Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G347850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W6Z2
Pfam -
Panther DB PTHR33165 PTHR33165:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g57830.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G209550 - -
2 Sobic.002G059700 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
3 Sobic.006G147101 - -
4 Sobic.008G109650 - -
5 Sobic.001G208166 - -
6 Sobic.001G064400 expressed protein -
7 Sobic.009G043800 SbDFR4 expression was not detectable in the seedlings of either sorghum cultivar under our experimental conditions.(PubMedID : 20529887)@dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed K13082: bifunctional dihydroflavonol 4-reductase/flavanone 4-reductase
8 Sobic.002G070500 anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
9 Sobic.002G162601 - -
10 Sobic.002G321000 - -
11 Sobic.004G300200 - -
12 Sobic.002G191450 - -
13 Sobic.004G221800 DUF584 domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G184600 - -
15 Sobic.003G245000 expressed protein -
16 Sobic.004G080901 - -
17 Sobic.001G230600 histidine kinase, putative, expressed -
18 Sobic.005G134900 chalcone and stilbene synthases, putative, expressed -
19 Sobic.010G034700 transferase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G118850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G347850 Sobic002G347850 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic002G347850--Sobic001G209550 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic002G347850--Sobic002G059700 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic002G347850--Sobic006G147101 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic002G347850--Sobic008G109650 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic002G347850--Sobic001G208166 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic002G347850--Sobic001G064400 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic002G347850--Sobic009G043800 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic002G347850--Sobic002G070500 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic002G347850--Sobic002G162601 Sobic001G209550--Sobic002G059700 Sobic001G209550--Sobic002G070500 Sobic001G209550--Sobic006G147101 Sobic001G209550--Sobic002G347850 Sobic001G209550--Sobic008G109650 Sobic005G134900 Sobic005G134900 Sobic001G209550--Sobic005G134900 Sobic001G209550--Sobic001G208166 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic001G209550--Sobic004G080901 Sobic001G209550--Sobic002G162601 Sobic002G059700--Sobic001G209550 Sobic002G059700--Sobic002G070500 Sobic002G059700--Sobic005G134900 Sobic002G059700--Sobic006G147101 Sobic002G059700--Sobic002G347850 Sobic002G059700--Sobic008G109650 Sobic002G059700--Sobic001G208166 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic002G059700--Sobic001G230600 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic002G059700--Sobic010G034700 Sobic006G147101--Sobic001G209550 Sobic006G147101--Sobic002G059700 Sobic006G147101--Sobic001G208166 Sobic006G147101--Sobic002G162601 Sobic006G147101--Sobic008G109650 Sobic006G147101--Sobic002G347850 Sobic006G147101--Sobic001G230600 Sobic006G147101--Sobic002G070500 Sobic004G184600 Sobic004G184600 Sobic006G147101--Sobic004G184600 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic008G109650--Sobic003G245000 Sobic008G109650--Sobic001G209550 Sobic008G109650--Sobic001G208166 Sobic008G109650--Sobic006G147101 Sobic002G321000 Sobic002G321000 Sobic008G109650--Sobic002G321000 Sobic008G109650--Sobic002G059700 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic008G109650--Sobic001G084133 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic008G109650--Sobic004G272000 Sobic008G109650--Sobic002G347850 Sobic001G208166--Sobic006G147101 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G162601 Sobic001G208166--Sobic008G109650 Sobic001G208166--Sobic004G080901 Sobic001G208166--Sobic001G209550 Sobic001G208166--Sobic002G059700 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic001G208166--Sobic001G070900 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G208166--Sobic007G173400 Sobic002G191450 Sobic002G191450 Sobic001G064400--Sobic002G191450 Sobic001G064400--Sobic009G043800 Sobic002G114200 Sobic002G114200 Sobic001G064400--Sobic002G114200 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic001G064400--Sobic006G037500 Sobic004G221800 Sobic004G221800 Sobic001G064400--Sobic004G221800 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic001G064400--Sobic009G019400 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic001G064400--Sobic003G229900 Sobic007G007100 Sobic007G007100 Sobic001G064400--Sobic007G007100 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic001G064400--Sobic006G049633 Sobic009G043800--Sobic001G064400 Sobic009G043800--Sobic002G191450 Sobic009G043800--Sobic006G037500 Sobic009G043800--Sobic004G221800 Sobic009G043800--Sobic002G114200 Sobic009G043800--Sobic009G019400 Sobic009G043800--Sobic003G229900 Sobic009G043800--Sobic007G007100 Sobic009G043800--Sobic006G049633 Sobic002G070500--Sobic002G059700 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic002G070500--Sobic004G007166 Sobic002G070500--Sobic001G209550 Sobic002G070500--Sobic005G134900 Sobic001G210101 Sobic001G210101 Sobic002G070500--Sobic001G210101 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic002G070500--Sobic008G187450 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic002G070500--Sobic008G176266 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic002G070500--Sobic001G387400 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic002G070500--Sobic009G028650 Sobic002G162601--Sobic001G208166 Sobic002G162601--Sobic006G147101 Sobic002G162601--Sobic001G230600 Sobic002G162601--Sobic001G070900 Sobic002G162601--Sobic001G209550 Sobic002G162601--Sobic002G059700 Sobic007G157600 Sobic007G157600 Sobic002G162601--Sobic007G157600 Sobic002G162601--Sobic002G070500 Sobic002G162601--Sobic008G109650
Octagon: transcription factors


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