Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G070900.1,Sobic.001G070900.2
Synonym Sb01g006400
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QHP1 , A0A1B6QHP6 , Q1KSC1
Pfam -
Panther DB PTHR33318 PTHR33318:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G30820 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g56590.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016670 , Zm00025a008397
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G099380.2 , HORVU5Hr1G099380.3 , HORVU5Hr1G099380.1 , HORVU5Hr1G099380.6 , HORVU5Hr1G099380.4 , HORVU5Hr1G099380.5
Wheat TraesCS5A02G412000 , TraesCS5D02G421200
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G180200 - -
2 Sobic.010G210400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
3 Sobic.003G390000 cytochrome P450, putative, expressed -
4 Sobic.004G343733 - -
5 Sobic.001G208166 - -
6 Sobic.002G162601 - -
7 Sobic.002G070500 anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.003G108401 - -
9 Sobic.009G163000 - -
10 Sobic.002G059700 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
11 Sobic.001G209550 - -
12 Sobic.001G477500 - -
13 Sobic.007G173400 - -
14 Sobic.004G347833 - -
15 Sobic.009G079700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G118850 - -
17 Sobic.004G007166 - -
18 Sobic.005G120101 - -
19 Sobic.006G147101 - -
20 Sobic.004G272000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic002G180200 Sobic002G180200 Sobic001G070900--Sobic002G180200 Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic001G070900--Sobic010G210400 Sobic003G390000 Sobic003G390000 Sobic001G070900--Sobic003G390000 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic001G070900--Sobic004G343733 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic001G070900--Sobic001G208166 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic001G070900--Sobic002G162601 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic001G070900--Sobic002G070500 Sobic003G108401 Sobic003G108401 Sobic001G070900--Sobic003G108401 Sobic009G163000 Sobic009G163000 Sobic001G070900--Sobic009G163000 Sobic006G128450 Sobic006G128450 Sobic002G180200--Sobic006G128450 Sobic006G118850 Sobic006G118850 Sobic002G180200--Sobic006G118850 Sobic002G180200--Sobic003G108401 Sobic002G180200--Sobic004G343733 Sobic002G180200--Sobic001G070900 Sobic002G180200--Sobic009G163000 Sobic001G311400 Sobic001G311400 Sobic002G180200--Sobic001G311400 Sobic002G076450 Sobic002G076450 Sobic002G180200--Sobic002G076450 Sobic002G180200--Sobic001G208166 Sobic009G079700 Sobic009G079700 Sobic010G210400--Sobic009G079700 Sobic010G210400--Sobic001G070900 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic010G210400--Sobic004G272000 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic010G210400--Sobic004G089801 Sobic004G007200 Sobic004G007200 Sobic010G210400--Sobic004G007200 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic010G210400--Sobic002G365300 Sobic010G210400--Sobic004G343733 Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic010G210400--Sobic010G187950 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic010G210400--Sobic002G215600 Sobic002G221000 Sobic002G221000 Sobic003G390000--Sobic002G221000 Sobic003G390000--Sobic001G070900 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic003G390000--Sobic004G007166 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic003G390000--Sobic001G195866 Sobic001G477500 Sobic001G477500 Sobic003G390000--Sobic001G477500 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic003G390000--Sobic008G176266 Sobic001G529301 Sobic001G529301 Sobic003G390000--Sobic001G529301 Sobic003G390000--Sobic002G070500 Sobic003G390000--Sobic004G272000 Sobic010G054400 Sobic010G054400 Sobic004G343733--Sobic010G054400 Sobic004G343733--Sobic002G180200 Sobic009G047033 Sobic009G047033 Sobic004G343733--Sobic009G047033 Sobic004G343733--Sobic001G070900 Sobic007G182400 Sobic007G182400 Sobic004G343733--Sobic007G182400 Sobic010G213100 Sobic010G213100 Sobic004G343733--Sobic010G213100 Sobic001G062000 Sobic001G062000 Sobic004G343733--Sobic001G062000 Sobic004G343733--Sobic009G079700 Sobic003G091900 Sobic003G091900 Sobic004G343733--Sobic003G091900 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic001G208166--Sobic006G147101 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G043201 Sobic001G208166--Sobic002G162601 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic001G208166--Sobic008G109650 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic001G208166--Sobic004G080901 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic001G208166--Sobic001G209550 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic001G208166--Sobic002G059700 Sobic001G208166--Sobic001G070900 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G208166--Sobic007G173400 Sobic002G162601--Sobic001G208166 Sobic002G162601--Sobic006G147101 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic002G162601--Sobic001G230600 Sobic002G162601--Sobic001G070900 Sobic002G162601--Sobic001G209550 Sobic002G162601--Sobic002G059700 Sobic007G157600 Sobic007G157600 Sobic002G162601--Sobic007G157600 Sobic002G162601--Sobic002G070500 Sobic002G162601--Sobic008G109650 Sobic002G070500--Sobic002G059700 Sobic002G070500--Sobic004G007166 Sobic002G070500--Sobic001G209550 Sobic005G134900 Sobic005G134900 Sobic002G070500--Sobic005G134900 Sobic001G210101 Sobic001G210101 Sobic002G070500--Sobic001G210101 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic002G070500--Sobic008G187450 Sobic002G070500--Sobic008G176266 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic002G070500--Sobic001G387400 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic002G070500--Sobic009G028650 Sobic003G108401--Sobic009G163000 Sobic003G108401--Sobic006G128450 Sobic003G108401--Sobic002G180200 Sobic003G108401--Sobic004G343733 Sobic003G108401--Sobic006G118850 Sobic010G164600 Sobic010G164600 Sobic003G108401--Sobic010G164600 Sobic003G108401--Sobic001G070900 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic003G108401--Sobic010G034700 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic003G108401--Sobic003G003900 Sobic009G163000--Sobic003G108401 Sobic009G163000--Sobic010G164600 Sobic009G163000--Sobic002G180200 Sobic009G163000--Sobic001G070900 Sobic009G163000--Sobic003G003900 Sobic009G163000--Sobic004G343733 Sobic005G120101 Sobic005G120101 Sobic009G163000--Sobic005G120101 Sobic009G163000--Sobic006G128450 Sobic008G052700 Sobic008G052700 Sobic009G163000--Sobic008G052700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.