Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G406120.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W193
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G230900 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
2 Sobic.006G108766 - -
3 Sobic.008G001600 - -
4 Sobic.004G207350 - -
5 Sobic.006G238900 - -
6 Sobic.001G084133 - -
7 Sobic.002G365300 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G037401 - -
9 Sobic.004G089801 - -
10 Sobic.008G001500 signal recognition particle receptor subunit beta, putative, expressed K12272: SRPRB, signal recognition particle receptor subunit beta
11 Sobic.001G421450 - -
12 Sobic.007G137201 - -
13 Sobic.001G089850 - -
14 Sobic.008G026500 - -
15 Sobic.006G257550 - -
16 Sobic.006G222200 MBTB7 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
17 Sobic.001G523050 - -
18 Sobic.003G193900 - -
19 Sobic.004G080901 - -
20 Sobic.006G148600 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR18 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein


Gene co-expression network
sample Sobic003G406120 Sobic003G406120 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic003G406120--Sobic005G230900 Sobic006G108766 Sobic006G108766 Sobic003G406120--Sobic006G108766 Sobic008G001600 Sobic008G001600 Sobic003G406120--Sobic008G001600 Sobic004G207350 Sobic004G207350 Sobic003G406120--Sobic004G207350 Sobic006G238900 Sobic006G238900 Sobic003G406120--Sobic006G238900 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic003G406120--Sobic001G084133 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic003G406120--Sobic002G365300 Sobic004G037401 Sobic004G037401 Sobic003G406120--Sobic004G037401 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic003G406120--Sobic004G089801 Sobic005G230900--Sobic001G084133 Sobic005G230900--Sobic003G406120 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic005G230900--Sobic004G272000 Sobic005G230900--Sobic004G089801 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic005G230900--Sobic008G026500 Sobic005G230900--Sobic002G365300 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic005G230900--Sobic001G421450 Sobic005G230900--Sobic006G238900 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic005G230900--Sobic003G245000 Sobic006G108766--Sobic006G238900 Sobic006G108766--Sobic003G406120 Sobic006G108766--Sobic008G001600 Sobic008G001500 Sobic008G001500 Sobic006G108766--Sobic008G001500 Sobic007G155950 Sobic007G155950 Sobic006G108766--Sobic007G155950 Sobic006G108766--Sobic005G230900 Sobic006G108766--Sobic004G037401 Sobic003G040300 Sobic003G040300 Sobic006G108766--Sobic003G040300 Sobic006G108766--Sobic004G207350 Sobic006G257550 Sobic006G257550 Sobic008G001600--Sobic006G257550 Sobic008G001600--Sobic003G406120 Sobic002G235000 Sobic002G235000 Sobic008G001600--Sobic002G235000 Sobic008G001600--Sobic008G001500 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic008G001600--Sobic010G028366 Sobic008G001600--Sobic006G108766 Sobic001G472900 Sobic001G472900 Sobic008G001600--Sobic001G472900 Sobic001G523050 Sobic001G523050 Sobic008G001600--Sobic001G523050 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic008G001600--Sobic003G076300 Sobic004G207350--Sobic004G037401 Sobic004G207350--Sobic003G406120 Sobic009G022600 Sobic009G022600 Sobic004G207350--Sobic009G022600 Sobic004G207350--Sobic005G230900 Sobic004G207350--Sobic006G108766 Sobic004G207350--Sobic001G421450 Sobic007G137201 Sobic007G137201 Sobic004G207350--Sobic007G137201 Sobic003G149700 Sobic003G149700 Sobic004G207350--Sobic003G149700 Sobic004G207350--Sobic001G084133 Sobic006G238900--Sobic006G108766 Sobic006G238900--Sobic003G406120 Sobic006G238900--Sobic005G230900 Sobic006G238900--Sobic003G040300 Sobic006G238900--Sobic001G084133 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic006G238900--Sobic001G090700 Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic006G238900--Sobic001G079000 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic006G238900--Sobic006G248450 Sobic001G454600 Sobic001G454600 Sobic006G238900--Sobic001G454600 Sobic001G084133--Sobic004G089801 Sobic001G084133--Sobic005G230900 Sobic001G084133--Sobic001G421450 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic001G084133--Sobic006G222200 Sobic003G356500 Sobic003G356500 Sobic001G084133--Sobic003G356500 Sobic003G193900 Sobic003G193900 Sobic001G084133--Sobic003G193900 Sobic001G084133--Sobic004G272000 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic001G084133--Sobic002G033100 Sobic001G084133--Sobic003G245000 Sobic002G365300--Sobic008G026500 Sobic002G365300--Sobic004G089801 Sobic002G365300--Sobic001G523050 Sobic002G365300--Sobic004G272000 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic002G365300--Sobic001G005100 Sobic003G059500 Sobic003G059500 Sobic002G365300--Sobic003G059500 Sobic010G000401 Sobic010G000401 Sobic002G365300--Sobic010G000401 Sobic002G365300--Sobic001G084133 Sobic002G365300--Sobic005G230900 Sobic004G037401--Sobic009G022600 Sobic004G037401--Sobic003G149700 Sobic005G150250 Sobic005G150250 Sobic004G037401--Sobic005G150250 Sobic006G155400 Sobic006G155400 Sobic004G037401--Sobic006G155400 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic004G037401--Sobic002G132201 Sobic005G073300 Sobic005G073300 Sobic004G037401--Sobic005G073300 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic004G037401--Sobic002G054800 Sobic004G037401--Sobic004G207350 Sobic004G037401--Sobic003G356500 Sobic004G089801--Sobic001G084133 Sobic004G089801--Sobic004G272000 Sobic004G089801--Sobic001G005100 Sobic004G089801--Sobic003G356500 Sobic004G089801--Sobic003G059500 Sobic004G089801--Sobic002G365300 Sobic004G089801--Sobic006G222200 Sobic004G089801--Sobic005G230900 Sobic004G089801--Sobic002G033100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.