Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G045800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q1B0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G023500 expressed protein -
2 Sobic.007G072901 - -
3 Sobic.007G152200 cytokinesis negative regulator RCP1, putative, expressed -
4 Sobic.005G189400 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
5 Sobic.009G164200 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11252: histone H2B
6 Sobic.004G351866 - -
7 Sobic.004G330500 expressed protein -
8 Sobic.010G014600 aspartic protease, putative, expressed -
9 Sobic.006G185400 - -
10 Sobic.002G037000 ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
11 Sobic.003G245700 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G090201 - -
13 Sobic.010G275550 - -
14 Sobic.003G357000 - -
15 Sobic.005G037500 expressed protein -
16 Sobic.002G205201 - -
17 Sobic.004G325766 - -
18 Sobic.006G209100 - -
19 Sobic.001G361500 expressed protein -
20 Sobic.001G172900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G045800 Sobic003G045800 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic003G045800--Sobic008G023500 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic003G045800--Sobic007G072901 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic003G045800--Sobic007G152200 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic003G045800--Sobic005G189400 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic003G045800--Sobic009G164200 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic003G045800--Sobic004G351866 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic003G045800--Sobic004G330500 Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic003G045800--Sobic010G014600 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic003G045800--Sobic006G185400 Sobic008G023500--Sobic006G185400 Sobic008G023500--Sobic004G330500 Sobic008G023500--Sobic005G189400 Sobic008G023500--Sobic009G164200 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic008G023500--Sobic003G245700 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic008G023500--Sobic002G205201 Sobic008G023500--Sobic007G152200 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic008G023500--Sobic006G209100 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic008G023500--Sobic001G361500 Sobic007G072901--Sobic004G351866 Sobic007G072901--Sobic008G023500 Sobic007G072901--Sobic005G189400 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic007G072901--Sobic006G090201 Sobic007G072901--Sobic003G245700 Sobic007G072901--Sobic004G330500 Sobic007G072901--Sobic006G185400 Sobic007G072901--Sobic007G152200 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic007G072901--Sobic003G357000 Sobic007G152200--Sobic004G330500 Sobic007G152200--Sobic005G189400 Sobic007G152200--Sobic006G185400 Sobic007G152200--Sobic002G205201 Sobic007G152200--Sobic001G361500 Sobic007G152200--Sobic006G209100 Sobic007G152200--Sobic008G023500 Sobic007G152200--Sobic009G164200 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic007G152200--Sobic005G037500 Sobic005G189400--Sobic004G330500 Sobic005G189400--Sobic006G185400 Sobic005G189400--Sobic007G152200 Sobic005G189400--Sobic002G205201 Sobic005G189400--Sobic001G361500 Sobic005G189400--Sobic006G209100 Sobic005G189400--Sobic008G023500 Sobic005G189400--Sobic003G245700 Sobic005G189400--Sobic006G090201 Sobic009G164200--Sobic004G330500 Sobic009G164200--Sobic006G185400 Sobic009G164200--Sobic008G023500 Sobic009G164200--Sobic005G189400 Sobic009G164200--Sobic001G361500 Sobic009G164200--Sobic006G209100 Sobic009G164200--Sobic007G152200 Sobic009G164200--Sobic002G205201 Sobic009G164200--Sobic005G037500 Sobic004G351866--Sobic007G072901 Sobic004G351866--Sobic008G023500 Sobic004G351866--Sobic003G357000 Sobic004G351866--Sobic004G330500 Sobic004G351866--Sobic005G189400 Sobic004G351866--Sobic006G185400 Sobic002G037000 Sobic002G037000 Sobic004G351866--Sobic002G037000 Sobic004G351866--Sobic005G037500 Sobic004G351866--Sobic007G152200 Sobic004G330500--Sobic005G189400 Sobic004G330500--Sobic006G185400 Sobic004G330500--Sobic007G152200 Sobic004G330500--Sobic002G205201 Sobic004G330500--Sobic001G361500 Sobic004G330500--Sobic006G209100 Sobic004G330500--Sobic008G023500 Sobic004G330500--Sobic005G037500 Sobic004G330500--Sobic006G090201 Sobic010G014600--Sobic005G189400 Sobic010G014600--Sobic004G330500 Sobic010G014600--Sobic006G090201 Sobic010G014600--Sobic007G152200 Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic010G014600--Sobic006G214101 Sobic010G014600--Sobic006G185400 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic010G014600--Sobic010G275550 Sobic004G325766 Sobic004G325766 Sobic010G014600--Sobic004G325766 Sobic004G072950 Sobic004G072950 Sobic010G014600--Sobic004G072950 Sobic006G185400--Sobic004G330500 Sobic006G185400--Sobic005G189400 Sobic006G185400--Sobic001G361500 Sobic006G185400--Sobic007G152200 Sobic006G185400--Sobic002G205201 Sobic006G185400--Sobic006G209100 Sobic006G185400--Sobic008G023500 Sobic006G185400--Sobic005G037500 Sobic006G185400--Sobic009G164200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.