Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G083200.2
Synonym Sb10g007224
Functional annotation gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed
UniProt A0A1W0VS15
Pfam PF12695
Panther DB PTHR23024 PTHR23024:SF137
NCBI CDD KOG1515; Arylacetamide deacetylase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G03550 : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g28740.1 : gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049565 , Zm00025a042666 , Zm00025a047291
Brachypodium KQJ90535 , KQK19014
Barley HORVU3Hr1G022640.3 , HORVU3Hr1G022640.2 , HORVU3Hr1G022640.1 , HORVU0Hr1G019710.18 , HORVU0Hr1G019710.17 , HORVU0Hr1G019710.2 , HORVU0Hr1G019710.3
Wheat TraesCS3A02G122000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.006G210600 expressed protein -
20 Sobic.002G240300 expressed protein K19307: 25S rRNA (uracil2634-N3)-methyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic010G083200 Sobic010G083200 Sobic004G084800 Sobic004G084800 Sobic010G083200--Sobic004G084800 Sobic001G380100 Sobic001G380100 Sobic010G083200--Sobic001G380100 Sobic004G190300 Sobic004G190300 Sobic010G083200--Sobic004G190300 Sobic007G218550 Sobic007G218550 Sobic010G083200--Sobic007G218550 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic010G083200--Sobic001G221750 Sobic010G200300 Sobic010G200300 Sobic010G083200--Sobic010G200300 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic010G083200--Sobic004G089801 Sobic003G048900 Sobic003G048900 Sobic010G083200--Sobic003G048900 Sobic002G269700 Sobic002G269700 Sobic010G083200--Sobic002G269700 Sobic004G139201 Sobic004G139201 Sobic004G084800--Sobic004G139201 Sobic004G084800--Sobic007G218550 Sobic004G084800--Sobic010G083200 Sobic004G341500 Sobic004G341500 Sobic004G084800--Sobic004G341500 Sobic004G084800--Sobic002G269700 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic004G084800--Sobic001G005100 Sobic002G162900 Sobic002G162900 Sobic004G084800--Sobic002G162900 Sobic003G390600 Sobic003G390600 Sobic004G084800--Sobic003G390600 Sobic002G268250 Sobic002G268250 Sobic004G084800--Sobic002G268250 Sobic001G380100--Sobic010G083200 Sobic001G380100--Sobic004G190300 Sobic001G204400 Sobic001G204400 Sobic001G380100--Sobic001G204400 Sobic010G110050 Sobic010G110050 Sobic001G380100--Sobic010G110050 Sobic001G380100--Sobic004G084800 Sobic002G280001 Sobic002G280001 Sobic001G380100--Sobic002G280001 Sobic002G266250 Sobic002G266250 Sobic001G380100--Sobic002G266250 Sobic001G004901 Sobic001G004901 Sobic001G380100--Sobic001G004901 Sobic007G031000 Sobic007G031000 Sobic001G380100--Sobic007G031000 Sobic006G210600 Sobic006G210600 Sobic004G190300--Sobic006G210600 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic004G190300--Sobic002G132201 Sobic010G215201 Sobic010G215201 Sobic004G190300--Sobic010G215201 Sobic006G161200 Sobic006G161200 Sobic004G190300--Sobic006G161200 Sobic005G073300 Sobic005G073300 Sobic004G190300--Sobic005G073300 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic004G190300--Sobic002G054800 Sobic003G149700 Sobic003G149700 Sobic004G190300--Sobic003G149700 Sobic003G356500 Sobic003G356500 Sobic004G190300--Sobic003G356500 Sobic004G190300--Sobic001G380100 Sobic007G218550--Sobic002G269700 Sobic006G196700 Sobic006G196700 Sobic007G218550--Sobic006G196700 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic007G218550--Sobic002G213050 Sobic003G389500 Sobic003G389500 Sobic007G218550--Sobic003G389500 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic007G218550--Sobic006G018500 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic007G218550--Sobic005G199500 Sobic006G261000 Sobic006G261000 Sobic007G218550--Sobic006G261000 Sobic007G075200 Sobic007G075200 Sobic007G218550--Sobic007G075200 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic007G218550--Sobic007G069750 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic001G221750--Sobic006G222200 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic001G221750--Sobic002G033100 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic001G221750--Sobic010G129900 Sobic001G112300 Sobic001G112300 Sobic001G221750--Sobic001G112300 Sobic006G155400 Sobic006G155400 Sobic001G221750--Sobic006G155400 Sobic001G221750--Sobic001G005100 Sobic005G150250 Sobic005G150250 Sobic001G221750--Sobic005G150250 Sobic001G221750--Sobic007G069750 Sobic002G237400 Sobic002G237400 Sobic001G221750--Sobic002G237400 Sobic010G200300--Sobic003G048900 Sobic001G259200 Sobic001G259200 Sobic010G200300--Sobic001G259200 Sobic010G200300--Sobic007G069750 Sobic010G200300--Sobic001G221750 Sobic002G094700 Sobic002G094700 Sobic010G200300--Sobic002G094700 Sobic010G200300--Sobic001G112300 Sobic010G200300--Sobic010G129900 Sobic010G200300--Sobic005G199500 Sobic010G200300--Sobic002G213050 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic004G089801--Sobic001G084133 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic004G089801--Sobic004G272000 Sobic004G089801--Sobic001G005100 Sobic004G089801--Sobic003G356500 Sobic003G059500 Sobic003G059500 Sobic004G089801--Sobic003G059500 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic004G089801--Sobic002G365300 Sobic004G089801--Sobic006G222200 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic004G089801--Sobic005G230900 Sobic004G089801--Sobic002G033100 Sobic003G048900--Sobic010G200300 Sobic003G048900--Sobic002G094700 Sobic003G048900--Sobic001G259200 Sobic010G207450 Sobic010G207450 Sobic003G048900--Sobic010G207450 Sobic007G032200 Sobic007G032200 Sobic003G048900--Sobic007G032200 Sobic003G048900--Sobic001G221750 Sobic003G048900--Sobic007G069750 Sobic003G048900--Sobic001G112300 Sobic007G091800 Sobic007G091800 Sobic003G048900--Sobic007G091800 Sobic002G269700--Sobic002G213050 Sobic002G269700--Sobic007G218550 Sobic002G269700--Sobic007G069750 Sobic002G269700--Sobic006G196700 Sobic002G269700--Sobic005G199500 Sobic002G152400 Sobic002G152400 Sobic002G269700--Sobic002G152400 Sobic002G269700--Sobic006G018500 Sobic002G269700--Sobic001G112300 Sobic002G269700--Sobic010G129900
Octagon: transcription factors


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