Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G238900.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RG80
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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cDNA sequences
Sobic.006G238900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G108766 - -
2 Sobic.003G406120 - -
3 Sobic.005G230900 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G040300 cytochrome P450, putative, expressed -
5 Sobic.001G084133 - -
6 Sobic.001G090700 expressed protein -
7 Sobic.001G079000 - -
8 Sobic.006G248450 - -
9 Sobic.001G454600 expressed protein -
10 Sobic.004G089801 - -
11 Sobic.007G155950 - -
12 Sobic.003G401700 - -
13 Sobic.002G043201 - -
14 Sobic.002G365300 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G187950 - -
16 Sobic.006G167400 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed K05609: UCHL3, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L3
17 Sobic.006G148600 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR18 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
18 Sobic.001G159250 - -
19 Sobic.005G027350 - -
20 Sobic.002G208700 glutamate receptor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant


Gene co-expression network
sample Sobic006G238900 Sobic006G238900 Sobic006G108766 Sobic006G108766 Sobic006G238900--Sobic006G108766 Sobic003G406120 Sobic003G406120 Sobic006G238900--Sobic003G406120 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic006G238900--Sobic005G230900 Sobic003G040300 Sobic003G040300 Sobic006G238900--Sobic003G040300 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic006G238900--Sobic001G084133 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic006G238900--Sobic001G090700 Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic006G238900--Sobic001G079000 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic006G238900--Sobic006G248450 Sobic001G454600 Sobic001G454600 Sobic006G238900--Sobic001G454600 Sobic006G108766--Sobic006G238900 Sobic006G108766--Sobic003G406120 Sobic008G001600 Sobic008G001600 Sobic006G108766--Sobic008G001600 Sobic008G001500 Sobic008G001500 Sobic006G108766--Sobic008G001500 Sobic007G155950 Sobic007G155950 Sobic006G108766--Sobic007G155950 Sobic006G108766--Sobic005G230900 Sobic004G037401 Sobic004G037401 Sobic006G108766--Sobic004G037401 Sobic006G108766--Sobic003G040300 Sobic004G207350 Sobic004G207350 Sobic006G108766--Sobic004G207350 Sobic003G406120--Sobic005G230900 Sobic003G406120--Sobic006G108766 Sobic003G406120--Sobic008G001600 Sobic003G406120--Sobic004G207350 Sobic003G406120--Sobic006G238900 Sobic003G406120--Sobic001G084133 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic003G406120--Sobic002G365300 Sobic003G406120--Sobic004G037401 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic003G406120--Sobic004G089801 Sobic005G230900--Sobic001G084133 Sobic005G230900--Sobic003G406120 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic005G230900--Sobic004G272000 Sobic005G230900--Sobic004G089801 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic005G230900--Sobic008G026500 Sobic005G230900--Sobic002G365300 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic005G230900--Sobic001G421450 Sobic005G230900--Sobic006G238900 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic005G230900--Sobic003G245000 Sobic009G208000 Sobic009G208000 Sobic003G040300--Sobic009G208000 Sobic003G040300--Sobic001G454600 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic003G040300--Sobic002G001500 Sobic003G040300--Sobic001G090700 Sobic004G181000 Sobic004G181000 Sobic003G040300--Sobic004G181000 Sobic003G025300 Sobic003G025300 Sobic003G040300--Sobic003G025300 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic003G040300--Sobic008G103400 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic003G040300--Sobic008G170800 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic003G040300--Sobic003G362800 Sobic001G084133--Sobic004G089801 Sobic001G084133--Sobic005G230900 Sobic001G084133--Sobic001G421450 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic001G084133--Sobic006G222200 Sobic003G356500 Sobic003G356500 Sobic001G084133--Sobic003G356500 Sobic003G193900 Sobic003G193900 Sobic001G084133--Sobic003G193900 Sobic001G084133--Sobic004G272000 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic001G084133--Sobic002G033100 Sobic001G084133--Sobic003G245000 Sobic001G090700--Sobic008G170800 Sobic001G090700--Sobic001G454600 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic001G090700--Sobic010G042300 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic001G090700--Sobic001G038700 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic001G090700--Sobic006G279100 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic001G090700--Sobic009G026600 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic001G090700--Sobic001G460900 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic001G090700--Sobic010G012200 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic001G090700--Sobic008G190600 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic001G079000--Sobic003G124400 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic001G079000--Sobic001G239000 Sobic001G079000--Sobic009G026600 Sobic005G150501 Sobic005G150501 Sobic001G079000--Sobic005G150501 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic001G079000--Sobic003G375500 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic001G079000--Sobic005G027350 Sobic008G037300 Sobic008G037300 Sobic001G079000--Sobic008G037300 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic001G079000--Sobic003G401700 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic001G079000--Sobic005G068000 Sobic010G054150 Sobic010G054150 Sobic006G248450--Sobic010G054150 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic006G248450--Sobic010G274700 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic006G248450--Sobic003G335000 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic006G248450--Sobic003G312800 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic006G248450--Sobic001G431600 Sobic002G297100 Sobic002G297100 Sobic006G248450--Sobic002G297100 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic006G248450--Sobic002G398300 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic006G248450--Sobic007G052000 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic006G248450--Sobic003G329300 Sobic001G454600--Sobic001G090700 Sobic001G454600--Sobic008G170800 Sobic002G206900 Sobic002G206900 Sobic001G454600--Sobic002G206900 Sobic001G454600--Sobic003G040300 Sobic003G001650 Sobic003G001650 Sobic001G454600--Sobic003G001650 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic001G454600--Sobic004G218400 Sobic001G454600--Sobic001G038700 Sobic006G167400 Sobic006G167400 Sobic001G454600--Sobic006G167400 Sobic001G454600--Sobic003G362800
Octagon: transcription factors


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