Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G084800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5XXV9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G139201 - -
2 Sobic.007G218550 - -
3 Sobic.010G083200 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
4 Sobic.004G341500 O-methyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.002G269700 - -
6 Sobic.001G005100 lipid binding protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G162900 - -
8 Sobic.003G390600 AP2/EREBP transcription factor BABY BOOM, putative, expressed K09285: OVM, AP2-like factor, ANT lineage
9 Sobic.002G268250 - -
10 Sobic.001G403900 ECAGL1 - ECA1 gametogenesis related family protein precursor, expressed -
11 Sobic.003G391800 expressed protein -
12 Sobic.003G278800 lipase, putative, expressed -
13 Sobic.004G089801 - -
14 Sobic.004G055400 - -
15 Sobic.010G000401 - -
16 Sobic.010G129900 expressed protein -
17 Sobic.006G027800 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
18 Sobic.004G045000 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
19 Sobic.007G069750 - -
20 Sobic.004G045100 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G084800 Sobic004G084800 Sobic004G139201 Sobic004G139201 Sobic004G084800--Sobic004G139201 Sobic007G218550 Sobic007G218550 Sobic004G084800--Sobic007G218550 Sobic010G083200 Sobic010G083200 Sobic004G084800--Sobic010G083200 Sobic004G341500 Sobic004G341500 Sobic004G084800--Sobic004G341500 Sobic002G269700 Sobic002G269700 Sobic004G084800--Sobic002G269700 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic004G084800--Sobic001G005100 Sobic002G162900 Sobic002G162900 Sobic004G084800--Sobic002G162900 Sobic003G390600 Sobic003G390600 Sobic004G084800--Sobic003G390600 Sobic002G268250 Sobic002G268250 Sobic004G084800--Sobic002G268250 Sobic004G139201--Sobic007G218550 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic004G139201--Sobic002G185000 Sobic009G026900 Sobic009G026900 Sobic004G139201--Sobic009G026900 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic004G139201--Sobic001G418300 Sobic004G139201--Sobic004G084800 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic004G139201--Sobic006G107332 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic004G139201--Sobic001G025201 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic004G139201--Sobic003G076300 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic004G139201--Sobic004G026900 Sobic007G218550--Sobic002G269700 Sobic006G196700 Sobic006G196700 Sobic007G218550--Sobic006G196700 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic007G218550--Sobic002G213050 Sobic003G389500 Sobic003G389500 Sobic007G218550--Sobic003G389500 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic007G218550--Sobic006G018500 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic007G218550--Sobic005G199500 Sobic006G261000 Sobic006G261000 Sobic007G218550--Sobic006G261000 Sobic007G075200 Sobic007G075200 Sobic007G218550--Sobic007G075200 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic007G218550--Sobic007G069750 Sobic010G083200--Sobic004G084800 Sobic001G380100 Sobic001G380100 Sobic010G083200--Sobic001G380100 Sobic004G190300 Sobic004G190300 Sobic010G083200--Sobic004G190300 Sobic010G083200--Sobic007G218550 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic010G083200--Sobic001G221750 Sobic010G200300 Sobic010G200300 Sobic010G083200--Sobic010G200300 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic010G083200--Sobic004G089801 Sobic003G048900 Sobic003G048900 Sobic010G083200--Sobic003G048900 Sobic010G083200--Sobic002G269700 Sobic004G341500--Sobic004G084800 Sobic004G341500--Sobic004G139201 Sobic001G004901 Sobic001G004901 Sobic004G341500--Sobic001G004901 Sobic004G341500--Sobic003G390600 Sobic010G183900 Sobic010G183900 Sobic004G341500--Sobic010G183900 Sobic004G045100 Sobic004G045100 Sobic004G341500--Sobic004G045100 Sobic004G073700 Sobic004G073700 Sobic004G341500--Sobic004G073700 Sobic004G341500--Sobic007G218550 Sobic002G427201 Sobic002G427201 Sobic004G341500--Sobic002G427201 Sobic002G269700--Sobic002G213050 Sobic002G269700--Sobic007G218550 Sobic002G269700--Sobic007G069750 Sobic002G269700--Sobic006G196700 Sobic002G269700--Sobic005G199500 Sobic002G152400 Sobic002G152400 Sobic002G269700--Sobic002G152400 Sobic002G269700--Sobic006G018500 Sobic001G112300 Sobic001G112300 Sobic002G269700--Sobic001G112300 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic002G269700--Sobic010G129900 Sobic003G278800 Sobic003G278800 Sobic001G005100--Sobic003G278800 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic001G005100--Sobic002G033100 Sobic001G005100--Sobic002G162900 Sobic001G403900 Sobic001G403900 Sobic001G005100--Sobic001G403900 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic001G005100--Sobic006G222200 Sobic010G000401 Sobic010G000401 Sobic001G005100--Sobic010G000401 Sobic001G005100--Sobic001G221750 Sobic001G005100--Sobic004G089801 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic001G005100--Sobic004G055400 Sobic002G162900--Sobic003G278800 Sobic002G162900--Sobic004G055400 Sobic002G162900--Sobic001G005100 Sobic002G162900--Sobic002G268250 Sobic002G162900--Sobic010G129900 Sobic002G162900--Sobic007G069750 Sobic002G162900--Sobic001G403900 Sobic002G162900--Sobic001G112300 Sobic010G083100 Sobic010G083100 Sobic002G162900--Sobic010G083100 Sobic003G281400 Sobic003G281400 Sobic003G390600--Sobic003G281400 Sobic004G044500 Sobic004G044500 Sobic003G390600--Sobic004G044500 Sobic006G027800 Sobic006G027800 Sobic003G390600--Sobic006G027800 Sobic007G174701 Sobic007G174701 Sobic003G390600--Sobic007G174701 Sobic003G390600--Sobic004G084800 Sobic003G390600--Sobic004G073700 Sobic003G390600--Sobic004G341500 Sobic007G174000 Sobic007G174000 Sobic003G390600--Sobic007G174000 Sobic001G084300 Sobic001G084300 Sobic003G390600--Sobic001G084300 Sobic002G268250--Sobic002G162900 Sobic002G268250--Sobic003G278800 Sobic003G391800 Sobic003G391800 Sobic002G268250--Sobic003G391800 Sobic004G045000 Sobic004G045000 Sobic002G268250--Sobic004G045000 Sobic002G268250--Sobic004G055400 Sobic002G235000 Sobic002G235000 Sobic002G268250--Sobic002G235000 Sobic002G268250--Sobic001G005100 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic002G268250--Sobic002G365300 Sobic002G268250--Sobic010G083100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.