Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G214101.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RFG0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G014600 aspartic protease, putative, expressed -
2 Sobic.007G056400 vacuolar ATP synthase subunit D 1, putative, expressed K02149: ATPeV1D, V-type H+-transporting ATPase subunit D
3 Sobic.009G165050 - -
4 Sobic.004G072950 - -
5 Sobic.010G149900 - -
6 Sobic.005G106800 - -
7 Sobic.004G325766 - -
8 Sobic.003G045800 - -
9 Sobic.002G004400 expressed protein -
10 Sobic.005G189400 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
11 Sobic.002G410050 - -
12 Sobic.007G072901 - -
13 Sobic.004G330500 expressed protein -
14 Sobic.004G351866 - -
15 Sobic.007G152200 cytokinesis negative regulator RCP1, putative, expressed -
16 Sobic.006G090201 - -
17 Sobic.006G153550 - -
18 Sobic.003G299400 - -
19 Sobic.006G185400 - -
20 Sobic.009G164200 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11252: histone H2B


Gene co-expression network
sample Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic006G214101--Sobic010G014600 Sobic007G056400 Sobic007G056400 Sobic006G214101--Sobic007G056400 Sobic009G165050 Sobic009G165050 Sobic006G214101--Sobic009G165050 Sobic004G072950 Sobic004G072950 Sobic006G214101--Sobic004G072950 Sobic010G149900 Sobic010G149900 Sobic006G214101--Sobic010G149900 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic006G214101--Sobic005G106800 Sobic004G325766 Sobic004G325766 Sobic006G214101--Sobic004G325766 Sobic003G045800 Sobic003G045800 Sobic006G214101--Sobic003G045800 Sobic002G004400 Sobic002G004400 Sobic006G214101--Sobic002G004400 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic010G014600--Sobic005G189400 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic010G014600--Sobic004G330500 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic010G014600--Sobic006G090201 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic010G014600--Sobic007G152200 Sobic010G014600--Sobic006G214101 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic010G014600--Sobic006G185400 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic010G014600--Sobic010G275550 Sobic010G014600--Sobic004G325766 Sobic010G014600--Sobic004G072950 Sobic007G056400--Sobic006G214101 Sobic007G056400--Sobic010G014600 Sobic007G056400--Sobic005G106800 Sobic007G056400--Sobic009G165050 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic007G056400--Sobic007G072901 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic007G056400--Sobic003G357000 Sobic007G056400--Sobic004G325766 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic007G056400--Sobic004G351866 Sobic007G056400--Sobic005G189400 Sobic009G165050--Sobic004G351866 Sobic009G165050--Sobic005G106800 Sobic003G299400 Sobic003G299400 Sobic009G165050--Sobic003G299400 Sobic002G410050 Sobic002G410050 Sobic009G165050--Sobic002G410050 Sobic009G165050--Sobic010G014600 Sobic009G165050--Sobic007G152200 Sobic009G165050--Sobic005G189400 Sobic009G165050--Sobic007G072901 Sobic009G165050--Sobic004G330500 Sobic004G072950--Sobic010G014600 Sobic010G058650 Sobic010G058650 Sobic004G072950--Sobic010G058650 Sobic004G072950--Sobic006G214101 Sobic004G072950--Sobic010G275550 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic004G072950--Sobic003G343100 Sobic006G201200 Sobic006G201200 Sobic004G072950--Sobic006G201200 Sobic004G072950--Sobic005G106800 Sobic004G072950--Sobic005G189400 Sobic004G072950--Sobic004G330500 Sobic003G396400 Sobic003G396400 Sobic010G149900--Sobic003G396400 Sobic010G149900--Sobic006G214101 Sobic010G149900--Sobic002G410050 Sobic010G149900--Sobic005G106800 Sobic006G153550 Sobic006G153550 Sobic010G149900--Sobic006G153550 Sobic006G242600 Sobic006G242600 Sobic010G149900--Sobic006G242600 Sobic010G149900--Sobic009G165050 Sobic010G149900--Sobic010G014600 Sobic001G229401 Sobic001G229401 Sobic010G149900--Sobic001G229401 Sobic005G106800--Sobic003G299400 Sobic005G106800--Sobic009G165050 Sobic005G106800--Sobic004G351866 Sobic005G106800--Sobic004G325766 Sobic005G106800--Sobic003G357000 Sobic005G106800--Sobic003G045800 Sobic005G106800--Sobic010G275550 Sobic005G106800--Sobic010G014600 Sobic005G106800--Sobic006G214101 Sobic004G325766--Sobic007G152200 Sobic004G325766--Sobic005G189400 Sobic004G325766--Sobic004G330500 Sobic004G325766--Sobic010G014600 Sobic004G325766--Sobic006G185400 Sobic010G231400 Sobic010G231400 Sobic004G325766--Sobic010G231400 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic004G325766--Sobic009G164200 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic004G325766--Sobic006G209100 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic004G325766--Sobic002G205201 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic003G045800--Sobic008G023500 Sobic003G045800--Sobic007G072901 Sobic003G045800--Sobic007G152200 Sobic003G045800--Sobic005G189400 Sobic003G045800--Sobic009G164200 Sobic003G045800--Sobic004G351866 Sobic003G045800--Sobic004G330500 Sobic003G045800--Sobic010G014600 Sobic003G045800--Sobic006G185400 Sobic002G004400--Sobic010G014600 Sobic002G004400--Sobic006G090201 Sobic002G004400--Sobic007G072901 Sobic002G004400--Sobic005G189400 Sobic002G004400--Sobic004G330500 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic002G004400--Sobic005G037500 Sobic002G004400--Sobic007G152200 Sobic002G004400--Sobic006G185400 Sobic002G004400--Sobic003G343100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.