G143600--Sobic002G069601 Sobic002G143600--Sobic001G025201 Sobic002G143600--Sobic003G286650 Sobic001G493300 Sobic001G493300 Sobic002G143600--Sobic001G493300 Sobic002G143600--Sobic008G192200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.