Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G079000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QHT5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G124400 - -
2 Sobic.001G239000 expressed protein -
3 Sobic.009G026600 - -
4 Sobic.005G150501 - -
5 Sobic.003G375500 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G027350 - -
7 Sobic.008G037300 RCN1 Centroradialis-like1 homogous to TFL1 gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed -
8 Sobic.003G401700 - -
9 Sobic.005G068000 expressed protein -
10 Sobic.001G370800 - -
11 Sobic.010G183350 - -
12 Sobic.003G040300 cytochrome P450, putative, expressed -
13 Sobic.010G187950 - -
14 Sobic.002G309300 beta-expansin precursor, putative, expressed -
15 Sobic.001G090700 expressed protein -
16 Sobic.008G128800 RNA pseudouridine synthase, putative, expressed -
17 Sobic.001G454600 expressed protein -
18 Sobic.001G001800 expressed protein -
19 Sobic.004G250400 aluminum-activated malate transporter, putative, expressed -
20 Sobic.006G238900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic001G079000--Sobic003G124400 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic001G079000--Sobic001G239000 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic001G079000--Sobic009G026600 Sobic005G150501 Sobic005G150501 Sobic001G079000--Sobic005G150501 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic001G079000--Sobic003G375500 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic001G079000--Sobic005G027350 Sobic008G037300 Sobic008G037300 Sobic001G079000--Sobic008G037300 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic001G079000--Sobic003G401700 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic001G079000--Sobic005G068000 Sobic003G124400--Sobic005G068000 Sobic003G124400--Sobic001G079000 Sobic003G124400--Sobic001G239000 Sobic003G124400--Sobic003G375500 Sobic003G124400--Sobic008G037300 Sobic003G124400--Sobic005G027350 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic003G124400--Sobic010G183350 Sobic003G124400--Sobic009G026600 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic003G124400--Sobic003G312800 Sobic001G239000--Sobic005G068000 Sobic001G239000--Sobic003G124400 Sobic001G239000--Sobic003G312800 Sobic001G239000--Sobic005G027350 Sobic003G312600 Sobic003G312600 Sobic001G239000--Sobic003G312600 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic001G239000--Sobic002G398300 Sobic001G239000--Sobic008G037300 Sobic001G476600 Sobic001G476600 Sobic001G239000--Sobic001G476600 Sobic001G239000--Sobic001G079000 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic009G026600--Sobic001G370800 Sobic003G063400 Sobic003G063400 Sobic009G026600--Sobic003G063400 Sobic009G026600--Sobic005G027350 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic009G026600--Sobic001G038700 Sobic004G250400 Sobic004G250400 Sobic009G026600--Sobic004G250400 Sobic001G001800 Sobic001G001800 Sobic009G026600--Sobic001G001800 Sobic009G026600--Sobic008G037300 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic009G026600--Sobic002G309300 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic009G026600--Sobic010G012200 Sobic008G128800 Sobic008G128800 Sobic005G150501--Sobic008G128800 Sobic005G150501--Sobic001G079000 Sobic005G150501--Sobic003G124400 Sobic010G160850 Sobic010G160850 Sobic005G150501--Sobic010G160850 Sobic007G133733 Sobic007G133733 Sobic005G150501--Sobic007G133733 Sobic005G150501--Sobic001G239000 Sobic005G150501--Sobic005G068000 Sobic005G150501--Sobic010G183350 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic005G150501--Sobic005G110553 Sobic003G375500--Sobic005G027350 Sobic003G375500--Sobic010G183350 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic003G375500--Sobic009G074800 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic003G375500--Sobic002G067900 Sobic003G375500--Sobic003G124400 Sobic003G375500--Sobic003G401700 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic003G375500--Sobic001G250750 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic003G375500--Sobic003G232600 Sobic003G375500--Sobic009G026600 Sobic005G027350--Sobic009G026600 Sobic005G027350--Sobic003G375500 Sobic005G027350--Sobic009G074800 Sobic005G027350--Sobic005G068000 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic005G027350--Sobic001G460900 Sobic005G027350--Sobic003G312800 Sobic005G027350--Sobic001G239000 Sobic005G027350--Sobic008G037300 Sobic005G027350--Sobic003G401700 Sobic008G037300--Sobic005G068000 Sobic008G037300--Sobic009G026600 Sobic008G037300--Sobic002G309300 Sobic008G037300--Sobic003G124400 Sobic008G037300--Sobic001G370800 Sobic008G037300--Sobic005G027350 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic008G037300--Sobic004G072201 Sobic008G037300--Sobic001G038700 Sobic008G037300--Sobic001G239000 Sobic003G401700--Sobic010G183350 Sobic003G401700--Sobic009G074800 Sobic003G401700--Sobic009G026600 Sobic003G401700--Sobic003G375500 Sobic003G401700--Sobic005G027350 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic003G401700--Sobic009G026700 Sobic003G401700--Sobic001G460900 Sobic004G033650 Sobic004G033650 Sobic003G401700--Sobic004G033650 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic003G401700--Sobic001G090700 Sobic005G068000--Sobic003G124400 Sobic005G068000--Sobic001G239000 Sobic005G068000--Sobic003G312800 Sobic005G068000--Sobic008G037300 Sobic005G068000--Sobic005G027350 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic005G068000--Sobic003G312900 Sobic005G068000--Sobic002G309300 Sobic005G068000--Sobic003G375500 Sobic003G174500 Sobic003G174500 Sobic005G068000--Sobic003G174500
Octagon: transcription factors


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