Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G120101.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIU2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014364
Brachypodium PNT66132
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G163000 - -
2 Sobic.006G139501 - -
3 Sobic.001G230600 histidine kinase, putative, expressed -
4 Sobic.002G162601 - -
5 Sobic.001G070900 expressed protein -
6 Sobic.001G398100 "MYB transcription factor ,phlobaphenes biosynthesis,seed color"(PubMedID : 20083611)@MYB family transcription factor, putative, expressed -
7 Sobic.002G180200 - -
8 Sobic.001G515350 - -
9 Sobic.001G208166 - -
10 Sobic.003G304000 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
11 Sobic.004G273550 - -
12 Sobic.007G157600 expressed protein -
13 Sobic.007G146001 - -
14 Sobic.006G147101 - -
15 Sobic.003G301950 - -
16 Sobic.010G034700 transferase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G108401 - -
18 Sobic.007G137750 - -
19 Sobic.006G140450 - -
20 Sobic.007G138200 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G120101 Sobic005G120101 Sobic009G163000 Sobic009G163000 Sobic005G120101--Sobic009G163000 Sobic006G139501 Sobic006G139501 Sobic005G120101--Sobic006G139501 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic005G120101--Sobic001G230600 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic005G120101--Sobic002G162601 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic005G120101--Sobic001G070900 Sobic001G398100 Sobic001G398100 Sobic005G120101--Sobic001G398100 Sobic002G180200 Sobic002G180200 Sobic005G120101--Sobic002G180200 Sobic001G515350 Sobic001G515350 Sobic005G120101--Sobic001G515350 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic005G120101--Sobic001G208166 Sobic003G108401 Sobic003G108401 Sobic009G163000--Sobic003G108401 Sobic010G164600 Sobic010G164600 Sobic009G163000--Sobic010G164600 Sobic009G163000--Sobic002G180200 Sobic009G163000--Sobic001G070900 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic009G163000--Sobic003G003900 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic009G163000--Sobic004G343733 Sobic009G163000--Sobic005G120101 Sobic006G128450 Sobic006G128450 Sobic009G163000--Sobic006G128450 Sobic008G052700 Sobic008G052700 Sobic009G163000--Sobic008G052700 Sobic006G270300 Sobic006G270300 Sobic006G139501--Sobic006G270300 Sobic002G123700 Sobic002G123700 Sobic006G139501--Sobic002G123700 Sobic006G139501--Sobic005G120101 Sobic003G030200 Sobic003G030200 Sobic006G139501--Sobic003G030200 Sobic003G301950 Sobic003G301950 Sobic006G139501--Sobic003G301950 Sobic004G305300 Sobic004G305300 Sobic006G139501--Sobic004G305300 Sobic003G118500 Sobic003G118500 Sobic006G139501--Sobic003G118500 Sobic003G079600 Sobic003G079600 Sobic006G139501--Sobic003G079600 Sobic004G149000 Sobic004G149000 Sobic006G139501--Sobic004G149000 Sobic001G230600--Sobic002G162601 Sobic007G157600 Sobic007G157600 Sobic001G230600--Sobic007G157600 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic001G230600--Sobic002G059700 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic001G230600--Sobic006G147101 Sobic005G134900 Sobic005G134900 Sobic001G230600--Sobic005G134900 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic001G230600--Sobic001G209550 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic001G230600--Sobic010G034700 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic001G230600--Sobic002G070500 Sobic004G184600 Sobic004G184600 Sobic001G230600--Sobic004G184600 Sobic002G162601--Sobic001G208166 Sobic002G162601--Sobic006G147101 Sobic002G162601--Sobic001G230600 Sobic002G162601--Sobic001G070900 Sobic002G162601--Sobic001G209550 Sobic002G162601--Sobic002G059700 Sobic002G162601--Sobic007G157600 Sobic002G162601--Sobic002G070500 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic002G162601--Sobic008G109650 Sobic001G070900--Sobic002G180200 Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic001G070900--Sobic010G210400 Sobic003G390000 Sobic003G390000 Sobic001G070900--Sobic003G390000 Sobic001G070900--Sobic004G343733 Sobic001G070900--Sobic001G208166 Sobic001G070900--Sobic002G162601 Sobic001G070900--Sobic002G070500 Sobic001G070900--Sobic003G108401 Sobic001G070900--Sobic009G163000 Sobic007G138200 Sobic007G138200 Sobic001G398100--Sobic007G138200 Sobic001G398100--Sobic001G515350 Sobic008G068133 Sobic008G068133 Sobic001G398100--Sobic008G068133 Sobic006G110101 Sobic006G110101 Sobic001G398100--Sobic006G110101 Sobic004G095400 Sobic004G095400 Sobic001G398100--Sobic004G095400 Sobic001G369550 Sobic001G369550 Sobic001G398100--Sobic001G369550 Sobic001G398100--Sobic005G120101 Sobic003G213500 Sobic003G213500 Sobic001G398100--Sobic003G213500 Sobic001G398100--Sobic001G230600 Sobic002G180200--Sobic006G128450 Sobic006G118850 Sobic006G118850 Sobic002G180200--Sobic006G118850 Sobic002G180200--Sobic003G108401 Sobic002G180200--Sobic004G343733 Sobic002G180200--Sobic001G070900 Sobic002G180200--Sobic009G163000 Sobic001G311400 Sobic001G311400 Sobic002G180200--Sobic001G311400 Sobic002G076450 Sobic002G076450 Sobic002G180200--Sobic002G076450 Sobic002G180200--Sobic001G208166 Sobic001G515350--Sobic007G138200 Sobic001G515350--Sobic004G095400 Sobic001G515350--Sobic001G398100 Sobic003G443601 Sobic003G443601 Sobic001G515350--Sobic003G443601 Sobic002G244901 Sobic002G244901 Sobic001G515350--Sobic002G244901 Sobic004G358150 Sobic004G358150 Sobic001G515350--Sobic004G358150 Sobic003G375800 Sobic003G375800 Sobic001G515350--Sobic003G375800 Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic001G515350--Sobic004G273550 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic001G515350--Sobic001G334400 Sobic001G208166--Sobic006G147101 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G162601 Sobic001G208166--Sobic008G109650 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic001G208166--Sobic004G080901 Sobic001G208166--Sobic001G209550 Sobic001G208166--Sobic002G059700 Sobic001G208166--Sobic001G070900 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G208166--Sobic007G173400
Octagon: transcription factors


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