Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G422432.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SA81
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G163000 - -
2 Sobic.005G045250 - -
3 Sobic.004G077700 - -
4 Sobic.003G161900 - -
5 Sobic.002G401533 - -
6 Sobic.009G101500 - -
7 Sobic.003G030450 - -
8 Sobic.004G303900 - -
9 Sobic.001G202450 - -
10 Sobic.001G094550 - -
11 Sobic.009G210250 - -
12 Sobic.003G233266 - -
13 Sobic.002G214000 protein Kinase, putative, expressed -
14 Sobic.004G207800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
15 Sobic.005G139750 - -
16 Sobic.006G107700 OsMADS27 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
17 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.009G077000 - -
19 Sobic.009G260550 - -
20 Sobic.001G502801 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G422432 Sobic001G422432 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic001G422432--Sobic003G163000 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic001G422432--Sobic005G045250 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic001G422432--Sobic004G077700 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G422432--Sobic003G161900 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic001G422432--Sobic002G401533 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic001G422432--Sobic009G101500 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic001G422432--Sobic003G030450 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic001G422432--Sobic004G303900 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic001G422432--Sobic001G202450 Sobic003G163000--Sobic001G202450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic003G163000--Sobic002G214000 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic003G163000--Sobic001G373850 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic003G163000--Sobic003G169700 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic003G163000--Sobic004G332200 Sobic003G163000--Sobic001G422432 Sobic003G163000--Sobic005G045250 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic003G163000--Sobic004G276600 Sobic003G163000--Sobic004G303900 Sobic005G045250--Sobic001G202450 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic005G045250--Sobic009G077000 Sobic005G045250--Sobic003G030450 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic005G045250--Sobic001G300301 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic005G045250--Sobic001G502801 Sobic005G045250--Sobic002G214000 Sobic005G045250--Sobic003G161900 Sobic005G045250--Sobic002G401533 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic005G045250--Sobic005G019250 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic004G077700--Sobic005G139750 Sobic004G077700--Sobic009G101500 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic004G077700--Sobic001G022700 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic004G077700--Sobic007G145801 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic004G077700--Sobic005G104900 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic004G077700--Sobic001G182700 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic004G077700--Sobic002G159750 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic004G077700--Sobic001G535850 Sobic004G077700--Sobic002G401533 Sobic003G161900--Sobic002G401533 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic003G161900--Sobic001G261444 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic003G161900--Sobic006G107700 Sobic003G161900--Sobic005G104900 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic003G161900--Sobic003G208200 Sobic003G161900--Sobic009G077000 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic003G161900--Sobic001G475950 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic003G161900--Sobic003G056200 SobicK032200 SobicK032200 Sobic003G161900--SobicK032200 Sobic002G401533--Sobic006G107700 Sobic002G401533--Sobic003G161900 Sobic002G401533--Sobic003G056200 Sobic002G401533--Sobic001G475950 Sobic002G401533--Sobic001G261444 Sobic002G401533--Sobic009G077000 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic002G401533--Sobic003G172966 Sobic002G401533--SobicK032200 Sobic002G401533--Sobic005G104900 Sobic009G101500--Sobic004G077700 Sobic009G101500--Sobic005G139750 Sobic009G101500--Sobic001G022700 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic009G101500--Sobic006G131700 Sobic009G101500--Sobic007G145801 Sobic001G094550 Sobic001G094550 Sobic009G101500--Sobic001G094550 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic009G101500--Sobic004G337850 Sobic009G101500--Sobic001G182700 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic009G101500--Sobic001G182800 Sobic003G030450--Sobic005G045250 Sobic003G030450--Sobic001G202450 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic003G030450--Sobic005G152866 Sobic003G030450--Sobic003G163000 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic003G030450--Sobic009G210250 Sobic003G030450--Sobic009G077000 Sobic007G115700 Sobic007G115700 Sobic003G030450--Sobic007G115700 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic003G030450--Sobic010G169950 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic003G030450--Sobic001G107550 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic004G303900--Sobic006G100150 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic004G303900--Sobic007G028300 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic004G303900--Sobic004G078200 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic004G303900--Sobic009G260550 Sobic004G303900--Sobic003G169700 Sobic004G252600 Sobic004G252600 Sobic004G303900--Sobic004G252600 Sobic004G303900--Sobic003G163000 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic004G303900--Sobic006G206600 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic004G303900--Sobic004G207800 Sobic001G202450--Sobic001G373850 Sobic001G202450--Sobic009G077000 Sobic001G202450--Sobic005G045250 Sobic001G202450--Sobic002G214000 Sobic001G202450--Sobic005G019250 Sobic001G202450--Sobic009G210250 Sobic001G202450--Sobic003G163000 Sobic001G202450--Sobic003G208200 Sobic001G202450--Sobic004G332200
Octagon: transcription factors


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