Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G058300.1
Synonym Sb03g004970
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XNK9
Pfam -
Panther DB PTHR31439
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G40390 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g07130.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK02842
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G171901 - -
2 Sobic.010G088100 ADP-ribosylation factor 1, putative, expressed K07977: Arf/Sar family, other
3 Sobic.009G186300 protein kinase, putative, expressed -
4 Sobic.004G084600 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@AP2 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G001800 expressed protein -
6 Sobic.007G203800 - -
7 Sobic.004G117850 - -
8 Sobic.006G072701 - -
9 Sobic.002G206900 GEX2, putative, expressed -
10 Sobic.003G334400 verticillium wilt disease resistance protein precursor, putative, expressed -
11 Sobic.010G163666 - -
12 Sobic.004G118000 glutamate receptor 2.6 precursor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
13 Sobic.001G191500 expressed protein -
14 Sobic.007G089566 - -
15 Sobic.003G335000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
16 Sobic.007G137100 - -
17 Sobic.009G026700 expressed protein -
18 Sobic.009G137401 - -
19 Sobic.009G074800 - -
20 Sobic.004G205900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G058300 Sobic003G058300 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic003G058300--Sobic002G171901 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic003G058300--Sobic010G088100 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic003G058300--Sobic009G186300 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic003G058300--Sobic004G084600 Sobic001G001800 Sobic001G001800 Sobic003G058300--Sobic001G001800 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic003G058300--Sobic007G203800 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic003G058300--Sobic004G117850 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic003G058300--Sobic006G072701 Sobic002G206900 Sobic002G206900 Sobic003G058300--Sobic002G206900 Sobic002G171901--Sobic004G084600 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic002G171901--Sobic003G334400 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic002G171901--Sobic008G085800 Sobic002G171901--Sobic007G203800 Sobic002G171901--Sobic004G117850 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic002G171901--Sobic006G041200 Sobic002G171901--Sobic006G072701 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic002G171901--Sobic006G111000 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic002G171901--Sobic010G163666 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic010G088100--Sobic004G030850 Sobic010G088100--Sobic004G084600 Sobic010G088100--Sobic003G058300 Sobic004G118000 Sobic004G118000 Sobic010G088100--Sobic004G118000 Sobic010G088100--Sobic002G171901 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic010G088100--Sobic002G033200 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic010G088100--Sobic009G137401 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic010G088100--Sobic003G336550 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic010G088100--Sobic001G191500 Sobic009G186300--Sobic001G001800 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic009G186300--Sobic001G038700 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic009G186300--Sobic001G460900 Sobic009G094200 Sobic009G094200 Sobic009G186300--Sobic009G094200 Sobic009G186300--Sobic003G058300 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic009G186300--Sobic004G072201 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic009G186300--Sobic005G027350 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic009G186300--Sobic002G309300 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic009G186300--Sobic005G068000 Sobic004G084600--Sobic002G171901 Sobic004G084600--Sobic006G072701 Sobic004G084600--Sobic004G030850 Sobic004G084600--Sobic006G041200 Sobic004G084600--Sobic006G111000 Sobic004G084600--Sobic003G336550 Sobic004G084600--Sobic007G203800 Sobic004G084600--Sobic010G088100 Sobic004G084600--Sobic004G117850 Sobic004G033650 Sobic004G033650 Sobic001G001800--Sobic004G033650 Sobic001G001800--Sobic009G094200 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic001G001800--Sobic009G026600 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic001G001800--Sobic009G074800 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic001G001800--Sobic008G142200 Sobic001G001800--Sobic001G191500 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic001G001800--Sobic009G026700 Sobic001G001800--Sobic009G186300 Sobic001G001800--Sobic001G038700 Sobic007G203800--Sobic002G171901 Sobic007G203800--Sobic004G084600 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic007G203800--Sobic009G192400 Sobic007G203800--Sobic006G041200 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic007G203800--Sobic007G225050 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic007G203800--Sobic007G206400 Sobic007G203800--Sobic003G336550 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic007G203800--Sobic006G021100 Sobic007G203800--Sobic008G085800 Sobic004G117850--Sobic006G111000 Sobic004G117850--Sobic002G171901 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic004G117850--Sobic008G100900 Sobic004G117850--Sobic008G085800 Sobic004G117850--Sobic004G084600 Sobic003G368450 Sobic003G368450 Sobic004G117850--Sobic003G368450 Sobic004G117850--Sobic010G163666 Sobic004G117850--Sobic007G203800 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic004G117850--Sobic003G329300 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic006G072701--Sobic008G083100 Sobic006G072701--Sobic004G084600 Sobic006G072701--Sobic001G191500 Sobic006G072701--Sobic009G026700 Sobic006G072701--Sobic002G171901 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic006G072701--Sobic007G182300 Sobic006G072701--Sobic006G041200 Sobic006G072701--Sobic009G074800 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic006G072701--Sobic001G250750 Sobic001G454600 Sobic001G454600 Sobic002G206900--Sobic001G454600 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic002G206900--Sobic003G155000 Sobic003G155800 Sobic003G155800 Sobic002G206900--Sobic003G155800 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic002G206900--Sobic003G362800 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic002G206900--Sobic003G253700 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic002G206900--Sobic001G483001 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic002G206900--Sobic001G520000 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic002G206900--Sobic008G170800 Sobic009G252600 Sobic009G252600 Sobic002G206900--Sobic009G252600
Octagon: transcription factors


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