Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G146001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RB20
Pfam PF03478
Panther DB PTHR33127 PTHR33127:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G57790 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g34890.1 : OsFBDUF46 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G162601 - -
2 Sobic.001G070900 expressed protein -
3 Sobic.001G096700 expressed protein -
4 Sobic.001G208166 - -
5 Sobic.006G147101 - -
6 Sobic.005G120101 - -
7 Sobic.004G273550 - -
8 Sobic.001G228500 - -
9 Sobic.009G183650 - -
10 Sobic.001G230600 histidine kinase, putative, expressed -
11 Sobic.007G157600 expressed protein -
12 Sobic.007G138200 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G267650 - -
14 Sobic.003G304000 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
15 Sobic.001G515350 - -
16 Sobic.002G180200 - -
17 Sobic.009G079700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.009G163000 - -
19 Sobic.004G347833 - -
20 Sobic.010G210400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -


Gene co-expression network
sample Sobic007G146001 Sobic007G146001 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic007G146001--Sobic002G162601 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic007G146001--Sobic001G070900 Sobic001G096700 Sobic001G096700 Sobic007G146001--Sobic001G096700 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic007G146001--Sobic001G208166 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic007G146001--Sobic006G147101 Sobic005G120101 Sobic005G120101 Sobic007G146001--Sobic005G120101 Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic007G146001--Sobic004G273550 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic007G146001--Sobic001G228500 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic007G146001--Sobic009G183650 Sobic002G162601--Sobic001G208166 Sobic002G162601--Sobic006G147101 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic002G162601--Sobic001G230600 Sobic002G162601--Sobic001G070900 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic002G162601--Sobic001G209550 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic002G162601--Sobic002G059700 Sobic007G157600 Sobic007G157600 Sobic002G162601--Sobic007G157600 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic002G162601--Sobic002G070500 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic002G162601--Sobic008G109650 Sobic002G180200 Sobic002G180200 Sobic001G070900--Sobic002G180200 Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic001G070900--Sobic010G210400 Sobic003G390000 Sobic003G390000 Sobic001G070900--Sobic003G390000 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic001G070900--Sobic004G343733 Sobic001G070900--Sobic001G208166 Sobic001G070900--Sobic002G162601 Sobic001G070900--Sobic002G070500 Sobic003G108401 Sobic003G108401 Sobic001G070900--Sobic003G108401 Sobic009G163000 Sobic009G163000 Sobic001G070900--Sobic009G163000 Sobic001G096700--Sobic001G228500 Sobic001G096700--Sobic001G070900 Sobic001G096700--Sobic001G208166 Sobic007G187500 Sobic007G187500 Sobic001G096700--Sobic007G187500 Sobic001G096700--Sobic002G180200 Sobic004G347833 Sobic004G347833 Sobic001G096700--Sobic004G347833 Sobic001G096700--Sobic007G146001 Sobic004G067800 Sobic004G067800 Sobic001G096700--Sobic004G067800 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G096700--Sobic007G173400 Sobic001G208166--Sobic006G147101 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G162601 Sobic001G208166--Sobic008G109650 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic001G208166--Sobic004G080901 Sobic001G208166--Sobic001G209550 Sobic001G208166--Sobic002G059700 Sobic001G208166--Sobic001G070900 Sobic001G208166--Sobic007G173400 Sobic006G147101--Sobic001G209550 Sobic006G147101--Sobic002G059700 Sobic006G147101--Sobic001G208166 Sobic006G147101--Sobic002G162601 Sobic006G147101--Sobic008G109650 Sobic002G347850 Sobic002G347850 Sobic006G147101--Sobic002G347850 Sobic006G147101--Sobic001G230600 Sobic006G147101--Sobic002G070500 Sobic004G184600 Sobic004G184600 Sobic006G147101--Sobic004G184600 Sobic005G120101--Sobic009G163000 Sobic006G139501 Sobic006G139501 Sobic005G120101--Sobic006G139501 Sobic005G120101--Sobic001G230600 Sobic005G120101--Sobic002G162601 Sobic005G120101--Sobic001G070900 Sobic001G398100 Sobic001G398100 Sobic005G120101--Sobic001G398100 Sobic005G120101--Sobic002G180200 Sobic001G515350 Sobic001G515350 Sobic005G120101--Sobic001G515350 Sobic005G120101--Sobic001G208166 Sobic010G015400 Sobic010G015400 Sobic004G273550--Sobic010G015400 Sobic007G224700 Sobic007G224700 Sobic004G273550--Sobic007G224700 Sobic008G153300 Sobic008G153300 Sobic004G273550--Sobic008G153300 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic004G273550--Sobic006G118150 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic004G273550--Sobic007G077466 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic004G273550--Sobic002G274000 Sobic009G079700 Sobic009G079700 Sobic004G273550--Sobic009G079700 Sobic004G273550--Sobic009G183650 Sobic004G007200 Sobic004G007200 Sobic004G273550--Sobic004G007200 Sobic002G160300 Sobic002G160300 Sobic001G228500--Sobic002G160300 Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic001G228500--Sobic010G187950 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic001G228500--Sobic004G068600 Sobic001G228500--Sobic009G183650 Sobic001G228500--Sobic002G043201 Sobic010G019500 Sobic010G019500 Sobic001G228500--Sobic010G019500 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic001G228500--Sobic010G042300 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic001G228500--Sobic006G268100 Sobic001G228500--Sobic007G173400 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic009G183650--Sobic001G334400 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic009G183650--Sobic001G424650 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic009G183650--Sobic002G110600 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic009G183650--Sobic005G110553 Sobic009G183650--Sobic010G019500 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic009G183650--Sobic004G072201 Sobic009G183650--Sobic004G068600 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic009G183650--Sobic009G088300 Sobic009G183650--Sobic002G274000
Octagon: transcription factors


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