Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G228300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QCZ6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G067600 receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.005G068000 expressed protein -
3 Sobic.001G239000 expressed protein -
4 Sobic.003G124400 - -
5 Sobic.004G218400 - -
6 Sobic.010G129100 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.009G037050 - -
8 Sobic.008G037300 RCN1 Centroradialis-like1 homogous to TFL1 gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed -
9 Sobic.002G127300 - -
10 Sobic.002G274000 OsSub59 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
11 Sobic.003G174500 - -
12 Sobic.006G138300 EF hand family protein, putative, expressed -
13 Sobic.008G111150 - -
14 Sobic.010G187950 - -
15 Sobic.002G309300 beta-expansin precursor, putative, expressed -
16 Sobic.006G268100 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
17 Sobic.001G370800 - -
18 Sobic.001G261452 - -
19 Sobic.001G061300 - -
20 Sobic.009G088300 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G228300 Sobic002G228300 Sobic003G067600 Sobic003G067600 Sobic002G228300--Sobic003G067600 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic002G228300--Sobic005G068000 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic002G228300--Sobic001G239000 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic002G228300--Sobic003G124400 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic002G228300--Sobic004G218400 Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic002G228300--Sobic010G129100 Sobic009G037050 Sobic009G037050 Sobic002G228300--Sobic009G037050 Sobic008G037300 Sobic008G037300 Sobic002G228300--Sobic008G037300 Sobic002G127300 Sobic002G127300 Sobic002G228300--Sobic002G127300 Sobic003G067600--Sobic004G218400 Sobic003G067600--Sobic002G228300 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic003G067600--Sobic002G274000 Sobic006G138300 Sobic006G138300 Sobic003G067600--Sobic006G138300 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic003G067600--Sobic001G370800 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic003G067600--Sobic001G038700 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic003G067600--Sobic001G334400 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic003G067600--Sobic006G268100 Sobic003G304000 Sobic003G304000 Sobic003G067600--Sobic003G304000 Sobic005G068000--Sobic003G124400 Sobic005G068000--Sobic001G239000 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic005G068000--Sobic003G312800 Sobic005G068000--Sobic008G037300 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic005G068000--Sobic005G027350 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic005G068000--Sobic003G312900 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic005G068000--Sobic002G309300 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic005G068000--Sobic003G375500 Sobic003G174500 Sobic003G174500 Sobic005G068000--Sobic003G174500 Sobic001G239000--Sobic005G068000 Sobic001G239000--Sobic003G124400 Sobic001G239000--Sobic003G312800 Sobic001G239000--Sobic005G027350 Sobic003G312600 Sobic003G312600 Sobic001G239000--Sobic003G312600 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic001G239000--Sobic002G398300 Sobic001G239000--Sobic008G037300 Sobic001G476600 Sobic001G476600 Sobic001G239000--Sobic001G476600 Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic001G239000--Sobic001G079000 Sobic003G124400--Sobic005G068000 Sobic003G124400--Sobic001G079000 Sobic003G124400--Sobic001G239000 Sobic003G124400--Sobic003G375500 Sobic003G124400--Sobic008G037300 Sobic003G124400--Sobic005G027350 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic003G124400--Sobic010G183350 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic003G124400--Sobic009G026600 Sobic003G124400--Sobic003G312800 Sobic004G218400--Sobic002G309300 Sobic004G218400--Sobic001G038700 Sobic004G218400--Sobic006G268100 Sobic004G218400--Sobic001G370800 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic004G218400--Sobic006G255200 Sobic003G001650 Sobic003G001650 Sobic004G218400--Sobic003G001650 Sobic004G218400--Sobic002G274000 Sobic004G218400--Sobic003G067600 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic004G218400--Sobic004G072201 Sobic010G129100--Sobic003G174500 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic010G129100--Sobic009G088300 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic010G129100--Sobic001G261452 Sobic010G129100--Sobic002G127300 Sobic010G133450 Sobic010G133450 Sobic010G129100--Sobic010G133450 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic010G129100--Sobic001G442000 Sobic004G127600 Sobic004G127600 Sobic010G129100--Sobic004G127600 Sobic010G129100--Sobic006G255200 Sobic010G129100--Sobic001G370800 Sobic009G037050--Sobic002G228300 Sobic009G037050--Sobic005G068000 Sobic002G281850 Sobic002G281850 Sobic009G037050--Sobic002G281850 Sobic009G037050--Sobic008G037300 Sobic001G524750 Sobic001G524750 Sobic009G037050--Sobic001G524750 Sobic009G037050--Sobic003G067600 Sobic009G037050--Sobic003G124400 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic009G037050--Sobic001G229850 Sobic009G037050--Sobic004G218400 Sobic008G037300--Sobic005G068000 Sobic008G037300--Sobic009G026600 Sobic008G037300--Sobic002G309300 Sobic008G037300--Sobic003G124400 Sobic008G037300--Sobic001G370800 Sobic008G037300--Sobic005G027350 Sobic008G037300--Sobic004G072201 Sobic008G037300--Sobic001G038700 Sobic008G037300--Sobic001G239000 Sobic002G127300--Sobic006G255200 Sobic002G127300--Sobic002G309300 Sobic002G127300--Sobic010G129100 Sobic002G127300--Sobic004G218400 Sobic002G127300--Sobic001G038700 Sobic002G127300--Sobic001G442000 Sobic002G127300--Sobic001G370800 Sobic002G127300--Sobic001G261452 Sobic002G127300--Sobic009G088300
Octagon: transcription factors


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