Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G167400.1
Synonym Sb06g024310, UCH3
Functional annotation ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed
UniProt C5YDE1
Pfam PF01088
Panther DB PTHR10589
NCBI CDD KOG1415; Ubiquitin C-terminal hydrolase UCHL1
KEGG Orthology K05609; UCHL3, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L3
Gene Ontology GO:0006511; ubiquitin-dependent protein catabolic process GO:0005622intracellular GO:0004843thiol-dependent ubiquitin-specific protease activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G17510 : ubiquitin C-terminal hydrolase 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g46190.1 : ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056666
Brachypodium PNT69167
Barley HORVU3Hr1G078230.1 , HORVU6Hr1G062360.5 , HORVU6Hr1G062360.6 , HORVU6Hr1G062360.1 , HORVU6Hr1G062360.3 , HORVU6Hr1G062360.2 , HORVU2Hr1G093570.1 , HORVU2Hr1G093570.5 , HORVU2Hr1G093570.2 , HORVU2Hr1G093570.3 , HORVU2Hr1G093570.4
Wheat TraesCS2A02G393000 , TraesCS2D02G391100 , TraesCS6B02G281200 , TraesCS6B02G281200
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Gene co-expression network
sample Sobic006G167400 Sobic006G167400 Sobic001G454600 Sobic001G454600 Sobic006G167400--Sobic001G454600 Sobic002G206900 Sobic002G206900 Sobic006G167400--Sobic002G206900 Sobic005G070951 Sobic005G070951 Sobic006G167400--Sobic005G070951 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic006G167400--Sobic006G279100 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic006G167400--Sobic001G090700 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic006G167400--Sobic008G170800 Sobic007G194000 Sobic007G194000 Sobic006G167400--Sobic007G194000 Sobic003G040300 Sobic003G040300 Sobic006G167400--Sobic003G040300 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic006G167400--Sobic007G046600 Sobic001G454600--Sobic001G090700 Sobic001G454600--Sobic008G170800 Sobic001G454600--Sobic002G206900 Sobic001G454600--Sobic003G040300 Sobic003G001650 Sobic003G001650 Sobic001G454600--Sobic003G001650 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic001G454600--Sobic004G218400 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic001G454600--Sobic001G038700 Sobic001G454600--Sobic006G167400 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic001G454600--Sobic003G362800 Sobic002G206900--Sobic001G454600 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic002G206900--Sobic003G155000 Sobic003G155800 Sobic003G155800 Sobic002G206900--Sobic003G155800 Sobic002G206900--Sobic003G362800 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic002G206900--Sobic003G253700 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic002G206900--Sobic001G483001 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic002G206900--Sobic001G520000 Sobic002G206900--Sobic008G170800 Sobic009G252600 Sobic009G252600 Sobic002G206900--Sobic009G252600 Sobic005G070951--Sobic006G279100 Sobic005G070951--Sobic006G167400 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic005G070951--Sobic010G042300 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic005G070951--Sobic002G208700 Sobic005G070951--Sobic001G454600 Sobic005G070951--Sobic001G090700 Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic005G070951--Sobic005G228650 Sobic005G070951--Sobic001G483001 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic005G070951--Sobic007G137100 Sobic006G279100--Sobic010G042300 Sobic006G279100--Sobic005G070951 Sobic006G279100--Sobic001G483001 Sobic006G279100--Sobic001G090700 Sobic006G279100--Sobic008G170800 Sobic006G279100--Sobic002G208700 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic006G279100--Sobic001G460900 Sobic006G279100--Sobic005G228650 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic006G279100--Sobic001G150100 Sobic001G090700--Sobic008G170800 Sobic001G090700--Sobic001G454600 Sobic001G090700--Sobic010G042300 Sobic001G090700--Sobic001G038700 Sobic001G090700--Sobic006G279100 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic001G090700--Sobic009G026600 Sobic001G090700--Sobic001G460900 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic001G090700--Sobic010G012200 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic001G090700--Sobic008G190600 Sobic008G170800--Sobic001G090700 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic008G170800--Sobic006G157450 Sobic008G170800--Sobic001G038700 Sobic008G170800--Sobic010G012200 Sobic008G170800--Sobic008G190600 Sobic008G170800--Sobic003G155000 Sobic008G170800--Sobic001G454600 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic008G170800--Sobic008G142200 Sobic008G170800--Sobic003G253700 Sobic007G194000--Sobic010G042300 Sobic007G194000--Sobic001G090700 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic007G194000--Sobic005G182100 Sobic007G194000--Sobic008G170800 Sobic007G194000--Sobic001G454600 Sobic007G194000--Sobic003G001650 Sobic005G014400 Sobic005G014400 Sobic007G194000--Sobic005G014400 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic007G194000--Sobic001G093732 Sobic003G276400 Sobic003G276400 Sobic007G194000--Sobic003G276400 Sobic009G208000 Sobic009G208000 Sobic003G040300--Sobic009G208000 Sobic003G040300--Sobic001G454600 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic003G040300--Sobic002G001500 Sobic003G040300--Sobic001G090700 Sobic004G181000 Sobic004G181000 Sobic003G040300--Sobic004G181000 Sobic003G025300 Sobic003G025300 Sobic003G040300--Sobic003G025300 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic003G040300--Sobic008G103400 Sobic003G040300--Sobic008G170800 Sobic003G040300--Sobic003G362800 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic007G046600--Sobic009G252500 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic007G046600--Sobic003G298000 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic007G046600--Sobic002G209450 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic007G046600--Sobic003G241600 Sobic007G046600--Sobic008G170800 Sobic004G053600 Sobic004G053600 Sobic007G046600--Sobic004G053600 Sobic007G046600--Sobic003G155000 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic007G046600--Sobic004G190800 Sobic001G010900 Sobic001G010900 Sobic007G046600--Sobic001G010900
Octagon: transcription factors


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