Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G272000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YRZ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G026500 - -
2 Sobic.004G089801 - -
3 Sobic.001G084133 - -
4 Sobic.005G230900 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G365300 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G221000 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G007166 - -
8 Sobic.001G005100 lipid binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G176266 - -
10 Sobic.003G091800 seven in absentia protein family protein, expressed -
11 Sobic.007G173400 - -
12 Sobic.006G222200 MBTB7 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
13 Sobic.004G347833 - -
14 Sobic.001G523050 - -
15 Sobic.010G210400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
16 Sobic.002G033100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
17 Sobic.009G028650 - -
18 Sobic.002G321000 - -
19 Sobic.001G387400 expressed protein -
20 Sobic.008G109650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic004G272000--Sobic008G026500 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic004G272000--Sobic004G089801 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic004G272000--Sobic001G084133 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic004G272000--Sobic005G230900 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic004G272000--Sobic002G365300 Sobic002G221000 Sobic002G221000 Sobic004G272000--Sobic002G221000 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic004G272000--Sobic004G007166 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic004G272000--Sobic001G005100 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic004G272000--Sobic008G176266 Sobic008G026500--Sobic004G272000 Sobic001G523050 Sobic001G523050 Sobic008G026500--Sobic001G523050 Sobic008G026500--Sobic002G365300 Sobic008G026500--Sobic005G230900 Sobic008G026500--Sobic008G176266 Sobic008G026500--Sobic002G221000 Sobic001G221700 Sobic001G221700 Sobic008G026500--Sobic001G221700 Sobic008G026500--Sobic004G089801 Sobic008G026500--Sobic001G005100 Sobic004G089801--Sobic001G084133 Sobic004G089801--Sobic004G272000 Sobic004G089801--Sobic001G005100 Sobic003G356500 Sobic003G356500 Sobic004G089801--Sobic003G356500 Sobic003G059500 Sobic003G059500 Sobic004G089801--Sobic003G059500 Sobic004G089801--Sobic002G365300 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic004G089801--Sobic006G222200 Sobic004G089801--Sobic005G230900 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic004G089801--Sobic002G033100 Sobic001G084133--Sobic004G089801 Sobic001G084133--Sobic005G230900 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic001G084133--Sobic001G421450 Sobic001G084133--Sobic006G222200 Sobic001G084133--Sobic003G356500 Sobic003G193900 Sobic003G193900 Sobic001G084133--Sobic003G193900 Sobic001G084133--Sobic004G272000 Sobic001G084133--Sobic002G033100 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic001G084133--Sobic003G245000 Sobic005G230900--Sobic001G084133 Sobic003G406120 Sobic003G406120 Sobic005G230900--Sobic003G406120 Sobic005G230900--Sobic004G272000 Sobic005G230900--Sobic004G089801 Sobic005G230900--Sobic008G026500 Sobic005G230900--Sobic002G365300 Sobic005G230900--Sobic001G421450 Sobic006G238900 Sobic006G238900 Sobic005G230900--Sobic006G238900 Sobic005G230900--Sobic003G245000 Sobic002G365300--Sobic008G026500 Sobic002G365300--Sobic004G089801 Sobic002G365300--Sobic001G523050 Sobic002G365300--Sobic004G272000 Sobic002G365300--Sobic001G005100 Sobic002G365300--Sobic003G059500 Sobic010G000401 Sobic010G000401 Sobic002G365300--Sobic010G000401 Sobic002G365300--Sobic001G084133 Sobic002G365300--Sobic005G230900 Sobic008G154500 Sobic008G154500 Sobic002G221000--Sobic008G154500 Sobic002G221000--Sobic004G272000 Sobic003G390000 Sobic003G390000 Sobic002G221000--Sobic003G390000 Sobic001G403900 Sobic001G403900 Sobic002G221000--Sobic001G403900 Sobic002G221000--Sobic001G005100 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic002G221000--Sobic001G195866 Sobic002G221000--Sobic008G176266 Sobic006G220100 Sobic006G220100 Sobic002G221000--Sobic006G220100 Sobic002G221000--Sobic008G026500 Sobic004G007166--Sobic008G176266 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic004G007166--Sobic001G387400 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic004G007166--Sobic008G187450 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic004G007166--Sobic002G070500 Sobic004G007166--Sobic004G272000 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic004G007166--Sobic007G203600 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic004G007166--Sobic007G043050 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic004G007166--Sobic009G028650 Sobic001G174200 Sobic001G174200 Sobic004G007166--Sobic001G174200 Sobic003G278800 Sobic003G278800 Sobic001G005100--Sobic003G278800 Sobic001G005100--Sobic002G033100 Sobic002G162900 Sobic002G162900 Sobic001G005100--Sobic002G162900 Sobic001G005100--Sobic001G403900 Sobic001G005100--Sobic006G222200 Sobic001G005100--Sobic010G000401 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic001G005100--Sobic001G221750 Sobic001G005100--Sobic004G089801 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic001G005100--Sobic004G055400 Sobic008G176266--Sobic004G007166 Sobic008G176266--Sobic004G272000 Sobic008G176266--Sobic002G221000 Sobic008G176266--Sobic008G187450 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic008G176266--Sobic003G340500 Sobic008G176266--Sobic008G026500 Sobic008G176266--Sobic001G387400 Sobic008G176266--Sobic002G070500 Sobic008G176266--Sobic007G203600
Octagon: transcription factors


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