Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G037300.1
Synonym ATC, Sb08g003210
Functional annotation RCN1 Centroradialis-like1 homogous to TFL1 gene
contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed
UniProt C5YRS5
Pfam PF01161
Panther DB PTHR11362 PTHR11362:SF13
NCBI CDD KOG3346; Phosphatidylethanolamine binding protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009910; negative regulation of flower development GO:0003712transcription coregulator activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G27550 : centroradialis
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g05470.1 : RCN1 Centroradialis-like1 homogous to TFL1 gene; contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053891 , Zm00025a033490 , Zm00025a029040
Brachypodium KQJ92229
Barley HORVU5Hr1G042230.14 , HORVU5Hr1G042230.15 , HORVU5Hr1G042230.16 , HORVU5Hr1G042230.17 , HORVU5Hr1G042230.10 , HORVU5Hr1G042230.11 , HORVU5Hr1G042230.12 , HORVU5Hr1G042230.13 , HORVU5Hr1G042230.8 , HORVU5Hr1G042230.9 , HORVU5Hr1G042230.6 , HORVU5Hr1G042230.7 , HORVU5Hr1G042230.4 , HORVU5Hr1G042230.5 , HORVU5Hr1G042230.3
Wheat TraesCS5D02G136300 , TraesCS5D02G136300 , TraesCS5A02G128600 , TraesCS5B02G127600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G037300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.006G255200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G037300 Sobic008G037300 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic008G037300--Sobic005G068000 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic008G037300--Sobic009G026600 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic008G037300--Sobic002G309300 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic008G037300--Sobic003G124400 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic008G037300--Sobic001G370800 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic008G037300--Sobic005G027350 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic008G037300--Sobic004G072201 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic008G037300--Sobic001G038700 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic008G037300--Sobic001G239000 Sobic005G068000--Sobic003G124400 Sobic005G068000--Sobic001G239000 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic005G068000--Sobic003G312800 Sobic005G068000--Sobic008G037300 Sobic005G068000--Sobic005G027350 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic005G068000--Sobic003G312900 Sobic005G068000--Sobic002G309300 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic005G068000--Sobic003G375500 Sobic003G174500 Sobic003G174500 Sobic005G068000--Sobic003G174500 Sobic009G026600--Sobic001G370800 Sobic003G063400 Sobic003G063400 Sobic009G026600--Sobic003G063400 Sobic009G026600--Sobic005G027350 Sobic009G026600--Sobic001G038700 Sobic004G250400 Sobic004G250400 Sobic009G026600--Sobic004G250400 Sobic001G001800 Sobic001G001800 Sobic009G026600--Sobic001G001800 Sobic009G026600--Sobic008G037300 Sobic009G026600--Sobic002G309300 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic009G026600--Sobic010G012200 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic002G309300--Sobic004G218400 Sobic002G309300--Sobic001G038700 Sobic002G309300--Sobic004G072201 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic002G309300--Sobic006G255200 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic002G309300--Sobic006G268100 Sobic002G309300--Sobic001G370800 Sobic002G309300--Sobic009G026600 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic002G309300--Sobic001G442000 Sobic002G309300--Sobic008G037300 Sobic003G124400--Sobic005G068000 Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic003G124400--Sobic001G079000 Sobic003G124400--Sobic001G239000 Sobic003G124400--Sobic003G375500 Sobic003G124400--Sobic008G037300 Sobic003G124400--Sobic005G027350 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic003G124400--Sobic010G183350 Sobic003G124400--Sobic009G026600 Sobic003G124400--Sobic003G312800 Sobic001G370800--Sobic009G026600 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic001G370800--Sobic004G173200 Sobic001G370800--Sobic001G038700 Sobic001G370800--Sobic001G442000 Sobic001G370800--Sobic002G309300 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic001G370800--Sobic009G088300 Sobic001G370800--Sobic004G218400 Sobic001G370800--Sobic006G255200 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic001G370800--Sobic003G263900 Sobic005G027350--Sobic009G026600 Sobic005G027350--Sobic003G375500 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic005G027350--Sobic009G074800 Sobic005G027350--Sobic005G068000 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic005G027350--Sobic001G460900 Sobic005G027350--Sobic003G312800 Sobic005G027350--Sobic001G239000 Sobic005G027350--Sobic008G037300 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic005G027350--Sobic003G401700 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic004G072201--Sobic001G383200 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic004G072201--Sobic002G374000 Sobic001G109400 Sobic001G109400 Sobic004G072201--Sobic001G109400 Sobic004G072201--Sobic002G309300 Sobic004G072201--Sobic001G038700 Sobic004G072201--Sobic001G442000 Sobic004G072201--Sobic006G255200 Sobic004G072201--Sobic003G263900 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic004G072201--Sobic007G183600 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic001G038700--Sobic006G157450 Sobic001G038700--Sobic003G263900 Sobic001G038700--Sobic002G309300 Sobic001G038700--Sobic004G218400 Sobic001G038700--Sobic010G012200 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic001G038700--Sobic008G170800 Sobic001G038700--Sobic004G072201 Sobic001G038700--Sobic009G026600 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic001G038700--Sobic008G142200 Sobic001G239000--Sobic005G068000 Sobic001G239000--Sobic003G124400 Sobic001G239000--Sobic003G312800 Sobic001G239000--Sobic005G027350 Sobic003G312600 Sobic003G312600 Sobic001G239000--Sobic003G312600 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic001G239000--Sobic002G398300 Sobic001G239000--Sobic008G037300 Sobic001G476600 Sobic001G476600 Sobic001G239000--Sobic001G476600 Sobic001G239000--Sobic001G079000
Octagon: transcription factors


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