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Transcriptome id Sobic.004G073700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YN92
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G139201 - -
2 Sobic.001G084300 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G390600 AP2/EREBP transcription factor BABY BOOM, putative, expressed K09285: OVM, AP2-like factor, ANT lineage
4 Sobic.007G218550 - -
5 Sobic.007G174000 carrier, putative, expressed -
6 Sobic.002G269700 - -
7 Sobic.009G026900 protein kinase, putative, expressed -
8 Sobic.007G174701 - -
9 Sobic.002G152400 - -
10 Sobic.004G045100 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
11 Sobic.006G196700 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@late embryogenesis abundant group 1, putative, expressed -
12 Sobic.004G084800 - -
13 Sobic.004G258800 IQ calmodulin-binding and BAG domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G341500 O-methyltransferase, putative, expressed -
15 Sobic.001G025201 - -
16 Sobic.003G389500 mTERF family protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
17 Sobic.007G059800 expressed protein -
18 Sobic.009G235801 - -
19 Sobic.006G121800 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
20 Sobic.002G069601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G073700 Sobic004G073700 Sobic004G139201 Sobic004G139201 Sobic004G073700--Sobic004G139201 Sobic001G084300 Sobic001G084300 Sobic004G073700--Sobic001G084300 Sobic003G390600 Sobic003G390600 Sobic004G073700--Sobic003G390600 Sobic007G218550 Sobic007G218550 Sobic004G073700--Sobic007G218550 Sobic007G174000 Sobic007G174000 Sobic004G073700--Sobic007G174000 Sobic002G269700 Sobic002G269700 Sobic004G073700--Sobic002G269700 Sobic009G026900 Sobic009G026900 Sobic004G073700--Sobic009G026900 Sobic007G174701 Sobic007G174701 Sobic004G073700--Sobic007G174701 Sobic002G152400 Sobic002G152400 Sobic004G073700--Sobic002G152400 Sobic004G139201--Sobic007G218550 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic004G139201--Sobic002G185000 Sobic004G139201--Sobic009G026900 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic004G139201--Sobic001G418300 Sobic004G084800 Sobic004G084800 Sobic004G139201--Sobic004G084800 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic004G139201--Sobic006G107332 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic004G139201--Sobic001G025201 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic004G139201--Sobic003G076300 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic004G139201--Sobic004G026900 Sobic001G084300--Sobic004G073700 Sobic001G084300--Sobic002G152400 Sobic001G084300--Sobic003G390600 Sobic001G084300--Sobic002G269700 Sobic001G354900 Sobic001G354900 Sobic001G084300--Sobic001G354900 Sobic003G281400 Sobic003G281400 Sobic001G084300--Sobic003G281400 Sobic001G536300 Sobic001G536300 Sobic001G084300--Sobic001G536300 Sobic006G027800 Sobic006G027800 Sobic001G084300--Sobic006G027800 Sobic008G047900 Sobic008G047900 Sobic001G084300--Sobic008G047900 Sobic003G390600--Sobic003G281400 Sobic004G044500 Sobic004G044500 Sobic003G390600--Sobic004G044500 Sobic003G390600--Sobic006G027800 Sobic003G390600--Sobic007G174701 Sobic003G390600--Sobic004G084800 Sobic003G390600--Sobic004G073700 Sobic004G341500 Sobic004G341500 Sobic003G390600--Sobic004G341500 Sobic003G390600--Sobic007G174000 Sobic003G390600--Sobic001G084300 Sobic007G218550--Sobic002G269700 Sobic006G196700 Sobic006G196700 Sobic007G218550--Sobic006G196700 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic007G218550--Sobic002G213050 Sobic003G389500 Sobic003G389500 Sobic007G218550--Sobic003G389500 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic007G218550--Sobic006G018500 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic007G218550--Sobic005G199500 Sobic006G261000 Sobic006G261000 Sobic007G218550--Sobic006G261000 Sobic007G075200 Sobic007G075200 Sobic007G218550--Sobic007G075200 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic007G218550--Sobic007G069750 Sobic008G078500 Sobic008G078500 Sobic007G174000--Sobic008G078500 Sobic004G203633 Sobic004G203633 Sobic007G174000--Sobic004G203633 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic007G174000--Sobic003G399200 Sobic007G155950 Sobic007G155950 Sobic007G174000--Sobic007G155950 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic007G174000--Sobic004G357600 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic007G174000--Sobic005G182100 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic007G174000--Sobic007G225050 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic007G174000--Sobic007G137100 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic007G174000--Sobic001G093732 Sobic002G269700--Sobic002G213050 Sobic002G269700--Sobic007G218550 Sobic002G269700--Sobic007G069750 Sobic002G269700--Sobic006G196700 Sobic002G269700--Sobic005G199500 Sobic002G269700--Sobic002G152400 Sobic002G269700--Sobic006G018500 Sobic001G112300 Sobic001G112300 Sobic002G269700--Sobic001G112300 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic002G269700--Sobic010G129900 Sobic003G177350 Sobic003G177350 Sobic009G026900--Sobic003G177350 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic009G026900--Sobic009G178000 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic009G026900--Sobic001G258700 Sobic009G026900--Sobic004G026900 Sobic009G026900--Sobic004G139201 Sobic002G235000 Sobic002G235000 Sobic009G026900--Sobic002G235000 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic009G026900--Sobic001G504300 Sobic006G064900 Sobic006G064900 Sobic009G026900--Sobic006G064900 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic009G026900--Sobic006G065000 Sobic007G206600 Sobic007G206600 Sobic007G174701--Sobic007G206600 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic007G174701--Sobic008G086100 Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic007G174701--Sobic006G119100 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic007G174701--Sobic004G223350 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic007G174701--Sobic007G173901 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic007G174701--Sobic002G142350 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic007G174701--Sobic002G262500 Sobic007G174701--Sobic004G357600 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic007G174701--Sobic007G038200 Sobic002G152400--Sobic002G269700 Sobic002G152400--Sobic005G199500 Sobic002G152400--Sobic006G018500 Sobic002G152400--Sobic007G069750 Sobic002G152400--Sobic002G213050 Sobic002G152400--Sobic010G129900 Sobic002G152400--Sobic001G418300 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic002G152400--Sobic004G055400 Sobic002G152400--Sobic006G196700
Octagon: transcription factors


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