Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G228500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QKF5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
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cDNA sequences
Sobic.001G228500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G160300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pyrophosphate--fructose 6-phosphate 1-phosphotransferase subunit alpha, putative, expressed K00895: pfp, diphosphate-dependent phosphofructokinase
2 Sobic.010G187950 - -
3 Sobic.004G068600 cytochrome P450 71D10, putative, expressed -
4 Sobic.009G183650 - -
5 Sobic.002G043201 - -
6 Sobic.010G019500 cytochrome P450 86A1, putative, expressed -
7 Sobic.010G042300 DTA2, putative, expressed -
8 Sobic.006G268100 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
9 Sobic.007G173400 - -
10 Sobic.004G347833 - -
11 Sobic.007G187500 - -
12 Sobic.005G110553 - -
13 Sobic.004G074400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
14 Sobic.002G036300 expressed protein -
15 Sobic.004G267650 - -
16 Sobic.003G304000 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
17 Sobic.002G309300 beta-expansin precursor, putative, expressed -
18 Sobic.007G183600 expressed protein -
19 Sobic.001G455466 - -
20 Sobic.002G208700 glutamate receptor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant


Gene co-expression network
sample Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic002G160300 Sobic002G160300 Sobic001G228500--Sobic002G160300 Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic001G228500--Sobic010G187950 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic001G228500--Sobic004G068600 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic001G228500--Sobic009G183650 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic001G228500--Sobic002G043201 Sobic010G019500 Sobic010G019500 Sobic001G228500--Sobic010G019500 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic001G228500--Sobic010G042300 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic001G228500--Sobic006G268100 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G228500--Sobic007G173400 Sobic002G160300--Sobic001G228500 Sobic007G187500 Sobic007G187500 Sobic002G160300--Sobic007G187500 Sobic002G099932 Sobic002G099932 Sobic002G160300--Sobic002G099932 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic002G160300--Sobic004G074400 Sobic002G160300--Sobic004G068600 Sobic009G181000 Sobic009G181000 Sobic002G160300--Sobic009G181000 Sobic009G180900 Sobic009G180900 Sobic002G160300--Sobic009G180900 Sobic002G321700 Sobic002G321700 Sobic002G160300--Sobic002G321700 Sobic008G147600 Sobic008G147600 Sobic002G160300--Sobic008G147600 Sobic010G187950--Sobic001G228500 Sobic007G224700 Sobic007G224700 Sobic010G187950--Sobic007G224700 Sobic010G187950--Sobic002G043201 Sobic010G015400 Sobic010G015400 Sobic010G187950--Sobic010G015400 Sobic008G153300 Sobic008G153300 Sobic010G187950--Sobic008G153300 Sobic004G167500 Sobic004G167500 Sobic010G187950--Sobic004G167500 Sobic002G426201 Sobic002G426201 Sobic010G187950--Sobic002G426201 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic010G187950--Sobic002G215600 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic010G187950--Sobic002G274000 Sobic004G068600--Sobic010G019500 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic004G068600--Sobic004G267400 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic004G068600--Sobic007G183600 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic004G068600--Sobic004G315400 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic004G068600--Sobic004G072201 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic004G068600--Sobic002G374000 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic004G068600--Sobic008G103400 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic004G068600--Sobic001G383200 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic004G068600--Sobic001G424650 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic009G183650--Sobic001G334400 Sobic009G183650--Sobic001G424650 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic009G183650--Sobic002G110600 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic009G183650--Sobic005G110553 Sobic009G183650--Sobic010G019500 Sobic009G183650--Sobic004G072201 Sobic009G183650--Sobic004G068600 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic009G183650--Sobic009G088300 Sobic009G183650--Sobic002G274000 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic002G043201--Sobic001G208166 Sobic002G043201--Sobic010G187950 Sobic002G043201--Sobic001G228500 Sobic003G079600 Sobic003G079600 Sobic002G043201--Sobic003G079600 Sobic010G168100 Sobic010G168100 Sobic002G043201--Sobic010G168100 Sobic002G336500 Sobic002G336500 Sobic002G043201--Sobic002G336500 Sobic007G010400 Sobic007G010400 Sobic002G043201--Sobic007G010400 Sobic003G337900 Sobic003G337900 Sobic002G043201--Sobic003G337900 Sobic003G071800 Sobic003G071800 Sobic002G043201--Sobic003G071800 Sobic010G019500--Sobic004G068600 Sobic010G019500--Sobic002G110600 Sobic010G019500--Sobic009G183650 Sobic010G019500--Sobic008G103400 Sobic010G019500--Sobic004G315400 Sobic010G019500--Sobic007G183600 Sobic010G019500--Sobic001G424650 Sobic010G019500--Sobic004G267400 Sobic010G019500--Sobic005G110553 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic010G042300--Sobic006G279100 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic010G042300--Sobic001G090700 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic010G042300--Sobic008G170800 Sobic010G042300--Sobic008G103400 Sobic003G001650 Sobic003G001650 Sobic010G042300--Sobic003G001650 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic010G042300--Sobic002G208700 Sobic010G042300--Sobic001G383200 Sobic010G042300--Sobic004G072201 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic010G042300--Sobic002G309300 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic006G268100--Sobic004G218400 Sobic006G268100--Sobic002G309300 Sobic006G268100--Sobic005G110553 Sobic006G268100--Sobic002G274000 Sobic006G268100--Sobic001G334400 Sobic006G268100--Sobic004G072201 Sobic006G268100--Sobic010G042300 Sobic006G268100--Sobic001G383200 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic006G268100--Sobic006G255200 Sobic004G347833 Sobic004G347833 Sobic007G173400--Sobic004G347833 Sobic001G234766 Sobic001G234766 Sobic007G173400--Sobic001G234766 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic007G173400--Sobic004G272000 Sobic010G160850 Sobic010G160850 Sobic007G173400--Sobic010G160850 Sobic007G173400--Sobic001G228500 Sobic007G173400--Sobic001G208166 Sobic008G064200 Sobic008G064200 Sobic007G173400--Sobic008G064200 Sobic007G173400--Sobic007G187500 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic007G173400--Sobic004G089801
Octagon: transcription factors


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