Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G080901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RM86
Pfam PF08711
Panther DB PTHR15141 PTHR15141:SF50
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006351; transcription, DNA-templated GO:0005634nucleus GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g18470.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G137201 - -
2 Sobic.001G089850 - -
3 Sobic.001G208166 - -
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5 Sobic.005G230900 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
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13 Sobic.008G187450 - -
14 Sobic.001G486400 - -
15 Sobic.006G147101 - -
16 Sobic.002G043201 - -
17 Sobic.004G207350 - -
18 Sobic.007G060800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@NB-ARC domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G007166 - -
20 Sobic.007G173400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic007G137201 Sobic007G137201 Sobic004G080901--Sobic007G137201 Sobic001G089850 Sobic001G089850 Sobic004G080901--Sobic001G089850 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic004G080901--Sobic001G208166 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic004G080901--Sobic001G209550 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic004G080901--Sobic005G230900 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic004G080901--Sobic002G059700 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic004G080901--Sobic002G070500 Sobic004G068900 Sobic004G068900 Sobic004G080901--Sobic004G068900 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic004G080901--Sobic008G109650 Sobic007G137201--Sobic004G080901 Sobic007G137201--Sobic001G089850 Sobic007G137201--Sobic005G230900 Sobic003G406120 Sobic003G406120 Sobic007G137201--Sobic003G406120 Sobic007G137201--Sobic001G208166 Sobic004G207350 Sobic004G207350 Sobic007G137201--Sobic004G207350 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic007G137201--Sobic008G187450 Sobic007G137201--Sobic001G209550 Sobic007G137201--Sobic002G059700 Sobic001G089850--Sobic007G137201 Sobic001G089850--Sobic004G080901 Sobic010G226100 Sobic010G226100 Sobic001G089850--Sobic010G226100 Sobic005G078600 Sobic005G078600 Sobic001G089850--Sobic005G078600 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic001G089850--Sobic003G257650 Sobic009G177100 Sobic009G177100 Sobic001G089850--Sobic009G177100 Sobic001G486400 Sobic001G486400 Sobic001G089850--Sobic001G486400 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic001G089850--Sobic005G198150 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic001G089850--Sobic010G228800 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic001G208166--Sobic006G147101 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G043201 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic001G208166--Sobic002G162601 Sobic001G208166--Sobic008G109650 Sobic001G208166--Sobic004G080901 Sobic001G208166--Sobic001G209550 Sobic001G208166--Sobic002G059700 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic001G208166--Sobic001G070900 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G208166--Sobic007G173400 Sobic001G209550--Sobic002G059700 Sobic001G209550--Sobic002G070500 Sobic001G209550--Sobic006G147101 Sobic002G347850 Sobic002G347850 Sobic001G209550--Sobic002G347850 Sobic001G209550--Sobic008G109650 Sobic005G134900 Sobic005G134900 Sobic001G209550--Sobic005G134900 Sobic001G209550--Sobic001G208166 Sobic001G209550--Sobic004G080901 Sobic001G209550--Sobic002G162601 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic005G230900--Sobic001G084133 Sobic005G230900--Sobic003G406120 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic005G230900--Sobic004G272000 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic005G230900--Sobic004G089801 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic005G230900--Sobic008G026500 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic005G230900--Sobic002G365300 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic005G230900--Sobic001G421450 Sobic006G238900 Sobic006G238900 Sobic005G230900--Sobic006G238900 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic005G230900--Sobic003G245000 Sobic002G059700--Sobic001G209550 Sobic002G059700--Sobic002G070500 Sobic002G059700--Sobic005G134900 Sobic002G059700--Sobic006G147101 Sobic002G059700--Sobic002G347850 Sobic002G059700--Sobic008G109650 Sobic002G059700--Sobic001G208166 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic002G059700--Sobic001G230600 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic002G059700--Sobic010G034700 Sobic002G070500--Sobic002G059700 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic002G070500--Sobic004G007166 Sobic002G070500--Sobic001G209550 Sobic002G070500--Sobic005G134900 Sobic001G210101 Sobic001G210101 Sobic002G070500--Sobic001G210101 Sobic002G070500--Sobic008G187450 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic002G070500--Sobic008G176266 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic002G070500--Sobic001G387400 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic002G070500--Sobic009G028650 Sobic004G068900--Sobic004G080901 Sobic007G060800 Sobic007G060800 Sobic004G068900--Sobic007G060800 Sobic004G068900--Sobic001G208166 Sobic004G068900--Sobic007G137201 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic004G068900--Sobic001G064400 Sobic002G191450 Sobic002G191450 Sobic004G068900--Sobic002G191450 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic004G068900--Sobic009G043800 Sobic004G184600 Sobic004G184600 Sobic004G068900--Sobic004G184600 Sobic007G157600 Sobic007G157600 Sobic004G068900--Sobic007G157600 Sobic008G109650--Sobic003G245000 Sobic008G109650--Sobic001G209550 Sobic008G109650--Sobic001G208166 Sobic008G109650--Sobic006G147101 Sobic002G321000 Sobic002G321000 Sobic008G109650--Sobic002G321000 Sobic008G109650--Sobic002G059700 Sobic008G109650--Sobic001G084133 Sobic008G109650--Sobic004G272000 Sobic008G109650--Sobic002G347850
Octagon: transcription factors


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