Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G178200.1
Synonym Sb03g022970
Functional annotation tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed
UniProt C5XM78
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G37400 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g34770.1 : tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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15 Sobic.010G275550 - -
16 Sobic.003G343100 expressed protein -
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18 Sobic.009G010800 expressed protein -
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20 Sobic.003G357000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G178200 Sobic003G178200 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic003G178200--Sobic003G245700 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic003G178200--Sobic005G189400 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic003G178200--Sobic004G330500 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic003G178200--Sobic006G185400 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic003G178200--Sobic008G023500 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic003G178200--Sobic006G090201 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic003G178200--Sobic007G152200 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic003G178200--Sobic001G361500 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic003G178200--Sobic002G205201 Sobic003G245700--Sobic003G178200 Sobic003G245700--Sobic005G189400 Sobic003G245700--Sobic006G185400 Sobic003G245700--Sobic004G330500 Sobic003G245700--Sobic008G023500 Sobic003G245700--Sobic006G090201 Sobic003G245700--Sobic002G205201 Sobic003G245700--Sobic007G152200 Sobic003G245700--Sobic001G361500 Sobic005G189400--Sobic004G330500 Sobic005G189400--Sobic006G185400 Sobic005G189400--Sobic007G152200 Sobic005G189400--Sobic002G205201 Sobic005G189400--Sobic001G361500 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic005G189400--Sobic006G209100 Sobic005G189400--Sobic008G023500 Sobic005G189400--Sobic003G245700 Sobic005G189400--Sobic006G090201 Sobic004G330500--Sobic005G189400 Sobic004G330500--Sobic006G185400 Sobic004G330500--Sobic007G152200 Sobic004G330500--Sobic002G205201 Sobic004G330500--Sobic001G361500 Sobic004G330500--Sobic006G209100 Sobic004G330500--Sobic008G023500 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic004G330500--Sobic005G037500 Sobic004G330500--Sobic006G090201 Sobic006G185400--Sobic004G330500 Sobic006G185400--Sobic005G189400 Sobic006G185400--Sobic001G361500 Sobic006G185400--Sobic007G152200 Sobic006G185400--Sobic002G205201 Sobic006G185400--Sobic006G209100 Sobic006G185400--Sobic008G023500 Sobic006G185400--Sobic005G037500 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic006G185400--Sobic009G164200 Sobic008G023500--Sobic006G185400 Sobic008G023500--Sobic004G330500 Sobic008G023500--Sobic005G189400 Sobic008G023500--Sobic009G164200 Sobic008G023500--Sobic003G245700 Sobic008G023500--Sobic002G205201 Sobic008G023500--Sobic007G152200 Sobic008G023500--Sobic006G209100 Sobic008G023500--Sobic001G361500 Sobic006G090201--Sobic005G189400 Sobic006G090201--Sobic004G330500 Sobic006G090201--Sobic006G185400 Sobic006G090201--Sobic007G152200 Sobic006G090201--Sobic006G209100 Sobic006G090201--Sobic003G245700 Sobic006G090201--Sobic001G361500 Sobic006G090201--Sobic008G023500 Sobic006G090201--Sobic002G205201 Sobic007G152200--Sobic004G330500 Sobic007G152200--Sobic005G189400 Sobic007G152200--Sobic006G185400 Sobic007G152200--Sobic002G205201 Sobic007G152200--Sobic001G361500 Sobic007G152200--Sobic006G209100 Sobic007G152200--Sobic008G023500 Sobic007G152200--Sobic009G164200 Sobic007G152200--Sobic005G037500 Sobic001G361500--Sobic006G185400 Sobic001G361500--Sobic004G330500 Sobic001G361500--Sobic005G189400 Sobic001G361500--Sobic006G209100 Sobic001G361500--Sobic002G205201 Sobic001G361500--Sobic007G152200 Sobic001G361500--Sobic009G164200 Sobic001G361500--Sobic008G023500 Sobic001G361500--Sobic005G037500 Sobic002G205201--Sobic006G185400 Sobic002G205201--Sobic004G330500 Sobic002G205201--Sobic005G189400 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic002G205201--Sobic010G275550 Sobic002G205201--Sobic007G152200 Sobic002G205201--Sobic001G361500 Sobic002G205201--Sobic006G209100 Sobic002G205201--Sobic008G023500 Sobic002G205201--Sobic005G037500
Octagon: transcription factors


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