Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G129900.1
Synonym CLE10
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z1L1
Pfam -
Panther DB PTHR34359 PTHR34359:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G69320 : CLAVATA3/ESR-RELATED 10
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43660.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044204
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G069750 - -
2 Sobic.004G055400 - -
3 Sobic.005G199500 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
4 Sobic.001G112300 OsCam3 - Calmodulin, expressed K02183: calmodulin
5 Sobic.001G403900 ECAGL1 - ECA1 gametogenesis related family protein precursor, expressed -
6 Sobic.002G237400 expressed protein -
7 Sobic.002G213050 - -
8 Sobic.001G221750 - -
9 Sobic.002G162900 - -
10 Sobic.006G018500 - -
11 Sobic.001G418300 - -
12 Sobic.006G222200 MBTB7 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
13 Sobic.006G223850 - -
14 Sobic.002G269700 - -
15 Sobic.001G472900 - -
16 Sobic.001G005100 lipid binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G278800 lipase, putative, expressed -
18 Sobic.001G430200 dynamin family protein, putative, expressed -
19 Sobic.006G281300 - -
20 Sobic.001G267950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic010G129900--Sobic007G069750 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic010G129900--Sobic004G055400 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic010G129900--Sobic005G199500 Sobic001G112300 Sobic001G112300 Sobic010G129900--Sobic001G112300 Sobic001G403900 Sobic001G403900 Sobic010G129900--Sobic001G403900 Sobic002G237400 Sobic002G237400 Sobic010G129900--Sobic002G237400 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic010G129900--Sobic002G213050 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic010G129900--Sobic001G221750 Sobic002G162900 Sobic002G162900 Sobic010G129900--Sobic002G162900 Sobic007G069750--Sobic005G199500 Sobic007G069750--Sobic010G129900 Sobic007G069750--Sobic002G213050 Sobic007G069750--Sobic001G112300 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic007G069750--Sobic006G018500 Sobic007G069750--Sobic004G055400 Sobic002G269700 Sobic002G269700 Sobic007G069750--Sobic002G269700 Sobic001G472900 Sobic001G472900 Sobic007G069750--Sobic001G472900 Sobic007G069750--Sobic002G237400 Sobic004G055400--Sobic010G129900 Sobic004G055400--Sobic002G162900 Sobic004G055400--Sobic007G069750 Sobic004G055400--Sobic005G199500 Sobic003G278800 Sobic003G278800 Sobic004G055400--Sobic003G278800 Sobic010G083100 Sobic010G083100 Sobic004G055400--Sobic010G083100 Sobic004G055400--Sobic006G018500 Sobic004G055400--Sobic001G112300 Sobic004G055400--Sobic002G213050 Sobic005G199500--Sobic006G018500 Sobic005G199500--Sobic007G069750 Sobic005G199500--Sobic002G213050 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic005G199500--Sobic001G267950 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic005G199500--Sobic001G418300 Sobic005G199500--Sobic010G129900 Sobic006G261000 Sobic006G261000 Sobic005G199500--Sobic006G261000 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic005G199500--Sobic009G214700 Sobic007G075200 Sobic007G075200 Sobic005G199500--Sobic007G075200 Sobic001G112300--Sobic007G069750 Sobic001G112300--Sobic010G129900 Sobic001G112300--Sobic002G213050 Sobic001G112300--Sobic002G237400 Sobic001G112300--Sobic004G055400 Sobic009G127201 Sobic009G127201 Sobic001G112300--Sobic009G127201 Sobic001G112300--Sobic001G472900 Sobic001G112300--Sobic002G269700 Sobic001G112300--Sobic003G278800 Sobic008G154500 Sobic008G154500 Sobic001G403900--Sobic008G154500 Sobic001G403900--Sobic010G129900 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic001G403900--Sobic001G005100 Sobic001G403900--Sobic004G055400 Sobic001G403900--Sobic007G069750 Sobic001G403900--Sobic002G162900 Sobic006G223850 Sobic006G223850 Sobic001G403900--Sobic006G223850 Sobic001G403900--Sobic005G199500 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic001G403900--Sobic006G107332 Sobic002G237400--Sobic001G112300 Sobic002G237400--Sobic010G129900 Sobic002G237400--Sobic007G069750 Sobic002G237400--Sobic006G223850 Sobic002G237400--Sobic009G127201 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic002G237400--Sobic002G033100 Sobic002G237400--Sobic004G055400 Sobic002G237400--Sobic001G221750 Sobic002G237400--Sobic001G403900 Sobic002G213050--Sobic006G018500 Sobic002G213050--Sobic005G199500 Sobic002G213050--Sobic007G069750 Sobic002G213050--Sobic001G472900 Sobic002G213050--Sobic006G261000 Sobic002G213050--Sobic007G075200 Sobic002G213050--Sobic002G269700 Sobic002G213050--Sobic001G112300 Sobic002G213050--Sobic001G267950 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic001G221750--Sobic006G222200 Sobic001G221750--Sobic002G033100 Sobic001G221750--Sobic010G129900 Sobic001G221750--Sobic001G112300 Sobic006G155400 Sobic006G155400 Sobic001G221750--Sobic006G155400 Sobic001G221750--Sobic001G005100 Sobic005G150250 Sobic005G150250 Sobic001G221750--Sobic005G150250 Sobic001G221750--Sobic007G069750 Sobic001G221750--Sobic002G237400 Sobic002G162900--Sobic003G278800 Sobic002G162900--Sobic004G055400 Sobic002G162900--Sobic001G005100 Sobic002G268250 Sobic002G268250 Sobic002G162900--Sobic002G268250 Sobic002G162900--Sobic010G129900 Sobic002G162900--Sobic007G069750 Sobic002G162900--Sobic001G403900 Sobic002G162900--Sobic001G112300 Sobic002G162900--Sobic010G083100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.