Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G230900.1
Synonym Sb05g027820
Functional annotation GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RK52
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF27
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G37650 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g47890.1 : GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ87047
Barley -
Wheat TraesCS4B02G140800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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19 Sobic.008G176266 - -
20 Sobic.010G262950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic005G230900--Sobic001G084133 Sobic003G406120 Sobic003G406120 Sobic005G230900--Sobic003G406120 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic005G230900--Sobic004G272000 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic005G230900--Sobic004G089801 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic005G230900--Sobic008G026500 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic005G230900--Sobic002G365300 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic005G230900--Sobic001G421450 Sobic006G238900 Sobic006G238900 Sobic005G230900--Sobic006G238900 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic005G230900--Sobic003G245000 Sobic001G084133--Sobic004G089801 Sobic001G084133--Sobic005G230900 Sobic001G084133--Sobic001G421450 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic001G084133--Sobic006G222200 Sobic003G356500 Sobic003G356500 Sobic001G084133--Sobic003G356500 Sobic003G193900 Sobic003G193900 Sobic001G084133--Sobic003G193900 Sobic001G084133--Sobic004G272000 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic001G084133--Sobic002G033100 Sobic001G084133--Sobic003G245000 Sobic003G406120--Sobic005G230900 Sobic006G108766 Sobic006G108766 Sobic003G406120--Sobic006G108766 Sobic008G001600 Sobic008G001600 Sobic003G406120--Sobic008G001600 Sobic004G207350 Sobic004G207350 Sobic003G406120--Sobic004G207350 Sobic003G406120--Sobic006G238900 Sobic003G406120--Sobic001G084133 Sobic003G406120--Sobic002G365300 Sobic004G037401 Sobic004G037401 Sobic003G406120--Sobic004G037401 Sobic003G406120--Sobic004G089801 Sobic004G272000--Sobic008G026500 Sobic004G272000--Sobic004G089801 Sobic004G272000--Sobic001G084133 Sobic004G272000--Sobic005G230900 Sobic004G272000--Sobic002G365300 Sobic002G221000 Sobic002G221000 Sobic004G272000--Sobic002G221000 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic004G272000--Sobic004G007166 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic004G272000--Sobic001G005100 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic004G272000--Sobic008G176266 Sobic004G089801--Sobic001G084133 Sobic004G089801--Sobic004G272000 Sobic004G089801--Sobic001G005100 Sobic004G089801--Sobic003G356500 Sobic003G059500 Sobic003G059500 Sobic004G089801--Sobic003G059500 Sobic004G089801--Sobic002G365300 Sobic004G089801--Sobic006G222200 Sobic004G089801--Sobic005G230900 Sobic004G089801--Sobic002G033100 Sobic008G026500--Sobic004G272000 Sobic001G523050 Sobic001G523050 Sobic008G026500--Sobic001G523050 Sobic008G026500--Sobic002G365300 Sobic008G026500--Sobic005G230900 Sobic008G026500--Sobic008G176266 Sobic008G026500--Sobic002G221000 Sobic001G221700 Sobic001G221700 Sobic008G026500--Sobic001G221700 Sobic008G026500--Sobic004G089801 Sobic008G026500--Sobic001G005100 Sobic002G365300--Sobic008G026500 Sobic002G365300--Sobic004G089801 Sobic002G365300--Sobic001G523050 Sobic002G365300--Sobic004G272000 Sobic002G365300--Sobic001G005100 Sobic002G365300--Sobic003G059500 Sobic010G000401 Sobic010G000401 Sobic002G365300--Sobic010G000401 Sobic002G365300--Sobic001G084133 Sobic002G365300--Sobic005G230900 Sobic001G421450--Sobic003G245000 Sobic003G149700 Sobic003G149700 Sobic001G421450--Sobic003G149700 Sobic001G421450--Sobic001G084133 Sobic005G150250 Sobic005G150250 Sobic001G421450--Sobic005G150250 Sobic001G421450--Sobic003G193900 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic001G421450--Sobic002G132201 Sobic001G421450--Sobic003G356500 Sobic001G421450--Sobic006G222200 Sobic006G155400 Sobic006G155400 Sobic001G421450--Sobic006G155400 Sobic006G238900--Sobic006G108766 Sobic006G238900--Sobic003G406120 Sobic006G238900--Sobic005G230900 Sobic003G040300 Sobic003G040300 Sobic006G238900--Sobic003G040300 Sobic006G238900--Sobic001G084133 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic006G238900--Sobic001G090700 Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic006G238900--Sobic001G079000 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic006G238900--Sobic006G248450 Sobic001G454600 Sobic001G454600 Sobic006G238900--Sobic001G454600 Sobic003G245000--Sobic001G421450 Sobic006G141200 Sobic006G141200 Sobic003G245000--Sobic006G141200 Sobic003G245000--Sobic003G149700 Sobic003G245000--Sobic005G150250 Sobic002G321000 Sobic002G321000 Sobic003G245000--Sobic002G321000 Sobic003G245000--Sobic006G222200 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic003G245000--Sobic008G109650 Sobic003G245000--Sobic002G132201 Sobic003G245000--Sobic001G084133
Octagon: transcription factors


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