Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G162900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QBQ2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
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Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G278800 lipase, putative, expressed -
2 Sobic.004G055400 - -
3 Sobic.001G005100 lipid binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G268250 - -
5 Sobic.010G129900 expressed protein -
6 Sobic.007G069750 - -
7 Sobic.001G403900 ECAGL1 - ECA1 gametogenesis related family protein precursor, expressed -
8 Sobic.001G112300 OsCam3 - Calmodulin, expressed K02183: calmodulin
9 Sobic.010G083100 CXE carboxylesterase, putative, expressed -
10 Sobic.005G199500 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
11 Sobic.002G213050 - -
12 Sobic.002G237400 expressed protein -
13 Sobic.002G033100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
14 Sobic.006G018500 - -
15 Sobic.001G221750 - -
16 Sobic.001G418300 - -
17 Sobic.006G222200 MBTB7 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
18 Sobic.001G472900 - -
19 Sobic.002G269700 - -
20 Sobic.006G223850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G162900 Sobic002G162900 Sobic003G278800 Sobic003G278800 Sobic002G162900--Sobic003G278800 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic002G162900--Sobic004G055400 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic002G162900--Sobic001G005100 Sobic002G268250 Sobic002G268250 Sobic002G162900--Sobic002G268250 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic002G162900--Sobic010G129900 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic002G162900--Sobic007G069750 Sobic001G403900 Sobic001G403900 Sobic002G162900--Sobic001G403900 Sobic001G112300 Sobic001G112300 Sobic002G162900--Sobic001G112300 Sobic010G083100 Sobic010G083100 Sobic002G162900--Sobic010G083100 Sobic003G278800--Sobic002G162900 Sobic003G278800--Sobic001G005100 Sobic003G278800--Sobic004G055400 Sobic003G278800--Sobic001G112300 Sobic003G278800--Sobic010G129900 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic003G278800--Sobic002G033100 Sobic004G045000 Sobic004G045000 Sobic003G278800--Sobic004G045000 Sobic003G278800--Sobic007G069750 Sobic003G278800--Sobic002G268250 Sobic004G055400--Sobic010G129900 Sobic004G055400--Sobic002G162900 Sobic004G055400--Sobic007G069750 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic004G055400--Sobic005G199500 Sobic004G055400--Sobic003G278800 Sobic004G055400--Sobic010G083100 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic004G055400--Sobic006G018500 Sobic004G055400--Sobic001G112300 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic004G055400--Sobic002G213050 Sobic001G005100--Sobic003G278800 Sobic001G005100--Sobic002G033100 Sobic001G005100--Sobic002G162900 Sobic001G005100--Sobic001G403900 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic001G005100--Sobic006G222200 Sobic010G000401 Sobic010G000401 Sobic001G005100--Sobic010G000401 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic001G005100--Sobic001G221750 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic001G005100--Sobic004G089801 Sobic001G005100--Sobic004G055400 Sobic002G268250--Sobic002G162900 Sobic002G268250--Sobic003G278800 Sobic003G391800 Sobic003G391800 Sobic002G268250--Sobic003G391800 Sobic002G268250--Sobic004G045000 Sobic002G268250--Sobic004G055400 Sobic002G235000 Sobic002G235000 Sobic002G268250--Sobic002G235000 Sobic002G268250--Sobic001G005100 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic002G268250--Sobic002G365300 Sobic002G268250--Sobic010G083100 Sobic010G129900--Sobic007G069750 Sobic010G129900--Sobic004G055400 Sobic010G129900--Sobic005G199500 Sobic010G129900--Sobic001G112300 Sobic010G129900--Sobic001G403900 Sobic002G237400 Sobic002G237400 Sobic010G129900--Sobic002G237400 Sobic010G129900--Sobic002G213050 Sobic010G129900--Sobic001G221750 Sobic010G129900--Sobic002G162900 Sobic007G069750--Sobic005G199500 Sobic007G069750--Sobic010G129900 Sobic007G069750--Sobic002G213050 Sobic007G069750--Sobic001G112300 Sobic007G069750--Sobic006G018500 Sobic007G069750--Sobic004G055400 Sobic002G269700 Sobic002G269700 Sobic007G069750--Sobic002G269700 Sobic001G472900 Sobic001G472900 Sobic007G069750--Sobic001G472900 Sobic007G069750--Sobic002G237400 Sobic008G154500 Sobic008G154500 Sobic001G403900--Sobic008G154500 Sobic001G403900--Sobic010G129900 Sobic001G403900--Sobic001G005100 Sobic001G403900--Sobic004G055400 Sobic001G403900--Sobic007G069750 Sobic001G403900--Sobic002G162900 Sobic006G223850 Sobic006G223850 Sobic001G403900--Sobic006G223850 Sobic001G403900--Sobic005G199500 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic001G403900--Sobic006G107332 Sobic001G112300--Sobic007G069750 Sobic001G112300--Sobic010G129900 Sobic001G112300--Sobic002G213050 Sobic001G112300--Sobic002G237400 Sobic001G112300--Sobic004G055400 Sobic009G127201 Sobic009G127201 Sobic001G112300--Sobic009G127201 Sobic001G112300--Sobic001G472900 Sobic001G112300--Sobic002G269700 Sobic001G112300--Sobic003G278800 Sobic010G083100--Sobic004G055400 Sobic009G030701 Sobic009G030701 Sobic010G083100--Sobic009G030701 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic010G083100--Sobic001G418300 Sobic006G281300 Sobic006G281300 Sobic010G083100--Sobic006G281300 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic010G083100--Sobic002G185000 Sobic010G083100--Sobic005G199500 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic010G083100--Sobic003G076300 Sobic010G083100--Sobic006G018500 Sobic010G083100--Sobic002G162900
Octagon: transcription factors


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