Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G324801.2,Sobic.002G324801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W6Q0
Pfam -
Panther DB PTHR34064 PTHR34064:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g34650.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048268 , Zm00025a014828
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2D02G224900 , TraesCS2A02G218500 , TraesCS2B02G243900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G072800 OsMADS33 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
2 Sobic.003G016950 - -
3 Sobic.008G132500 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
4 Sobic.004G093700 tetraspanin family protein, putative, expressed -
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8 Sobic.001G250750 - -
9 Sobic.010G196466 - -
10 Sobic.009G074800 - -
11 Sobic.002G009000 - -
12 Sobic.010G183350 - -
13 Sobic.003G096950 - -
14 Sobic.003G272000 expressed protein -
15 Sobic.004G206600 osFTL5 FT-Like5 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
16 Sobic.005G090800 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.009G094200 - -
18 Sobic.003G232600 polygalacturonase, putative, expressed -
19 Sobic.003G219300 leaf senescence related protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G026700 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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