Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G477500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QQ18
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G390000 cytochrome P450, putative, expressed -
2 Sobic.002G221000 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G070500 anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
4 Sobic.001G209550 - -
5 Sobic.001G070900 expressed protein -
6 Sobic.002G059700 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
7 Sobic.004G007166 - -
8 Sobic.004G272000 - -
9 Sobic.008G176266 - -
10 Sobic.008G109650 - -
11 Sobic.003G091800 seven in absentia protein family protein, expressed -
12 Sobic.007G173400 - -
13 Sobic.001G208166 - -
14 Sobic.002G321000 - -
15 Sobic.010G262950 - -
16 Sobic.003G245000 expressed protein -
17 Sobic.004G080901 - -
18 Sobic.010G210400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
19 Sobic.002G180200 - -
20 Sobic.002G162601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G477500 Sobic001G477500 Sobic003G390000 Sobic003G390000 Sobic001G477500--Sobic003G390000 Sobic002G221000 Sobic002G221000 Sobic001G477500--Sobic002G221000 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic001G477500--Sobic002G070500 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic001G477500--Sobic001G209550 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic001G477500--Sobic001G070900 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic001G477500--Sobic002G059700 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic001G477500--Sobic004G007166 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic001G477500--Sobic004G272000 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic001G477500--Sobic008G176266 Sobic003G390000--Sobic002G221000 Sobic003G390000--Sobic001G070900 Sobic003G390000--Sobic004G007166 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic003G390000--Sobic001G195866 Sobic003G390000--Sobic001G477500 Sobic003G390000--Sobic008G176266 Sobic001G529301 Sobic001G529301 Sobic003G390000--Sobic001G529301 Sobic003G390000--Sobic002G070500 Sobic003G390000--Sobic004G272000 Sobic008G154500 Sobic008G154500 Sobic002G221000--Sobic008G154500 Sobic002G221000--Sobic004G272000 Sobic002G221000--Sobic003G390000 Sobic001G403900 Sobic001G403900 Sobic002G221000--Sobic001G403900 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic002G221000--Sobic001G005100 Sobic002G221000--Sobic001G195866 Sobic002G221000--Sobic008G176266 Sobic006G220100 Sobic006G220100 Sobic002G221000--Sobic006G220100 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic002G221000--Sobic008G026500 Sobic002G070500--Sobic002G059700 Sobic002G070500--Sobic004G007166 Sobic002G070500--Sobic001G209550 Sobic005G134900 Sobic005G134900 Sobic002G070500--Sobic005G134900 Sobic001G210101 Sobic001G210101 Sobic002G070500--Sobic001G210101 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic002G070500--Sobic008G187450 Sobic002G070500--Sobic008G176266 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic002G070500--Sobic001G387400 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic002G070500--Sobic009G028650 Sobic001G209550--Sobic002G059700 Sobic001G209550--Sobic002G070500 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic001G209550--Sobic006G147101 Sobic002G347850 Sobic002G347850 Sobic001G209550--Sobic002G347850 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic001G209550--Sobic008G109650 Sobic001G209550--Sobic005G134900 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic001G209550--Sobic001G208166 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic001G209550--Sobic004G080901 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic001G209550--Sobic002G162601 Sobic002G180200 Sobic002G180200 Sobic001G070900--Sobic002G180200 Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic001G070900--Sobic010G210400 Sobic001G070900--Sobic003G390000 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic001G070900--Sobic004G343733 Sobic001G070900--Sobic001G208166 Sobic001G070900--Sobic002G162601 Sobic001G070900--Sobic002G070500 Sobic003G108401 Sobic003G108401 Sobic001G070900--Sobic003G108401 Sobic009G163000 Sobic009G163000 Sobic001G070900--Sobic009G163000 Sobic002G059700--Sobic001G209550 Sobic002G059700--Sobic002G070500 Sobic002G059700--Sobic005G134900 Sobic002G059700--Sobic006G147101 Sobic002G059700--Sobic002G347850 Sobic002G059700--Sobic008G109650 Sobic002G059700--Sobic001G208166 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic002G059700--Sobic001G230600 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic002G059700--Sobic010G034700 Sobic004G007166--Sobic008G176266 Sobic004G007166--Sobic001G387400 Sobic004G007166--Sobic008G187450 Sobic004G007166--Sobic002G070500 Sobic004G007166--Sobic004G272000 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic004G007166--Sobic007G203600 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic004G007166--Sobic007G043050 Sobic004G007166--Sobic009G028650 Sobic001G174200 Sobic001G174200 Sobic004G007166--Sobic001G174200 Sobic004G272000--Sobic008G026500 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic004G272000--Sobic004G089801 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic004G272000--Sobic001G084133 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic004G272000--Sobic005G230900 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic004G272000--Sobic002G365300 Sobic004G272000--Sobic002G221000 Sobic004G272000--Sobic004G007166 Sobic004G272000--Sobic001G005100 Sobic004G272000--Sobic008G176266 Sobic008G176266--Sobic004G007166 Sobic008G176266--Sobic004G272000 Sobic008G176266--Sobic002G221000 Sobic008G176266--Sobic008G187450 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic008G176266--Sobic003G340500 Sobic008G176266--Sobic008G026500 Sobic008G176266--Sobic001G387400 Sobic008G176266--Sobic002G070500 Sobic008G176266--Sobic007G203600
Octagon: transcription factors


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