Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G026600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P637
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G370800 - -
2 Sobic.003G063400 glycosyltransferase family 43 protein, putative, expressed -
3 Sobic.005G027350 - -
4 Sobic.001G038700 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G250400 aluminum-activated malate transporter, putative, expressed -
6 Sobic.001G001800 expressed protein -
7 Sobic.008G037300 RCN1 Centroradialis-like1 homogous to TFL1 gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed -
8 Sobic.002G309300 beta-expansin precursor, putative, expressed -
9 Sobic.010G012200 - K00851: E2.7.1.12, gntK, gluconokinase
10 Sobic.001G460900 expressed protein -
11 Sobic.004G093700 tetraspanin family protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G227700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@protein kinase, putative, expressed -
13 Sobic.008G142200 serine/threonine-protein kinase BRI1-like 2 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.009G074800 - -
15 Sobic.001G442000 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed K14379: tartrate-resistant acid phosphatase type 5
16 Sobic.004G072201 - -
17 Sobic.003G401700 - -
18 Sobic.001G090700 expressed protein -
19 Sobic.009G094200 - -
20 Sobic.003G375500 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic009G026600--Sobic001G370800 Sobic003G063400 Sobic003G063400 Sobic009G026600--Sobic003G063400 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic009G026600--Sobic005G027350 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic009G026600--Sobic001G038700 Sobic004G250400 Sobic004G250400 Sobic009G026600--Sobic004G250400 Sobic001G001800 Sobic001G001800 Sobic009G026600--Sobic001G001800 Sobic008G037300 Sobic008G037300 Sobic009G026600--Sobic008G037300 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic009G026600--Sobic002G309300 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic009G026600--Sobic010G012200 Sobic001G370800--Sobic009G026600 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic001G370800--Sobic004G173200 Sobic001G370800--Sobic001G038700 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic001G370800--Sobic001G442000 Sobic001G370800--Sobic002G309300 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic001G370800--Sobic009G088300 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic001G370800--Sobic004G218400 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic001G370800--Sobic006G255200 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic001G370800--Sobic003G263900 Sobic003G063400--Sobic004G250400 Sobic003G063400--Sobic009G026600 Sobic004G093700 Sobic004G093700 Sobic003G063400--Sobic004G093700 Sobic003G063400--Sobic010G012200 Sobic004G227700 Sobic004G227700 Sobic003G063400--Sobic004G227700 Sobic003G063400--Sobic003G263900 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic003G063400--Sobic007G183600 Sobic010G100700 Sobic010G100700 Sobic003G063400--Sobic010G100700 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic003G063400--Sobic008G142200 Sobic005G027350--Sobic009G026600 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic005G027350--Sobic003G375500 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic005G027350--Sobic009G074800 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic005G027350--Sobic005G068000 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic005G027350--Sobic001G460900 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic005G027350--Sobic003G312800 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic005G027350--Sobic001G239000 Sobic005G027350--Sobic008G037300 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic005G027350--Sobic003G401700 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic001G038700--Sobic006G157450 Sobic001G038700--Sobic003G263900 Sobic001G038700--Sobic002G309300 Sobic001G038700--Sobic004G218400 Sobic001G038700--Sobic010G012200 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic001G038700--Sobic008G170800 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic001G038700--Sobic004G072201 Sobic001G038700--Sobic009G026600 Sobic001G038700--Sobic008G142200 Sobic004G250400--Sobic003G063400 Sobic004G250400--Sobic009G026600 Sobic004G250400--Sobic004G227700 Sobic004G250400--Sobic001G370800 Sobic004G250400--Sobic004G093700 Sobic004G058400 Sobic004G058400 Sobic004G250400--Sobic004G058400 Sobic004G082600 Sobic004G082600 Sobic004G250400--Sobic004G082600 Sobic004G250400--Sobic010G012200 Sobic006G268900 Sobic006G268900 Sobic004G250400--Sobic006G268900 Sobic004G033650 Sobic004G033650 Sobic001G001800--Sobic004G033650 Sobic009G094200 Sobic009G094200 Sobic001G001800--Sobic009G094200 Sobic001G001800--Sobic009G026600 Sobic001G001800--Sobic009G074800 Sobic001G001800--Sobic008G142200 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic001G001800--Sobic001G191500 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic001G001800--Sobic009G026700 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic001G001800--Sobic009G186300 Sobic001G001800--Sobic001G038700 Sobic008G037300--Sobic005G068000 Sobic008G037300--Sobic009G026600 Sobic008G037300--Sobic002G309300 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic008G037300--Sobic003G124400 Sobic008G037300--Sobic001G370800 Sobic008G037300--Sobic005G027350 Sobic008G037300--Sobic004G072201 Sobic008G037300--Sobic001G038700 Sobic008G037300--Sobic001G239000 Sobic002G309300--Sobic004G218400 Sobic002G309300--Sobic001G038700 Sobic002G309300--Sobic004G072201 Sobic002G309300--Sobic006G255200 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic002G309300--Sobic006G268100 Sobic002G309300--Sobic001G370800 Sobic002G309300--Sobic009G026600 Sobic002G309300--Sobic001G442000 Sobic002G309300--Sobic008G037300 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic010G012200--Sobic001G520000 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic010G012200--Sobic003G155000 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic010G012200--Sobic003G253700 Sobic010G012200--Sobic001G038700 Sobic010G012200--Sobic008G170800 Sobic010G012200--Sobic006G157450 Sobic010G000200 Sobic010G000200 Sobic010G012200--Sobic010G000200 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic010G012200--Sobic004G315400 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic010G012200--Sobic008G103400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.