Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G014600.1
Synonym Sb10g001450
Functional annotation aspartic protease, putative, expressed
UniProt C5Z2W1
Pfam PF14541 PF14543
Panther DB PTHR13683 PTHR13683:SF330
NCBI CDD KOG1339; Aspartyl protease
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0004190aspartic-type endopeptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G10770 : Eukaryotic aspartyl protease family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g02780.1 : aspartic protease, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7D02G048000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G189400 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.004G330500 expressed protein -
3 Sobic.006G090201 - -
4 Sobic.007G152200 cytokinesis negative regulator RCP1, putative, expressed -
5 Sobic.006G214101 - -
6 Sobic.006G185400 - -
7 Sobic.010G275550 - -
8 Sobic.004G325766 - -
9 Sobic.004G072950 - -
10 Sobic.009G164200 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11252: histone H2B
11 Sobic.002G205201 - -
12 Sobic.006G209100 - -
13 Sobic.001G361500 expressed protein -
14 Sobic.005G037500 expressed protein -
15 Sobic.003G245700 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.007G072901 - -
17 Sobic.008G023500 expressed protein -
18 Sobic.002G037000 ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.003G045800 - -
20 Sobic.003G178200 tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic010G014600--Sobic005G189400 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic010G014600--Sobic004G330500 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic010G014600--Sobic006G090201 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic010G014600--Sobic007G152200 Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic010G014600--Sobic006G214101 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic010G014600--Sobic006G185400 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic010G014600--Sobic010G275550 Sobic004G325766 Sobic004G325766 Sobic010G014600--Sobic004G325766 Sobic004G072950 Sobic004G072950 Sobic010G014600--Sobic004G072950 Sobic005G189400--Sobic004G330500 Sobic005G189400--Sobic006G185400 Sobic005G189400--Sobic007G152200 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic005G189400--Sobic002G205201 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic005G189400--Sobic001G361500 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic005G189400--Sobic006G209100 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic005G189400--Sobic008G023500 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic005G189400--Sobic003G245700 Sobic005G189400--Sobic006G090201 Sobic004G330500--Sobic005G189400 Sobic004G330500--Sobic006G185400 Sobic004G330500--Sobic007G152200 Sobic004G330500--Sobic002G205201 Sobic004G330500--Sobic001G361500 Sobic004G330500--Sobic006G209100 Sobic004G330500--Sobic008G023500 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic004G330500--Sobic005G037500 Sobic004G330500--Sobic006G090201 Sobic006G090201--Sobic005G189400 Sobic006G090201--Sobic004G330500 Sobic006G090201--Sobic006G185400 Sobic006G090201--Sobic007G152200 Sobic006G090201--Sobic006G209100 Sobic006G090201--Sobic003G245700 Sobic006G090201--Sobic001G361500 Sobic006G090201--Sobic008G023500 Sobic006G090201--Sobic002G205201 Sobic007G152200--Sobic004G330500 Sobic007G152200--Sobic005G189400 Sobic007G152200--Sobic006G185400 Sobic007G152200--Sobic002G205201 Sobic007G152200--Sobic001G361500 Sobic007G152200--Sobic006G209100 Sobic007G152200--Sobic008G023500 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic007G152200--Sobic009G164200 Sobic007G152200--Sobic005G037500 Sobic006G214101--Sobic010G014600 Sobic007G056400 Sobic007G056400 Sobic006G214101--Sobic007G056400 Sobic009G165050 Sobic009G165050 Sobic006G214101--Sobic009G165050 Sobic006G214101--Sobic004G072950 Sobic010G149900 Sobic010G149900 Sobic006G214101--Sobic010G149900 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic006G214101--Sobic005G106800 Sobic006G214101--Sobic004G325766 Sobic003G045800 Sobic003G045800 Sobic006G214101--Sobic003G045800 Sobic002G004400 Sobic002G004400 Sobic006G214101--Sobic002G004400 Sobic006G185400--Sobic004G330500 Sobic006G185400--Sobic005G189400 Sobic006G185400--Sobic001G361500 Sobic006G185400--Sobic007G152200 Sobic006G185400--Sobic002G205201 Sobic006G185400--Sobic006G209100 Sobic006G185400--Sobic008G023500 Sobic006G185400--Sobic005G037500 Sobic006G185400--Sobic009G164200 Sobic010G275550--Sobic002G205201 Sobic010G275550--Sobic004G330500 Sobic010G275550--Sobic006G185400 Sobic010G275550--Sobic005G189400 Sobic002G037000 Sobic002G037000 Sobic010G275550--Sobic002G037000 Sobic010G275550--Sobic005G037500 Sobic010G275550--Sobic008G023500 Sobic010G275550--Sobic007G152200 Sobic010G275550--Sobic006G209100 Sobic004G325766--Sobic007G152200 Sobic004G325766--Sobic005G189400 Sobic004G325766--Sobic004G330500 Sobic004G325766--Sobic010G014600 Sobic004G325766--Sobic006G185400 Sobic010G231400 Sobic010G231400 Sobic004G325766--Sobic010G231400 Sobic004G325766--Sobic009G164200 Sobic004G325766--Sobic006G209100 Sobic004G325766--Sobic002G205201 Sobic004G072950--Sobic010G014600 Sobic010G058650 Sobic010G058650 Sobic004G072950--Sobic010G058650 Sobic004G072950--Sobic006G214101 Sobic004G072950--Sobic010G275550 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic004G072950--Sobic003G343100 Sobic006G201200 Sobic006G201200 Sobic004G072950--Sobic006G201200 Sobic004G072950--Sobic005G106800 Sobic004G072950--Sobic005G189400 Sobic004G072950--Sobic004G330500
Octagon: transcription factors


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