Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G106100.1
Synonym UPS2, Sb08g016100, ATUPS2
Functional annotation ureide permease, putative, expressed
UniProt A0A1B6PDA9
Pfam PF07168
Panther DB PTHR31081
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G03530 : ureide permease 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g31890.1 : ureide permease, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025589
Brachypodium KQJ86633 , PNT62673
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G090800 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G193350 - -
3 Sobic.001G400601 - -
4 Sobic.002G157050 - -
5 Sobic.001G016050 - -
6 Sobic.005G021400 - -
7 Sobic.006G148600 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR18 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
8 Sobic.001G205950 - -
9 Sobic.002G067900 - -
10 Sobic.003G147800 expressed protein -
11 Sobic.003G322600 coiled-coil domain-containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G016950 - -
13 Sobic.009G204501 - -
14 Sobic.003G186066 - -
15 Sobic.002G083332 - -
16 Sobic.001G226401 - K06995: uncharacterized protein
17 Sobic.002G159750 - -
18 Sobic.003G286450 - -
19 Sobic.001G462300 cyclin, putative, expressed K06627: cyclin-A
20 Sobic.001G171700 AT-rich interaction region, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G106100 Sobic008G106100 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic008G106100--Sobic005G090800 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic008G106100--Sobic004G193350 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic008G106100--Sobic001G400601 Sobic002G157050 Sobic002G157050 Sobic008G106100--Sobic002G157050 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic008G106100--Sobic001G016050 Sobic005G021400 Sobic005G021400 Sobic008G106100--Sobic005G021400 Sobic006G148600 Sobic006G148600 Sobic008G106100--Sobic006G148600 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic008G106100--Sobic001G205950 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic008G106100--Sobic002G067900 Sobic001G226401 Sobic001G226401 Sobic005G090800--Sobic001G226401 Sobic005G090800--Sobic002G067900 Sobic005G090800--Sobic001G016050 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic005G090800--Sobic010G136700 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic005G090800--Sobic010G235100 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic005G090800--Sobic001G250750 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic005G090800--Sobic003G232600 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic005G090800--Sobic008G115200 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic005G090800--Sobic002G074900 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic004G193350--Sobic002G159750 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic004G193350--Sobic003G238750 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic004G193350--Sobic004G322650 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic004G193350--Sobic001G476800 Sobic005G137500 Sobic005G137500 Sobic004G193350--Sobic005G137500 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic004G193350--Sobic008G171200 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic004G193350--Sobic010G175550 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic004G193350--Sobic003G286450 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic004G193350--Sobic003G016950 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic001G400601--Sobic001G340100 Sobic001G400601--Sobic002G067900 Sobic003G322600 Sobic003G322600 Sobic001G400601--Sobic003G322600 Sobic004G223800 Sobic004G223800 Sobic001G400601--Sobic004G223800 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic001G400601--Sobic002G134800 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic001G400601--Sobic006G107766 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G400601--Sobic009G257000 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic001G400601--Sobic003G394701 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic001G400601--Sobic007G004400 Sobic002G157050--Sobic004G322650 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic002G157050--Sobic001G171700 Sobic002G157050--Sobic008G171200 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic002G157050--Sobic004G157050 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic002G157050--Sobic001G395600 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic002G157050--Sobic003G139600 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic002G157050--Sobic010G002301 Sobic002G157050--Sobic003G238750 Sobic004G282966 Sobic004G282966 Sobic002G157050--Sobic004G282966 Sobic001G016050--Sobic010G136700 Sobic001G016050--Sobic005G090800 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic001G016050--Sobic007G090433 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic001G016050--Sobic010G011100 Sobic001G016050--Sobic008G115200 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic001G016050--Sobic010G132400 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic001G016050--Sobic004G276600 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic001G016050--Sobic008G119600 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic001G016050--Sobic001G255866 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic005G021400--Sobic010G176000 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic005G021400--Sobic009G204501 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic005G021400--Sobic007G116300 Sobic005G021400--Sobic003G286450 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic005G021400--Sobic001G093400 Sobic005G021400--Sobic001G255866 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic005G021400--Sobic010G053700 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic005G021400--Sobic001G535850 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic005G021400--Sobic001G420150 Sobic006G148600--Sobic003G016950 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic006G148600--Sobic003G401700 Sobic006G148600--Sobic004G193350 Sobic001G422432 Sobic001G422432 Sobic006G148600--Sobic001G422432 Sobic006G148600--Sobic002G157050 Sobic006G148600--Sobic001G016050 Sobic006G177500 Sobic006G177500 Sobic006G148600--Sobic006G177500 Sobic006G148600--Sobic001G400601 Sobic002G297100 Sobic002G297100 Sobic006G148600--Sobic002G297100 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic001G205950--Sobic008G156800 Sobic001G205950--Sobic010G176000 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic001G205950--Sobic008G116800 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic001G205950--Sobic003G112100 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic001G205950--Sobic004G129400 Sobic001G205950--Sobic003G394701 Sobic001G205950--Sobic003G238750 Sobic001G205950--Sobic010G053700 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic001G205950--Sobic007G046700 Sobic002G067900--Sobic005G090800 Sobic002G067900--Sobic003G232600 Sobic002G067900--Sobic001G340100 Sobic002G067900--Sobic007G004400 Sobic002G067900--Sobic001G400601 Sobic002G067900--Sobic010G235100 Sobic002G067900--Sobic002G074900 Sobic002G067900--Sobic001G250750 Sobic002G067900--Sobic008G115200
Octagon: transcription factors


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