Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G152400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QBJ5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G269700 - -
2 Sobic.005G199500 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
3 Sobic.006G018500 - -
4 Sobic.007G069750 - -
5 Sobic.002G213050 - -
6 Sobic.010G129900 expressed protein -
7 Sobic.001G418300 - -
8 Sobic.004G055400 - -
9 Sobic.006G196700 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@late embryogenesis abundant group 1, putative, expressed -
10 Sobic.001G472900 - -
11 Sobic.001G267950 - -
12 Sobic.002G235000 expressed protein -
13 Sobic.001G112300 OsCam3 - Calmodulin, expressed K02183: calmodulin
14 Sobic.006G261000 cytochrome P450, putative, expressed -
15 Sobic.009G214700 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@bHelix-loop-helix transcription factor, putative, expressed -
16 Sobic.007G075200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@bifunctional purine biosynthesis protein purH, putative, expressed K00602: phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase / IMP cyclohydrolase
17 Sobic.002G162900 - -
18 Sobic.003G353050 - -
19 Sobic.001G403900 ECAGL1 - ECA1 gametogenesis related family protein precursor, expressed -
20 Sobic.001G430200 dynamin family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G152400 Sobic002G152400 Sobic002G269700 Sobic002G269700 Sobic002G152400--Sobic002G269700 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic002G152400--Sobic005G199500 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic002G152400--Sobic006G018500 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic002G152400--Sobic007G069750 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic002G152400--Sobic002G213050 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic002G152400--Sobic010G129900 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic002G152400--Sobic001G418300 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic002G152400--Sobic004G055400 Sobic006G196700 Sobic006G196700 Sobic002G152400--Sobic006G196700 Sobic002G269700--Sobic002G213050 Sobic007G218550 Sobic007G218550 Sobic002G269700--Sobic007G218550 Sobic002G269700--Sobic007G069750 Sobic002G269700--Sobic006G196700 Sobic002G269700--Sobic005G199500 Sobic002G269700--Sobic002G152400 Sobic002G269700--Sobic006G018500 Sobic001G112300 Sobic001G112300 Sobic002G269700--Sobic001G112300 Sobic002G269700--Sobic010G129900 Sobic005G199500--Sobic006G018500 Sobic005G199500--Sobic007G069750 Sobic005G199500--Sobic002G213050 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic005G199500--Sobic001G267950 Sobic005G199500--Sobic001G418300 Sobic005G199500--Sobic010G129900 Sobic006G261000 Sobic006G261000 Sobic005G199500--Sobic006G261000 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic005G199500--Sobic009G214700 Sobic007G075200 Sobic007G075200 Sobic005G199500--Sobic007G075200 Sobic006G018500--Sobic005G199500 Sobic006G018500--Sobic002G213050 Sobic006G018500--Sobic001G267950 Sobic006G018500--Sobic006G261000 Sobic006G018500--Sobic007G075200 Sobic006G018500--Sobic001G418300 Sobic006G018500--Sobic007G069750 Sobic001G472900 Sobic001G472900 Sobic006G018500--Sobic001G472900 Sobic006G018500--Sobic009G214700 Sobic007G069750--Sobic005G199500 Sobic007G069750--Sobic010G129900 Sobic007G069750--Sobic002G213050 Sobic007G069750--Sobic001G112300 Sobic007G069750--Sobic006G018500 Sobic007G069750--Sobic004G055400 Sobic007G069750--Sobic002G269700 Sobic007G069750--Sobic001G472900 Sobic002G237400 Sobic002G237400 Sobic007G069750--Sobic002G237400 Sobic002G213050--Sobic006G018500 Sobic002G213050--Sobic005G199500 Sobic002G213050--Sobic007G069750 Sobic002G213050--Sobic001G472900 Sobic002G213050--Sobic006G261000 Sobic002G213050--Sobic007G075200 Sobic002G213050--Sobic002G269700 Sobic002G213050--Sobic001G112300 Sobic002G213050--Sobic001G267950 Sobic010G129900--Sobic007G069750 Sobic010G129900--Sobic004G055400 Sobic010G129900--Sobic005G199500 Sobic010G129900--Sobic001G112300 Sobic001G403900 Sobic001G403900 Sobic010G129900--Sobic001G403900 Sobic010G129900--Sobic002G237400 Sobic010G129900--Sobic002G213050 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic010G129900--Sobic001G221750 Sobic002G162900 Sobic002G162900 Sobic010G129900--Sobic002G162900 Sobic001G418300--Sobic005G199500 Sobic001G418300--Sobic006G018500 Sobic001G418300--Sobic001G267950 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic001G418300--Sobic003G353050 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic001G418300--Sobic002G185000 Sobic001G418300--Sobic001G472900 Sobic001G418300--Sobic009G214700 Sobic002G333200 Sobic002G333200 Sobic001G418300--Sobic002G333200 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic001G418300--Sobic003G076300 Sobic004G055400--Sobic010G129900 Sobic004G055400--Sobic002G162900 Sobic004G055400--Sobic007G069750 Sobic004G055400--Sobic005G199500 Sobic003G278800 Sobic003G278800 Sobic004G055400--Sobic003G278800 Sobic010G083100 Sobic010G083100 Sobic004G055400--Sobic010G083100 Sobic004G055400--Sobic006G018500 Sobic004G055400--Sobic001G112300 Sobic004G055400--Sobic002G213050 Sobic006G196700--Sobic006G261000 Sobic006G196700--Sobic002G269700 Sobic003G241400 Sobic003G241400 Sobic006G196700--Sobic003G241400 Sobic006G196700--Sobic007G075200 Sobic006G196700--Sobic006G018500 Sobic006G196700--Sobic002G213050 Sobic006G196700--Sobic009G214700 Sobic006G196700--Sobic005G199500 Sobic003G389500 Sobic003G389500 Sobic006G196700--Sobic003G389500
Octagon: transcription factors


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