Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G426600.1
Synonym Sb02g043700
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W813
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085 PTHR33085:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g49050.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G242600 RIPER9 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
2 Sobic.001G065400 - -
3 Sobic.009G221701 - -
4 Sobic.003G396400 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G189350 - -
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7 Sobic.010G217466 - -
8 Sobic.001G004901 - -
9 Sobic.005G106800 - -
10 Sobic.003G299400 - -
11 Sobic.007G056400 vacuolar ATP synthase subunit D 1, putative, expressed K02149: ATPeV1D, V-type H+-transporting ATPase subunit D
12 Sobic.002G262500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@osFTL4 FT-Like4 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
13 Sobic.010G149900 - -
14 Sobic.003G292800 expressed protein -
15 Sobic.002G410050 - -
16 Sobic.002G149550 - K03879: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
17 Sobic.002G429200 expressed protein -
18 Sobic.006G214101 - -
19 Sobic.009G165050 - -
20 Sobic.010G184201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G426600 Sobic002G426600 Sobic006G242600 Sobic006G242600 Sobic002G426600--Sobic006G242600 Sobic001G065400 Sobic001G065400 Sobic002G426600--Sobic001G065400 Sobic009G221701 Sobic009G221701 Sobic002G426600--Sobic009G221701 Sobic003G396400 Sobic003G396400 Sobic002G426600--Sobic003G396400 Sobic002G189350 Sobic002G189350 Sobic002G426600--Sobic002G189350 Sobic002G427201 Sobic002G427201 Sobic002G426600--Sobic002G427201 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic002G426600--Sobic010G217466 Sobic001G004901 Sobic001G004901 Sobic002G426600--Sobic001G004901 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic002G426600--Sobic005G106800 Sobic006G242600--Sobic003G396400 Sobic006G242600--Sobic009G221701 Sobic010G149900 Sobic010G149900 Sobic006G242600--Sobic010G149900 Sobic006G242600--Sobic010G217466 Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic006G242600--Sobic006G214101 Sobic006G242600--Sobic005G106800 Sobic002G410050 Sobic002G410050 Sobic006G242600--Sobic002G410050 Sobic002G149550 Sobic002G149550 Sobic006G242600--Sobic002G149550 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic006G242600--Sobic002G429200 Sobic001G065400--Sobic002G426600 Sobic002G315450 Sobic002G315450 Sobic001G065400--Sobic002G315450 Sobic001G065400--Sobic001G004901 Sobic010G184201 Sobic010G184201 Sobic001G065400--Sobic010G184201 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic001G065400--Sobic002G262500 Sobic001G065400--Sobic002G427201 Sobic001G065400--Sobic002G189350 Sobic004G045100 Sobic004G045100 Sobic001G065400--Sobic004G045100 Sobic001G104050 Sobic001G104050 Sobic001G065400--Sobic001G104050 Sobic009G221701--Sobic010G217466 Sobic009G221701--Sobic002G149550 Sobic009G221701--Sobic006G242600 Sobic009G221701--Sobic002G429200 Sobic009G221701--Sobic003G396400 Sobic009G221701--Sobic005G106800 Sobic003G299400 Sobic003G299400 Sobic009G221701--Sobic003G299400 Sobic002G285950 Sobic002G285950 Sobic009G221701--Sobic002G285950 Sobic006G116600 Sobic006G116600 Sobic009G221701--Sobic006G116600 Sobic003G396400--Sobic010G149900 Sobic003G396400--Sobic006G242600 Sobic003G396400--Sobic002G410050 Sobic003G396400--Sobic006G214101 Sobic003G396400--Sobic005G106800 Sobic009G165050 Sobic009G165050 Sobic003G396400--Sobic009G165050 Sobic003G396400--Sobic009G221701 Sobic003G396400--Sobic010G217466 Sobic007G056400 Sobic007G056400 Sobic003G396400--Sobic007G056400 Sobic005G230600 Sobic005G230600 Sobic002G189350--Sobic005G230600 Sobic002G189350--Sobic002G429200 Sobic002G375600 Sobic002G375600 Sobic002G189350--Sobic002G375600 Sobic003G292800 Sobic003G292800 Sobic002G189350--Sobic003G292800 Sobic004G071401 Sobic004G071401 Sobic002G189350--Sobic004G071401 Sobic002G189350--Sobic005G106800 Sobic002G189350--Sobic009G221701 Sobic002G189350--Sobic003G299400 Sobic002G189350--Sobic006G242600 Sobic002G427201--Sobic002G262500 Sobic001G396550 Sobic001G396550 Sobic002G427201--Sobic001G396550 Sobic002G427201--Sobic006G242600 Sobic002G427201--Sobic001G004901 Sobic002G427201--Sobic003G396400 Sobic002G427201--Sobic010G217466 Sobic002G427201--Sobic002G375600 Sobic002G427201--Sobic002G429200 Sobic002G427201--Sobic009G221701 Sobic010G217466--Sobic009G221701 Sobic010G217466--Sobic002G149550 Sobic010G217466--Sobic006G242600 Sobic010G217466--Sobic003G396400 Sobic010G217466--Sobic002G429200 Sobic010G217466--Sobic006G116600 Sobic010G217466--Sobic002G285950 Sobic010G217466--Sobic010G149900 Sobic001G378150 Sobic001G378150 Sobic010G217466--Sobic001G378150 Sobic001G004901--Sobic002G427201 Sobic001G004901--Sobic002G262500 Sobic001G004901--Sobic003G396400 Sobic001G004901--Sobic003G292800 Sobic001G004901--Sobic002G375600 Sobic010G183900 Sobic010G183900 Sobic001G004901--Sobic010G183900 Sobic001G004901--Sobic002G189350 Sobic001G004901--Sobic001G065400 Sobic004G341500 Sobic004G341500 Sobic001G004901--Sobic004G341500 Sobic005G106800--Sobic003G299400 Sobic005G106800--Sobic009G165050 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic005G106800--Sobic004G351866 Sobic004G325766 Sobic004G325766 Sobic005G106800--Sobic004G325766 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic005G106800--Sobic003G357000 Sobic003G045800 Sobic003G045800 Sobic005G106800--Sobic003G045800 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic005G106800--Sobic010G275550 Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic005G106800--Sobic010G014600 Sobic005G106800--Sobic006G214101
Octagon: transcription factors


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