Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G036300.1
Synonym Sb02g003150
Functional annotation expressed protein
UniProt C6JS04 , C5X9L0
Pfam PF07103
Panther DB PTHR33973 PTHR33973:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G30130 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g05870.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045038
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G111150.1 , HORVU2Hr1G111150.5 , HORVU4Hr1G064410.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G228500 - -
2 Sobic.009G183650 - -
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6 Sobic.010G187950 - -
7 Sobic.002G234800 expressed protein -
8 Sobic.004G221100 uncharacterized protein PA4923, putative, expressed K06966: pyrimidine/purine-5'-nucleotide nucleosidase
9 Sobic.009G079700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G334400 protein kinase, putative, expressed -
11 Sobic.002G043201 - -
12 Sobic.010G042300 DTA2, putative, expressed -
13 Sobic.003G304000 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
14 Sobic.001G424650 - -
15 Sobic.001G208166 - -
16 Sobic.006G268100 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
17 Sobic.001G239000 expressed protein -
18 Sobic.007G075600 pectinesterase, putative, expressed -
19 Sobic.008G103400 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G068600 cytochrome P450 71D10, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G036300 Sobic002G036300 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic002G036300--Sobic001G228500 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic002G036300--Sobic009G183650 Sobic006G109000 Sobic006G109000 Sobic002G036300--Sobic006G109000 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic002G036300--Sobic005G110553 Sobic003G050800 Sobic003G050800 Sobic002G036300--Sobic003G050800 Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic002G036300--Sobic010G187950 Sobic002G234800 Sobic002G234800 Sobic002G036300--Sobic002G234800 Sobic004G221100 Sobic004G221100 Sobic002G036300--Sobic004G221100 Sobic009G079700 Sobic009G079700 Sobic002G036300--Sobic009G079700 Sobic002G160300 Sobic002G160300 Sobic001G228500--Sobic002G160300 Sobic001G228500--Sobic010G187950 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic001G228500--Sobic004G068600 Sobic001G228500--Sobic009G183650 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic001G228500--Sobic002G043201 Sobic010G019500 Sobic010G019500 Sobic001G228500--Sobic010G019500 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic001G228500--Sobic010G042300 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic001G228500--Sobic006G268100 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G228500--Sobic007G173400 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic009G183650--Sobic001G334400 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic009G183650--Sobic001G424650 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic009G183650--Sobic002G110600 Sobic009G183650--Sobic005G110553 Sobic009G183650--Sobic010G019500 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic009G183650--Sobic004G072201 Sobic009G183650--Sobic004G068600 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic009G183650--Sobic009G088300 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic009G183650--Sobic002G274000 Sobic006G109000--Sobic002G234800 Sobic006G109000--Sobic009G183650 Sobic008G192900 Sobic008G192900 Sobic006G109000--Sobic008G192900 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic006G109000--Sobic008G103400 Sobic004G181000 Sobic004G181000 Sobic006G109000--Sobic004G181000 Sobic002G398600 Sobic002G398600 Sobic006G109000--Sobic002G398600 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic006G109000--Sobic003G362800 Sobic006G109000--Sobic001G424650 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic006G109000--Sobic002G001500 Sobic009G122000 Sobic009G122000 Sobic005G110553--Sobic009G122000 Sobic005G110553--Sobic001G424650 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic005G110553--Sobic003G149400 Sobic005G110553--Sobic006G268100 Sobic008G065700 Sobic008G065700 Sobic005G110553--Sobic008G065700 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic005G110553--Sobic004G224000 Sobic005G110553--Sobic001G334400 Sobic005G110553--Sobic009G183650 Sobic007G210200 Sobic007G210200 Sobic005G110553--Sobic007G210200 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic003G050800--Sobic001G367900 Sobic003G050800--Sobic003G149400 Sobic003G050800--Sobic008G065700 Sobic007G010400 Sobic007G010400 Sobic003G050800--Sobic007G010400 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic003G050800--Sobic007G077466 Sobic003G050800--Sobic004G224000 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic003G050800--Sobic007G226000 Sobic003G050800--Sobic002G234800 Sobic003G133700 Sobic003G133700 Sobic003G050800--Sobic003G133700 Sobic010G187950--Sobic001G228500 Sobic007G224700 Sobic007G224700 Sobic010G187950--Sobic007G224700 Sobic010G187950--Sobic002G043201 Sobic010G015400 Sobic010G015400 Sobic010G187950--Sobic010G015400 Sobic008G153300 Sobic008G153300 Sobic010G187950--Sobic008G153300 Sobic004G167500 Sobic004G167500 Sobic010G187950--Sobic004G167500 Sobic002G426201 Sobic002G426201 Sobic010G187950--Sobic002G426201 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic010G187950--Sobic002G215600 Sobic010G187950--Sobic002G274000 Sobic002G234800--Sobic004G181000 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic002G234800--Sobic006G111400 Sobic009G223900 Sobic009G223900 Sobic002G234800--Sobic009G223900 Sobic002G234800--Sobic008G103400 Sobic003G251900 Sobic003G251900 Sobic002G234800--Sobic003G251900 Sobic002G234800--Sobic002G110600 Sobic002G234800--Sobic002G001500 Sobic006G169600 Sobic006G169600 Sobic002G234800--Sobic006G169600 Sobic003G155800 Sobic003G155800 Sobic002G234800--Sobic003G155800 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic004G221100--Sobic004G074400 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic004G221100--Sobic002G208700 Sobic010G201444 Sobic010G201444 Sobic004G221100--Sobic010G201444 Sobic004G091300 Sobic004G091300 Sobic004G221100--Sobic004G091300 Sobic004G221100--Sobic010G042300 Sobic006G280250 Sobic006G280250 Sobic004G221100--Sobic006G280250 Sobic007G075600 Sobic007G075600 Sobic004G221100--Sobic007G075600 Sobic006G103800 Sobic006G103800 Sobic004G221100--Sobic006G103800 Sobic009G180900 Sobic009G180900 Sobic004G221100--Sobic009G180900 Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic009G079700--Sobic010G210400 Sobic009G079700--Sobic005G110553 Sobic009G079700--Sobic001G334400 Sobic009G079700--Sobic006G268100 Sobic009G079700--Sobic002G274000 Sobic004G007200 Sobic004G007200 Sobic009G079700--Sobic004G007200 Sobic009G079700--Sobic009G183650 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic009G079700--Sobic004G343733 Sobic009G079700--Sobic008G153300
Octagon: transcription factors


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