Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G148600.1
Synonym SbSAUR42, Sb06g022720, small auxin up RNA
Functional annotation "domain confirmed by Pfam database, expression not supported" (PubMedID : 20499123)
OsSAUR18 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed
UniProt A0A1Z5RE01
Pfam PF02519
Panther DB PTHR31374 PTHR31374:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14488; SAUR family protein
Gene Ontology GO:0009733; response to auxin


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G37030 : SAUR-like auxin-responsive protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g43740.1 : OsSAUR18 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010656
Brachypodium KQJ83616
Barley HORVU2Hr1G089400.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G016950 - -
2 Sobic.003G401700 - -
3 Sobic.004G193350 - -
4 Sobic.001G422432 - -
5 Sobic.002G157050 - -
6 Sobic.001G016050 - -
7 Sobic.006G177500 calcium-dependent protein kinase 29("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@CAMK_CAMK_like.26 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
8 Sobic.001G400601 - -
9 Sobic.002G297100 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.003G375500 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G322600 coiled-coil domain-containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G238900 - -
13 Sobic.002G398300 expressed protein -
14 Sobic.001G072400 - -
15 Sobic.010G183350 - -
16 Sobic.008G106100 ureide permease, putative, expressed -
17 Sobic.003G406120 - -
18 Sobic.005G137500 - -
19 Sobic.005G090800 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G089850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G148600 Sobic006G148600 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic006G148600--Sobic003G016950 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic006G148600--Sobic003G401700 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic006G148600--Sobic004G193350 Sobic001G422432 Sobic001G422432 Sobic006G148600--Sobic001G422432 Sobic002G157050 Sobic002G157050 Sobic006G148600--Sobic002G157050 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic006G148600--Sobic001G016050 Sobic006G177500 Sobic006G177500 Sobic006G148600--Sobic006G177500 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic006G148600--Sobic001G400601 Sobic002G297100 Sobic002G297100 Sobic006G148600--Sobic002G297100 Sobic002G324801 Sobic002G324801 Sobic003G016950--Sobic002G324801 Sobic003G016950--Sobic004G193350 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic003G016950--Sobic005G090800 Sobic003G016950--Sobic001G016050 Sobic005G026966 Sobic005G026966 Sobic003G016950--Sobic005G026966 Sobic003G096950 Sobic003G096950 Sobic003G016950--Sobic003G096950 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic003G016950--Sobic003G375500 Sobic009G146500 Sobic009G146500 Sobic003G016950--Sobic009G146500 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic003G016950--Sobic002G067900 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic003G401700--Sobic010G183350 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic003G401700--Sobic009G074800 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic003G401700--Sobic009G026600 Sobic003G401700--Sobic003G375500 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic003G401700--Sobic005G027350 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic003G401700--Sobic009G026700 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic003G401700--Sobic001G460900 Sobic004G033650 Sobic004G033650 Sobic003G401700--Sobic004G033650 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic003G401700--Sobic001G090700 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic004G193350--Sobic002G159750 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic004G193350--Sobic003G238750 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic004G193350--Sobic004G322650 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic004G193350--Sobic001G476800 Sobic005G137500 Sobic005G137500 Sobic004G193350--Sobic005G137500 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic004G193350--Sobic008G171200 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic004G193350--Sobic010G175550 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic004G193350--Sobic003G286450 Sobic004G193350--Sobic003G016950 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic001G422432--Sobic003G163000 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic001G422432--Sobic005G045250 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic001G422432--Sobic004G077700 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G422432--Sobic003G161900 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic001G422432--Sobic002G401533 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic001G422432--Sobic009G101500 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic001G422432--Sobic003G030450 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic001G422432--Sobic004G303900 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic001G422432--Sobic001G202450 Sobic002G157050--Sobic004G322650 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic002G157050--Sobic001G171700 Sobic002G157050--Sobic008G171200 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic002G157050--Sobic004G157050 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic002G157050--Sobic001G395600 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic002G157050--Sobic003G139600 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic002G157050--Sobic010G002301 Sobic002G157050--Sobic003G238750 Sobic004G282966 Sobic004G282966 Sobic002G157050--Sobic004G282966 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic001G016050--Sobic010G136700 Sobic001G016050--Sobic005G090800 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic001G016050--Sobic007G090433 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic001G016050--Sobic010G011100 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic001G016050--Sobic008G115200 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic001G016050--Sobic010G132400 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic001G016050--Sobic004G276600 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic001G016050--Sobic008G119600 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic001G016050--Sobic001G255866 Sobic006G177500--Sobic009G146500 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic006G177500--Sobic008G083100 Sobic006G177500--Sobic003G096950 Sobic006G177500--Sobic004G193350 Sobic006G177500--Sobic009G074800 Sobic006G177500--Sobic005G137500 Sobic006G177500--Sobic003G401700 Sobic004G299850 Sobic004G299850 Sobic006G177500--Sobic004G299850 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic006G177500--Sobic008G113200 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic001G400601--Sobic001G340100 Sobic001G400601--Sobic002G067900 Sobic003G322600 Sobic003G322600 Sobic001G400601--Sobic003G322600 Sobic004G223800 Sobic004G223800 Sobic001G400601--Sobic004G223800 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic001G400601--Sobic002G134800 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic001G400601--Sobic006G107766 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G400601--Sobic009G257000 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic001G400601--Sobic003G394701 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic001G400601--Sobic007G004400 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic002G297100--Sobic002G398300 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic002G297100--Sobic003G232600 Sobic002G297100--Sobic005G027350 Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic002G297100--Sobic005G180850 Sobic002G297100--Sobic005G090800 Sobic001G455466 Sobic001G455466 Sobic002G297100--Sobic001G455466 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic002G297100--Sobic004G209100 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic002G297100--Sobic003G312800 Sobic009G030501 Sobic009G030501 Sobic002G297100--Sobic009G030501
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.