Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G462300.1,Sobic.001G462300.2
Synonym CYCA3, Sb01g043380, 2
Functional annotation cyclin, putative, expressed
UniProt C5WTQ2 , A0A1Z5SAS5
Pfam PF02984 PF00134
Panther DB PTHR10177 PTHR10177:SF231
NCBI CDD KOG0654; G2/Mitotic-specific cyclin A
KEGG Orthology K06627; cyclin-A
Gene Ontology GO:0005634; nucleus


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G47210 : cyclin-dependent protein kinase 3;2
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g39210.1,LOC_Os03g11030.1 : cyclin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053122 , Zm00025a053121
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
2 Sobic.004G077700 - -
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15 Sobic.001G535850 - -
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19 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
20 Sobic.003G161900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G462300 Sobic001G462300 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic001G462300--Sobic006G183100 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic001G462300--Sobic004G077700 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic001G462300--Sobic002G083332 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic001G462300--Sobic005G104900 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic001G462300--Sobic001G107550 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic001G462300--Sobic002G401533 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic001G462300--Sobic003G286450 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic001G462300--Sobic005G139750 Sobic001G422432 Sobic001G422432 Sobic001G462300--Sobic001G422432 SobicK032300 SobicK032300 Sobic006G183100--SobicK032300 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic006G183100--Sobic006G124700 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic006G183100--Sobic001G230050 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic006G183100--Sobic010G206600 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic006G183100--Sobic003G172500 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic006G183100--Sobic009G123100 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic006G183100--Sobic001G394532 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic006G183100--Sobic006G124800 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic006G183100--Sobic007G145801 Sobic004G077700--Sobic005G139750 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic004G077700--Sobic009G101500 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic004G077700--Sobic001G022700 Sobic004G077700--Sobic007G145801 Sobic004G077700--Sobic005G104900 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic004G077700--Sobic001G182700 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic004G077700--Sobic002G159750 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic004G077700--Sobic001G535850 Sobic004G077700--Sobic002G401533 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic002G083332--Sobic001G530201 Sobic002G380550 Sobic002G380550 Sobic002G083332--Sobic002G380550 Sobic002G083332--Sobic002G159750 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic002G083332--Sobic003G056200 Sobic002G083332--Sobic001G394532 Sobic001G358366 Sobic001G358366 Sobic002G083332--Sobic001G358366 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic002G083332--Sobic009G204501 Sobic002G083332--Sobic001G182700 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic002G083332--Sobic005G139900 Sobic005G104900--Sobic005G139900 Sobic005G104900--Sobic005G139750 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic005G104900--Sobic003G173116 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic005G104900--Sobic003G053100 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic005G104900--Sobic003G161900 Sobic005G104900--Sobic001G535850 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic005G104900--Sobic003G172600 Sobic005G104900--Sobic001G022700 Sobic005G104900--Sobic004G077700 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic001G107550--Sobic009G077000 Sobic001G107550--Sobic002G401533 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic001G107550--Sobic009G210250 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic001G107550--Sobic006G107700 Sobic001G107550--Sobic003G056200 Sobic001G107550--Sobic003G161900 Sobic001G107550--Sobic004G077700 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic001G107550--Sobic002G358450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic001G107550--Sobic002G214000 Sobic002G401533--Sobic006G107700 Sobic002G401533--Sobic003G161900 Sobic002G401533--Sobic003G056200 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic002G401533--Sobic001G475950 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic002G401533--Sobic001G261444 Sobic002G401533--Sobic009G077000 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic002G401533--Sobic003G172966 SobicK032200 SobicK032200 Sobic002G401533--SobicK032200 Sobic002G401533--Sobic005G104900 Sobic003G286450--Sobic001G535850 Sobic003G286450--Sobic002G159750 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic003G286450--Sobic001G154000 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic003G286450--Sobic004G019550 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic003G286450--Sobic001G476800 Sobic003G286450--Sobic001G394532 Sobic003G286450--Sobic005G139750 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G286450--Sobic004G303433 Sobic003G286450--Sobic010G206600 Sobic005G139750--Sobic001G022700 Sobic005G139750--Sobic004G077700 Sobic005G139750--Sobic007G145801 Sobic005G139750--Sobic010G206600 Sobic005G139750--Sobic001G535850 Sobic005G139750--Sobic005G104900 Sobic005G139750--Sobic003G173116 Sobic005G139750--Sobic001G230050 Sobic005G139750--Sobic003G286450 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic001G422432--Sobic003G163000 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic001G422432--Sobic005G045250 Sobic001G422432--Sobic004G077700 Sobic001G422432--Sobic003G161900 Sobic001G422432--Sobic002G401533 Sobic001G422432--Sobic009G101500 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic001G422432--Sobic003G030450 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic001G422432--Sobic004G303900 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic001G422432--Sobic001G202450
Octagon: transcription factors


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