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Transcriptome id Sobic.010G187950.1
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UniProt A0A1W0VTU3
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G228500 - -
2 Sobic.007G224700 expressed protein -
3 Sobic.002G043201 - -
4 Sobic.010G015400 pentatricopeptide, putative, expressed -
5 Sobic.008G153300 RING-H2 finger protein ATL3J, putative, expressed K10663: E3 ubiquitin-protein ligase ATL4
6 Sobic.004G167500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
7 Sobic.002G426201 - -
8 Sobic.002G215600 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G274000 OsSub59 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
10 Sobic.004G089801 - -
11 Sobic.001G079000 - -
12 Sobic.003G438100 expressed protein -
13 Sobic.005G110553 - -
14 Sobic.009G183650 - -
15 Sobic.002G336500 OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G084133 - -
17 Sobic.010G210400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
18 Sobic.002G228300 - -
19 Sobic.001G239000 expressed protein -
20 Sobic.009G122000 Annexin arabidopsis 3(PubMedID : 26320239)@annexin, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic010G187950--Sobic001G228500 Sobic007G224700 Sobic007G224700 Sobic010G187950--Sobic007G224700 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic010G187950--Sobic002G043201 Sobic010G015400 Sobic010G015400 Sobic010G187950--Sobic010G015400 Sobic008G153300 Sobic008G153300 Sobic010G187950--Sobic008G153300 Sobic004G167500 Sobic004G167500 Sobic010G187950--Sobic004G167500 Sobic002G426201 Sobic002G426201 Sobic010G187950--Sobic002G426201 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic010G187950--Sobic002G215600 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic010G187950--Sobic002G274000 Sobic002G160300 Sobic002G160300 Sobic001G228500--Sobic002G160300 Sobic001G228500--Sobic010G187950 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic001G228500--Sobic004G068600 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic001G228500--Sobic009G183650 Sobic001G228500--Sobic002G043201 Sobic010G019500 Sobic010G019500 Sobic001G228500--Sobic010G019500 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic001G228500--Sobic010G042300 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic001G228500--Sobic006G268100 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G228500--Sobic007G173400 Sobic007G224700--Sobic010G015400 Sobic007G224700--Sobic008G153300 Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic007G224700--Sobic004G273550 Sobic007G224700--Sobic010G187950 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic007G224700--Sobic006G118150 Sobic003G438100 Sobic003G438100 Sobic007G224700--Sobic003G438100 Sobic007G224700--Sobic004G167500 Sobic007G224700--Sobic002G215600 Sobic007G224700--Sobic002G274000 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic002G043201--Sobic001G208166 Sobic002G043201--Sobic010G187950 Sobic002G043201--Sobic001G228500 Sobic003G079600 Sobic003G079600 Sobic002G043201--Sobic003G079600 Sobic010G168100 Sobic010G168100 Sobic002G043201--Sobic010G168100 Sobic002G336500 Sobic002G336500 Sobic002G043201--Sobic002G336500 Sobic007G010400 Sobic007G010400 Sobic002G043201--Sobic007G010400 Sobic003G337900 Sobic003G337900 Sobic002G043201--Sobic003G337900 Sobic003G071800 Sobic003G071800 Sobic002G043201--Sobic003G071800 Sobic010G015400--Sobic007G224700 Sobic010G015400--Sobic004G273550 Sobic010G015400--Sobic008G153300 Sobic010G015400--Sobic003G438100 Sobic010G015400--Sobic010G187950 Sobic010G015400--Sobic010G168100 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic010G015400--Sobic005G205100 Sobic010G015400--Sobic002G215600 Sobic009G018100 Sobic009G018100 Sobic010G015400--Sobic009G018100 Sobic008G153300--Sobic002G215600 Sobic008G153300--Sobic007G224700 Sobic008G153300--Sobic010G015400 Sobic008G153300--Sobic010G187950 Sobic008G153300--Sobic004G273550 Sobic008G153300--Sobic004G167500 Sobic008G153300--Sobic003G438100 Sobic009G079700 Sobic009G079700 Sobic008G153300--Sobic009G079700 Sobic007G210200 Sobic007G210200 Sobic008G153300--Sobic007G210200 Sobic003G059500 Sobic003G059500 Sobic004G167500--Sobic003G059500 Sobic004G167500--Sobic002G215600 Sobic006G049000 Sobic006G049000 Sobic004G167500--Sobic006G049000 Sobic004G167500--Sobic010G187950 Sobic003G356500 Sobic003G356500 Sobic004G167500--Sobic003G356500 Sobic004G167500--Sobic008G153300 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic004G167500--Sobic001G071500 Sobic004G167500--Sobic003G438100 Sobic001G468900 Sobic001G468900 Sobic004G167500--Sobic001G468900 Sobic002G426201--Sobic010G187950 Sobic009G160100 Sobic009G160100 Sobic002G426201--Sobic009G160100 Sobic006G138300 Sobic006G138300 Sobic002G426201--Sobic006G138300 Sobic003G067600 Sobic003G067600 Sobic002G426201--Sobic003G067600 Sobic002G228300 Sobic002G228300 Sobic002G426201--Sobic002G228300 Sobic001G454600 Sobic001G454600 Sobic002G426201--Sobic001G454600 Sobic001G061300 Sobic001G061300 Sobic002G426201--Sobic001G061300 Sobic002G426201--Sobic010G015400 Sobic002G426201--Sobic007G224700 Sobic002G215600--Sobic006G049000 Sobic002G215600--Sobic008G153300 Sobic002G215600--Sobic003G059500 Sobic002G215600--Sobic004G167500 Sobic004G045000 Sobic004G045000 Sobic002G215600--Sobic004G045000 Sobic002G215600--Sobic003G356500 Sobic002G215600--Sobic003G438100 Sobic002G215600--Sobic001G468900 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic002G215600--Sobic001G367900 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic002G274000--Sobic004G218400 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic002G274000--Sobic001G334400 Sobic002G274000--Sobic006G268100 Sobic002G274000--Sobic003G067600 Sobic003G001650 Sobic003G001650 Sobic002G274000--Sobic003G001650 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic002G274000--Sobic004G173200 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic002G274000--Sobic005G110553 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic002G274000--Sobic002G309300 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic002G274000--Sobic001G370800
Octagon: transcription factors


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