Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G454600.2
Synonym Sb01g042720
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5SAP5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G52070 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g11780.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G090700 expressed protein -
2 Sobic.008G170800 OsWAK126 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
3 Sobic.002G206900 GEX2, putative, expressed -
4 Sobic.003G040300 cytochrome P450, putative, expressed -
5 Sobic.003G001650 - -
6 Sobic.004G218400 - -
7 Sobic.001G038700 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G167400 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed K05609: UCHL3, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L3
9 Sobic.003G362800 - -
10 Sobic.001G001800 expressed protein -
11 Sobic.009G026600 - -
12 Sobic.003G155000 inorganic H+ pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
13 Sobic.006G279100 Positive regulator of ABA(PubMedID : 30367619)@CAMK_CAMK_like.28 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K14498: serine/threonine-protein kinase SRK2
14 Sobic.010G012200 - K00851: E2.7.1.12, gntK, gluconokinase
15 Sobic.008G192900 -(PubMedID : 29751546)@sodium/hydrogen exchanger 7, putative, expressed -
16 Sobic.001G460900 expressed protein -
17 Sobic.010G042300 DTA2, putative, expressed -
18 Sobic.009G137401 - -
19 Sobic.002G309300 beta-expansin precursor, putative, expressed -
20 Sobic.007G046600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G454600 Sobic001G454600 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic001G454600--Sobic001G090700 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic001G454600--Sobic008G170800 Sobic002G206900 Sobic002G206900 Sobic001G454600--Sobic002G206900 Sobic003G040300 Sobic003G040300 Sobic001G454600--Sobic003G040300 Sobic003G001650 Sobic003G001650 Sobic001G454600--Sobic003G001650 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic001G454600--Sobic004G218400 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic001G454600--Sobic001G038700 Sobic006G167400 Sobic006G167400 Sobic001G454600--Sobic006G167400 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic001G454600--Sobic003G362800 Sobic001G090700--Sobic008G170800 Sobic001G090700--Sobic001G454600 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic001G090700--Sobic010G042300 Sobic001G090700--Sobic001G038700 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic001G090700--Sobic006G279100 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic001G090700--Sobic009G026600 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic001G090700--Sobic001G460900 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic001G090700--Sobic010G012200 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic001G090700--Sobic008G190600 Sobic008G170800--Sobic001G090700 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic008G170800--Sobic006G157450 Sobic008G170800--Sobic001G038700 Sobic008G170800--Sobic010G012200 Sobic008G170800--Sobic008G190600 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic008G170800--Sobic003G155000 Sobic008G170800--Sobic001G454600 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic008G170800--Sobic008G142200 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic008G170800--Sobic003G253700 Sobic002G206900--Sobic001G454600 Sobic002G206900--Sobic003G155000 Sobic003G155800 Sobic003G155800 Sobic002G206900--Sobic003G155800 Sobic002G206900--Sobic003G362800 Sobic002G206900--Sobic003G253700 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic002G206900--Sobic001G483001 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic002G206900--Sobic001G520000 Sobic002G206900--Sobic008G170800 Sobic009G252600 Sobic009G252600 Sobic002G206900--Sobic009G252600 Sobic009G208000 Sobic009G208000 Sobic003G040300--Sobic009G208000 Sobic003G040300--Sobic001G454600 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic003G040300--Sobic002G001500 Sobic003G040300--Sobic001G090700 Sobic004G181000 Sobic004G181000 Sobic003G040300--Sobic004G181000 Sobic003G025300 Sobic003G025300 Sobic003G040300--Sobic003G025300 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic003G040300--Sobic008G103400 Sobic003G040300--Sobic008G170800 Sobic003G040300--Sobic003G362800 Sobic003G001650--Sobic003G362800 Sobic003G001650--Sobic004G218400 Sobic003G001650--Sobic008G170800 Sobic003G001650--Sobic010G042300 Sobic003G001650--Sobic001G454600 Sobic003G001650--Sobic002G001500 Sobic008G192900 Sobic008G192900 Sobic003G001650--Sobic008G192900 Sobic003G001650--Sobic008G103400 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic003G001650--Sobic004G144300 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic004G218400--Sobic002G309300 Sobic004G218400--Sobic001G038700 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic004G218400--Sobic006G268100 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic004G218400--Sobic001G370800 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic004G218400--Sobic006G255200 Sobic004G218400--Sobic003G001650 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic004G218400--Sobic002G274000 Sobic003G067600 Sobic003G067600 Sobic004G218400--Sobic003G067600 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic004G218400--Sobic004G072201 Sobic001G038700--Sobic006G157450 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic001G038700--Sobic003G263900 Sobic001G038700--Sobic002G309300 Sobic001G038700--Sobic004G218400 Sobic001G038700--Sobic010G012200 Sobic001G038700--Sobic008G170800 Sobic001G038700--Sobic004G072201 Sobic001G038700--Sobic009G026600 Sobic001G038700--Sobic008G142200 Sobic006G167400--Sobic001G454600 Sobic006G167400--Sobic002G206900 Sobic005G070951 Sobic005G070951 Sobic006G167400--Sobic005G070951 Sobic006G167400--Sobic006G279100 Sobic006G167400--Sobic001G090700 Sobic006G167400--Sobic008G170800 Sobic007G194000 Sobic007G194000 Sobic006G167400--Sobic007G194000 Sobic006G167400--Sobic003G040300 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic006G167400--Sobic007G046600 Sobic003G362800--Sobic002G001500 Sobic001G113400 Sobic001G113400 Sobic003G362800--Sobic001G113400 Sobic003G362800--Sobic003G155800 Sobic003G362800--Sobic004G181000 Sobic003G362800--Sobic004G144300 Sobic003G362800--Sobic008G103400 Sobic010G000200 Sobic010G000200 Sobic003G362800--Sobic010G000200 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic003G362800--Sobic004G173200 Sobic003G362800--Sobic003G001650
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.