Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G128800.4,Sobic.008G128800.2
Synonym Sb08g018120
Functional annotation RNA pseudouridine synthase, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R6C9 , A0A1B6PDE3
Pfam PF00849
Panther DB PTHR11079 PTHR11079:SF82
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009982; pseudouridine synthase activity GO:0009451RNA modification GO:0003723RNA binding GO:0001522pseudouridine synthesis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G56345 : Pseudouridine synthase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g37380.1 : RNA pseudouridine synthase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025481
Brachypodium PNT62528 , PNT62527 , PNT62526 , KQJ86339
Barley HORVU5Hr1G023070.4 , HORVU5Hr1G023070.1 , HORVU5Hr1G023070.3 , HORVU5Hr1G023070.2
Wheat TraesCS5D02G101100 , TraesCS5B02G095000 , TraesCS5A02G089000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic008G128800 Sobic008G128800 Sobic005G150501 Sobic005G150501 Sobic008G128800--Sobic005G150501 Sobic010G160850 Sobic010G160850 Sobic008G128800--Sobic010G160850 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic008G128800--Sobic001G239000 Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic008G128800--Sobic001G079000 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic008G128800--Sobic003G124400 Sobic008G065700 Sobic008G065700 Sobic008G128800--Sobic008G065700 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic008G128800--Sobic005G068000 Sobic005G017150 Sobic005G017150 Sobic008G128800--Sobic005G017150 Sobic008G037300 Sobic008G037300 Sobic008G128800--Sobic008G037300 Sobic005G150501--Sobic008G128800 Sobic005G150501--Sobic001G079000 Sobic005G150501--Sobic003G124400 Sobic005G150501--Sobic010G160850 Sobic007G133733 Sobic007G133733 Sobic005G150501--Sobic007G133733 Sobic005G150501--Sobic001G239000 Sobic005G150501--Sobic005G068000 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic005G150501--Sobic010G183350 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic005G150501--Sobic005G110553 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic010G160850--Sobic002G398300 Sobic010G160850--Sobic007G133733 Sobic010G160850--Sobic008G128800 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic010G160850--Sobic003G312800 Sobic010G160850--Sobic005G150501 Sobic010G054400 Sobic010G054400 Sobic010G160850--Sobic010G054400 Sobic010G160850--Sobic001G239000 Sobic002G326300 Sobic002G326300 Sobic010G160850--Sobic002G326300 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic010G160850--Sobic006G248450 Sobic001G239000--Sobic005G068000 Sobic001G239000--Sobic003G124400 Sobic001G239000--Sobic003G312800 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic001G239000--Sobic005G027350 Sobic003G312600 Sobic003G312600 Sobic001G239000--Sobic003G312600 Sobic001G239000--Sobic002G398300 Sobic001G239000--Sobic008G037300 Sobic001G476600 Sobic001G476600 Sobic001G239000--Sobic001G476600 Sobic001G239000--Sobic001G079000 Sobic001G079000--Sobic003G124400 Sobic001G079000--Sobic001G239000 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic001G079000--Sobic009G026600 Sobic001G079000--Sobic005G150501 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic001G079000--Sobic003G375500 Sobic001G079000--Sobic005G027350 Sobic001G079000--Sobic008G037300 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic001G079000--Sobic003G401700 Sobic001G079000--Sobic005G068000 Sobic003G124400--Sobic005G068000 Sobic003G124400--Sobic001G079000 Sobic003G124400--Sobic001G239000 Sobic003G124400--Sobic003G375500 Sobic003G124400--Sobic008G037300 Sobic003G124400--Sobic005G027350 Sobic003G124400--Sobic010G183350 Sobic003G124400--Sobic009G026600 Sobic003G124400--Sobic003G312800 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic008G065700--Sobic003G149400 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic008G065700--Sobic004G224000 Sobic008G065700--Sobic005G110553 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic008G065700--Sobic001G367900 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic008G065700--Sobic003G092150 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic008G065700--Sobic007G226000 Sobic009G122000 Sobic009G122000 Sobic008G065700--Sobic009G122000 Sobic007G210200 Sobic007G210200 Sobic008G065700--Sobic007G210200 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic008G065700--Sobic002G377400 Sobic005G068000--Sobic003G124400 Sobic005G068000--Sobic001G239000 Sobic005G068000--Sobic003G312800 Sobic005G068000--Sobic008G037300 Sobic005G068000--Sobic005G027350 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic005G068000--Sobic003G312900 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic005G068000--Sobic002G309300 Sobic005G068000--Sobic003G375500 Sobic003G174500 Sobic003G174500 Sobic005G068000--Sobic003G174500 Sobic005G017150--Sobic010G160850 Sobic005G017150--Sobic008G128800 Sobic008G046700 Sobic008G046700 Sobic005G017150--Sobic008G046700 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic005G017150--Sobic005G152866 Sobic005G017150--Sobic002G398300 Sobic002G281850 Sobic002G281850 Sobic005G017150--Sobic002G281850 Sobic005G017150--Sobic003G312800 Sobic005G017150--Sobic002G326300 Sobic002G181500 Sobic002G181500 Sobic005G017150--Sobic002G181500 Sobic008G037300--Sobic005G068000 Sobic008G037300--Sobic009G026600 Sobic008G037300--Sobic002G309300 Sobic008G037300--Sobic003G124400 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic008G037300--Sobic001G370800 Sobic008G037300--Sobic005G027350 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic008G037300--Sobic004G072201 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic008G037300--Sobic001G038700 Sobic008G037300--Sobic001G239000
Octagon: transcription factors


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