Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G162601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W4G4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G208166 - -
2 Sobic.006G147101 - -
3 Sobic.001G230600 histidine kinase, putative, expressed -
4 Sobic.001G070900 expressed protein -
5 Sobic.001G209550 - -
6 Sobic.002G059700 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
7 Sobic.007G157600 expressed protein -
8 Sobic.002G070500 anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
9 Sobic.008G109650 - -
10 Sobic.002G347850 - -
11 Sobic.005G120101 - -
12 Sobic.007G146001 - -
13 Sobic.001G311400 - -
14 Sobic.002G043201 - -
15 Sobic.004G273550 - -
16 Sobic.001G064400 expressed protein -
17 Sobic.009G043800 SbDFR4 expression was not detectable in the seedlings of either sorghum cultivar under our experimental conditions.(PubMedID : 20529887)@dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed K13082: bifunctional dihydroflavonol 4-reductase/flavanone 4-reductase
18 Sobic.002G180200 - -
19 Sobic.007G173400 - -
20 Sobic.006G118850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic002G162601--Sobic001G208166 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic002G162601--Sobic006G147101 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic002G162601--Sobic001G230600 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic002G162601--Sobic001G070900 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic002G162601--Sobic001G209550 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic002G162601--Sobic002G059700 Sobic007G157600 Sobic007G157600 Sobic002G162601--Sobic007G157600 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic002G162601--Sobic002G070500 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic002G162601--Sobic008G109650 Sobic001G208166--Sobic006G147101 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G162601 Sobic001G208166--Sobic008G109650 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic001G208166--Sobic004G080901 Sobic001G208166--Sobic001G209550 Sobic001G208166--Sobic002G059700 Sobic001G208166--Sobic001G070900 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G208166--Sobic007G173400 Sobic006G147101--Sobic001G209550 Sobic006G147101--Sobic002G059700 Sobic006G147101--Sobic001G208166 Sobic006G147101--Sobic002G162601 Sobic006G147101--Sobic008G109650 Sobic002G347850 Sobic002G347850 Sobic006G147101--Sobic002G347850 Sobic006G147101--Sobic001G230600 Sobic006G147101--Sobic002G070500 Sobic004G184600 Sobic004G184600 Sobic006G147101--Sobic004G184600 Sobic001G230600--Sobic002G162601 Sobic001G230600--Sobic007G157600 Sobic001G230600--Sobic002G059700 Sobic001G230600--Sobic006G147101 Sobic005G134900 Sobic005G134900 Sobic001G230600--Sobic005G134900 Sobic001G230600--Sobic001G209550 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic001G230600--Sobic010G034700 Sobic001G230600--Sobic002G070500 Sobic001G230600--Sobic004G184600 Sobic002G180200 Sobic002G180200 Sobic001G070900--Sobic002G180200 Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic001G070900--Sobic010G210400 Sobic003G390000 Sobic003G390000 Sobic001G070900--Sobic003G390000 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic001G070900--Sobic004G343733 Sobic001G070900--Sobic001G208166 Sobic001G070900--Sobic002G162601 Sobic001G070900--Sobic002G070500 Sobic003G108401 Sobic003G108401 Sobic001G070900--Sobic003G108401 Sobic009G163000 Sobic009G163000 Sobic001G070900--Sobic009G163000 Sobic001G209550--Sobic002G059700 Sobic001G209550--Sobic002G070500 Sobic001G209550--Sobic006G147101 Sobic001G209550--Sobic002G347850 Sobic001G209550--Sobic008G109650 Sobic001G209550--Sobic005G134900 Sobic001G209550--Sobic001G208166 Sobic001G209550--Sobic004G080901 Sobic001G209550--Sobic002G162601 Sobic002G059700--Sobic001G209550 Sobic002G059700--Sobic002G070500 Sobic002G059700--Sobic005G134900 Sobic002G059700--Sobic006G147101 Sobic002G059700--Sobic002G347850 Sobic002G059700--Sobic008G109650 Sobic002G059700--Sobic001G208166 Sobic002G059700--Sobic001G230600 Sobic002G059700--Sobic010G034700 Sobic007G157600--Sobic001G230600 Sobic007G157600--Sobic002G162601 Sobic002G049750 Sobic002G049750 Sobic007G157600--Sobic002G049750 Sobic007G157600--Sobic004G184600 Sobic007G157600--Sobic006G147101 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic007G157600--Sobic001G064400 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic007G157600--Sobic009G043800 Sobic002G191450 Sobic002G191450 Sobic007G157600--Sobic002G191450 Sobic007G157600--Sobic002G059700 Sobic002G070500--Sobic002G059700 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic002G070500--Sobic004G007166 Sobic002G070500--Sobic001G209550 Sobic002G070500--Sobic005G134900 Sobic001G210101 Sobic001G210101 Sobic002G070500--Sobic001G210101 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic002G070500--Sobic008G187450 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic002G070500--Sobic008G176266 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic002G070500--Sobic001G387400 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic002G070500--Sobic009G028650 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic008G109650--Sobic003G245000 Sobic008G109650--Sobic001G209550 Sobic008G109650--Sobic001G208166 Sobic008G109650--Sobic006G147101 Sobic002G321000 Sobic002G321000 Sobic008G109650--Sobic002G321000 Sobic008G109650--Sobic002G059700 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic008G109650--Sobic001G084133 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic008G109650--Sobic004G272000 Sobic008G109650--Sobic002G347850
Octagon: transcription factors


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