Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G312600.1,Sobic.003G312600.2
Synonym Sb03g036070
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VZT3 , A0A1B6Q6D8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g56660.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027350
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G312800 - -
2 Sobic.002G398300 expressed protein -
3 Sobic.001G190900 ABCG protein(PubMedID : 21265893)@"Orthologous gene of wheat Lr34 gene, expressed in accession AusTRCF 302546, but not expreesed in BTx623 possibly due to transposon insertions in intron 4"(PubMedID : 23117720)@pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
4 Sobic.001G239000 expressed protein -
5 Sobic.003G312900 - -
6 Sobic.001G476600 Zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10664: E3 ubiquitin-protein ligase ATL6/9/15/31/42/55
7 Sobic.007G133733 - -
8 Sobic.004G209100 GRAM domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G027350 - -
10 Sobic.005G068000 expressed protein -
11 Sobic.002G297100 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.009G146500 beta-galactosidase, putative, expressed -
13 Sobic.007G075600 pectinesterase, putative, expressed -
14 Sobic.001G059001 - -
15 Sobic.009G026600 - -
16 Sobic.002G324801 - -
17 Sobic.003G124400 - -
18 Sobic.009G094200 - -
19 Sobic.003G263900 reticulon domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G093700 tetraspanin family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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