Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G398300.1
Synonym Sb02g041300
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X423
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g24240.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G063610.1 , HORVU5Hr1G063610.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G297100 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.003G312800 - -
3 Sobic.007G133733 - -
4 Sobic.003G312600 expressed protein -
5 Sobic.003G312900 - -
6 Sobic.004G209100 GRAM domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G239000 expressed protein -
8 Sobic.005G027350 - -
9 Sobic.010G160850 - -
10 Sobic.005G180850 - -
11 Sobic.010G274700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@receptor kinase, putative, expressed -
12 Sobic.006G248450 - -
13 Sobic.005G090800 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G145300 Os4bglu14 - monolignol beta-glucoside homologue without catalytic acid/base, expressed -
15 Sobic.005G168200 -(PubMedID : 34525227)@expressed protein K17911: beta-carotene isomerase
16 Sobic.005G068000 expressed protein -
17 Sobic.002G046150 - -
18 Sobic.003G232600 polygalacturonase, putative, expressed -
19 Sobic.001G226401 - K06995: uncharacterized protein
20 Sobic.008G132500 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic002G297100 Sobic002G297100 Sobic002G398300--Sobic002G297100 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic002G398300--Sobic003G312800 Sobic007G133733 Sobic007G133733 Sobic002G398300--Sobic007G133733 Sobic003G312600 Sobic003G312600 Sobic002G398300--Sobic003G312600 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic002G398300--Sobic003G312900 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic002G398300--Sobic004G209100 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic002G398300--Sobic001G239000 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic002G398300--Sobic005G027350 Sobic010G160850 Sobic010G160850 Sobic002G398300--Sobic010G160850 Sobic002G297100--Sobic002G398300 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic002G297100--Sobic003G232600 Sobic002G297100--Sobic005G027350 Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic002G297100--Sobic005G180850 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic002G297100--Sobic005G090800 Sobic001G455466 Sobic001G455466 Sobic002G297100--Sobic001G455466 Sobic002G297100--Sobic004G209100 Sobic002G297100--Sobic003G312800 Sobic009G030501 Sobic009G030501 Sobic002G297100--Sobic009G030501 Sobic003G312800--Sobic003G312900 Sobic003G312800--Sobic002G398300 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic003G312800--Sobic005G068000 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic003G312800--Sobic001G190900 Sobic003G312800--Sobic003G312600 Sobic003G312800--Sobic004G209100 Sobic003G312800--Sobic001G239000 Sobic003G312800--Sobic005G180850 Sobic003G312800--Sobic005G027350 Sobic007G133733--Sobic002G398300 Sobic007G133733--Sobic003G312800 Sobic007G133733--Sobic003G312600 Sobic007G133733--Sobic010G160850 Sobic006G228833 Sobic006G228833 Sobic007G133733--Sobic006G228833 Sobic001G074601 Sobic001G074601 Sobic007G133733--Sobic001G074601 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic007G133733--Sobic002G046150 Sobic007G133733--Sobic004G209100 Sobic002G324801 Sobic002G324801 Sobic007G133733--Sobic002G324801 Sobic003G312600--Sobic003G312800 Sobic003G312600--Sobic002G398300 Sobic003G312600--Sobic001G190900 Sobic003G312600--Sobic001G239000 Sobic003G312600--Sobic003G312900 Sobic001G476600 Sobic001G476600 Sobic003G312600--Sobic001G476600 Sobic003G312600--Sobic007G133733 Sobic003G312600--Sobic004G209100 Sobic003G312600--Sobic005G027350 Sobic003G312900--Sobic003G312800 Sobic003G312900--Sobic004G209100 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic003G312900--Sobic001G229850 Sobic003G312900--Sobic005G180850 Sobic003G312900--Sobic001G190900 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic003G312900--Sobic008G132500 Sobic001G226401 Sobic001G226401 Sobic003G312900--Sobic001G226401 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic003G312900--Sobic005G118800 Sobic003G312900--Sobic003G232600 Sobic004G209100--Sobic008G132500 Sobic004G209100--Sobic003G312900 Sobic004G209100--Sobic005G118800 Sobic004G209100--Sobic005G180850 Sobic006G145300 Sobic006G145300 Sobic004G209100--Sobic006G145300 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic004G209100--Sobic010G235100 Sobic004G209100--Sobic003G232600 Sobic004G209100--Sobic003G312800 Sobic004G209100--Sobic005G090800 Sobic001G239000--Sobic005G068000 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic001G239000--Sobic003G124400 Sobic001G239000--Sobic003G312800 Sobic001G239000--Sobic005G027350 Sobic001G239000--Sobic003G312600 Sobic001G239000--Sobic002G398300 Sobic008G037300 Sobic008G037300 Sobic001G239000--Sobic008G037300 Sobic001G239000--Sobic001G476600 Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic001G239000--Sobic001G079000 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic005G027350--Sobic009G026600 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic005G027350--Sobic003G375500 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic005G027350--Sobic009G074800 Sobic005G027350--Sobic005G068000 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic005G027350--Sobic001G460900 Sobic005G027350--Sobic003G312800 Sobic005G027350--Sobic001G239000 Sobic005G027350--Sobic008G037300 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic005G027350--Sobic003G401700 Sobic010G160850--Sobic002G398300 Sobic010G160850--Sobic007G133733 Sobic008G128800 Sobic008G128800 Sobic010G160850--Sobic008G128800 Sobic010G160850--Sobic003G312800 Sobic005G150501 Sobic005G150501 Sobic010G160850--Sobic005G150501 Sobic010G054400 Sobic010G054400 Sobic010G160850--Sobic010G054400 Sobic010G160850--Sobic001G239000 Sobic002G326300 Sobic002G326300 Sobic010G160850--Sobic002G326300 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic010G160850--Sobic006G248450
Octagon: transcription factors


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