Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G157600.1
Synonym Sb07g023120
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YMC2
Pfam -
Panther DB PTHR33621 PTHR33621:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G03130 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g50960.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056929
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2D02G442600 , TraesCS2D02G442600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G230600 histidine kinase, putative, expressed -
2 Sobic.002G162601 - -
3 Sobic.002G049750 - -
4 Sobic.004G184600 - -
5 Sobic.006G147101 - -
6 Sobic.001G064400 expressed protein -
7 Sobic.009G043800 SbDFR4 expression was not detectable in the seedlings of either sorghum cultivar under our experimental conditions.(PubMedID : 20529887)@dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed K13082: bifunctional dihydroflavonol 4-reductase/flavanone 4-reductase
8 Sobic.002G191450 - -
9 Sobic.002G059700 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
10 Sobic.001G209550 - -
11 Sobic.001G208166 - -
12 Sobic.002G347850 - -
13 Sobic.010G034700 transferase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G120101 - -
15 Sobic.004G068900 cytochrome P450 71D10, putative, expressed -
16 Sobic.004G221800 DUF584 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.006G118850 - -
18 Sobic.007G146001 - -
19 Sobic.001G311400 - -
20 Sobic.001G070900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G157600 Sobic007G157600 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic007G157600--Sobic001G230600 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic007G157600--Sobic002G162601 Sobic002G049750 Sobic002G049750 Sobic007G157600--Sobic002G049750 Sobic004G184600 Sobic004G184600 Sobic007G157600--Sobic004G184600 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic007G157600--Sobic006G147101 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic007G157600--Sobic001G064400 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic007G157600--Sobic009G043800 Sobic002G191450 Sobic002G191450 Sobic007G157600--Sobic002G191450 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic007G157600--Sobic002G059700 Sobic001G230600--Sobic002G162601 Sobic001G230600--Sobic007G157600 Sobic001G230600--Sobic002G059700 Sobic001G230600--Sobic006G147101 Sobic005G134900 Sobic005G134900 Sobic001G230600--Sobic005G134900 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic001G230600--Sobic001G209550 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic001G230600--Sobic010G034700 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic001G230600--Sobic002G070500 Sobic001G230600--Sobic004G184600 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic002G162601--Sobic001G208166 Sobic002G162601--Sobic006G147101 Sobic002G162601--Sobic001G230600 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic002G162601--Sobic001G070900 Sobic002G162601--Sobic001G209550 Sobic002G162601--Sobic002G059700 Sobic002G162601--Sobic007G157600 Sobic002G162601--Sobic002G070500 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic002G162601--Sobic008G109650 Sobic002G049750--Sobic007G157600 Sobic002G049750--Sobic004G184600 Sobic002G049750--Sobic001G230600 Sobic002G049750--Sobic001G064400 Sobic002G049750--Sobic002G059700 Sobic002G049750--Sobic001G209550 Sobic002G049750--Sobic009G043800 Sobic002G049750--Sobic010G034700 Sobic002G049750--Sobic006G147101 Sobic004G184600--Sobic010G034700 Sobic004G184600--Sobic002G059700 Sobic004G184600--Sobic001G209550 Sobic004G184600--Sobic006G147101 Sobic004G184600--Sobic002G049750 Sobic004G184600--Sobic001G230600 Sobic004G184600--Sobic009G043800 Sobic004G184600--Sobic007G157600 Sobic002G347850 Sobic002G347850 Sobic004G184600--Sobic002G347850 Sobic006G147101--Sobic001G209550 Sobic006G147101--Sobic002G059700 Sobic006G147101--Sobic001G208166 Sobic006G147101--Sobic002G162601 Sobic006G147101--Sobic008G109650 Sobic006G147101--Sobic002G347850 Sobic006G147101--Sobic001G230600 Sobic006G147101--Sobic002G070500 Sobic006G147101--Sobic004G184600 Sobic001G064400--Sobic002G191450 Sobic001G064400--Sobic009G043800 Sobic002G114200 Sobic002G114200 Sobic001G064400--Sobic002G114200 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic001G064400--Sobic006G037500 Sobic004G221800 Sobic004G221800 Sobic001G064400--Sobic004G221800 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic001G064400--Sobic009G019400 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic001G064400--Sobic003G229900 Sobic007G007100 Sobic007G007100 Sobic001G064400--Sobic007G007100 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic001G064400--Sobic006G049633 Sobic009G043800--Sobic001G064400 Sobic009G043800--Sobic002G191450 Sobic009G043800--Sobic006G037500 Sobic009G043800--Sobic004G221800 Sobic009G043800--Sobic002G114200 Sobic009G043800--Sobic009G019400 Sobic009G043800--Sobic003G229900 Sobic009G043800--Sobic007G007100 Sobic009G043800--Sobic006G049633 Sobic002G191450--Sobic001G064400 Sobic002G191450--Sobic009G043800 Sobic002G191450--Sobic002G114200 Sobic002G191450--Sobic006G037500 Sobic002G191450--Sobic004G221800 Sobic002G191450--Sobic009G019400 Sobic002G191450--Sobic003G229900 Sobic002G191450--Sobic007G007100 Sobic002G191450--Sobic006G049633 Sobic002G059700--Sobic001G209550 Sobic002G059700--Sobic002G070500 Sobic002G059700--Sobic005G134900 Sobic002G059700--Sobic006G147101 Sobic002G059700--Sobic002G347850 Sobic002G059700--Sobic008G109650 Sobic002G059700--Sobic001G208166 Sobic002G059700--Sobic001G230600 Sobic002G059700--Sobic010G034700
Octagon: transcription factors


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