Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G299400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q656
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G106800 - -
2 Sobic.003G357000 - -
3 Sobic.004G351866 - -
4 Sobic.009G165050 - -
5 Sobic.002G205201 - -
6 Sobic.010G275550 - -
7 Sobic.003G045800 - -
8 Sobic.008G023500 expressed protein -
9 Sobic.004G325766 - -
10 Sobic.007G072901 - -
11 Sobic.007G152200 cytokinesis negative regulator RCP1, putative, expressed -
12 Sobic.004G330500 expressed protein -
13 Sobic.005G189400 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.009G164200 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11252: histone H2B
15 Sobic.006G185400 - -
16 Sobic.002G410050 - -
17 Sobic.002G037000 ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
18 Sobic.006G209100 - -
19 Sobic.005G037500 expressed protein -
20 Sobic.010G231400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G299400 Sobic003G299400 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic003G299400--Sobic005G106800 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic003G299400--Sobic003G357000 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic003G299400--Sobic004G351866 Sobic009G165050 Sobic009G165050 Sobic003G299400--Sobic009G165050 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic003G299400--Sobic002G205201 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic003G299400--Sobic010G275550 Sobic003G045800 Sobic003G045800 Sobic003G299400--Sobic003G045800 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic003G299400--Sobic008G023500 Sobic004G325766 Sobic004G325766 Sobic003G299400--Sobic004G325766 Sobic005G106800--Sobic003G299400 Sobic005G106800--Sobic009G165050 Sobic005G106800--Sobic004G351866 Sobic005G106800--Sobic004G325766 Sobic005G106800--Sobic003G357000 Sobic005G106800--Sobic003G045800 Sobic005G106800--Sobic010G275550 Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic005G106800--Sobic010G014600 Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic005G106800--Sobic006G214101 Sobic003G357000--Sobic008G023500 Sobic003G357000--Sobic004G351866 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic003G357000--Sobic006G185400 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic003G357000--Sobic004G330500 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic003G357000--Sobic005G189400 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic003G357000--Sobic009G164200 Sobic003G357000--Sobic002G205201 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic003G357000--Sobic001G361500 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic003G357000--Sobic006G209100 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic004G351866--Sobic007G072901 Sobic004G351866--Sobic008G023500 Sobic004G351866--Sobic003G357000 Sobic004G351866--Sobic004G330500 Sobic004G351866--Sobic005G189400 Sobic004G351866--Sobic006G185400 Sobic002G037000 Sobic002G037000 Sobic004G351866--Sobic002G037000 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic004G351866--Sobic005G037500 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic004G351866--Sobic007G152200 Sobic009G165050--Sobic004G351866 Sobic009G165050--Sobic005G106800 Sobic009G165050--Sobic003G299400 Sobic002G410050 Sobic002G410050 Sobic009G165050--Sobic002G410050 Sobic009G165050--Sobic010G014600 Sobic009G165050--Sobic007G152200 Sobic009G165050--Sobic005G189400 Sobic009G165050--Sobic007G072901 Sobic009G165050--Sobic004G330500 Sobic002G205201--Sobic006G185400 Sobic002G205201--Sobic004G330500 Sobic002G205201--Sobic005G189400 Sobic002G205201--Sobic010G275550 Sobic002G205201--Sobic007G152200 Sobic002G205201--Sobic001G361500 Sobic002G205201--Sobic006G209100 Sobic002G205201--Sobic008G023500 Sobic002G205201--Sobic005G037500 Sobic010G275550--Sobic002G205201 Sobic010G275550--Sobic004G330500 Sobic010G275550--Sobic006G185400 Sobic010G275550--Sobic005G189400 Sobic010G275550--Sobic002G037000 Sobic010G275550--Sobic005G037500 Sobic010G275550--Sobic008G023500 Sobic010G275550--Sobic007G152200 Sobic010G275550--Sobic006G209100 Sobic003G045800--Sobic008G023500 Sobic003G045800--Sobic007G072901 Sobic003G045800--Sobic007G152200 Sobic003G045800--Sobic005G189400 Sobic003G045800--Sobic009G164200 Sobic003G045800--Sobic004G351866 Sobic003G045800--Sobic004G330500 Sobic003G045800--Sobic010G014600 Sobic003G045800--Sobic006G185400 Sobic008G023500--Sobic006G185400 Sobic008G023500--Sobic004G330500 Sobic008G023500--Sobic005G189400 Sobic008G023500--Sobic009G164200 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic008G023500--Sobic003G245700 Sobic008G023500--Sobic002G205201 Sobic008G023500--Sobic007G152200 Sobic008G023500--Sobic006G209100 Sobic008G023500--Sobic001G361500 Sobic004G325766--Sobic007G152200 Sobic004G325766--Sobic005G189400 Sobic004G325766--Sobic004G330500 Sobic004G325766--Sobic010G014600 Sobic004G325766--Sobic006G185400 Sobic010G231400 Sobic010G231400 Sobic004G325766--Sobic010G231400 Sobic004G325766--Sobic009G164200 Sobic004G325766--Sobic006G209100 Sobic004G325766--Sobic002G205201
Octagon: transcription factors


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