Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G523050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SBZ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G026500 - -
2 Sobic.002G365300 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
3 Sobic.010G129900 expressed protein -
4 Sobic.001G403900 ECAGL1 - ECA1 gametogenesis related family protein precursor, expressed -
5 Sobic.001G221750 - -
6 Sobic.004G055400 - -
7 Sobic.006G222200 MBTB7 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
8 Sobic.001G005100 lipid binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G272000 - -
10 Sobic.007G069750 - -
11 Sobic.002G235000 expressed protein -
12 Sobic.002G162900 - -
13 Sobic.001G112300 OsCam3 - Calmodulin, expressed K02183: calmodulin
14 Sobic.002G033100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
15 Sobic.002G237400 expressed protein -
16 Sobic.006G223850 - -
17 Sobic.005G230900 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G154500 expressed protein -
19 Sobic.005G199500 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
20 Sobic.002G268250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G523050 Sobic001G523050 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic001G523050--Sobic008G026500 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic001G523050--Sobic002G365300 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic001G523050--Sobic010G129900 Sobic001G403900 Sobic001G403900 Sobic001G523050--Sobic001G403900 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic001G523050--Sobic001G221750 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic001G523050--Sobic004G055400 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic001G523050--Sobic006G222200 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic001G523050--Sobic001G005100 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic001G523050--Sobic004G272000 Sobic008G026500--Sobic004G272000 Sobic008G026500--Sobic001G523050 Sobic008G026500--Sobic002G365300 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic008G026500--Sobic005G230900 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic008G026500--Sobic008G176266 Sobic002G221000 Sobic002G221000 Sobic008G026500--Sobic002G221000 Sobic001G221700 Sobic001G221700 Sobic008G026500--Sobic001G221700 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic008G026500--Sobic004G089801 Sobic008G026500--Sobic001G005100 Sobic002G365300--Sobic008G026500 Sobic002G365300--Sobic004G089801 Sobic002G365300--Sobic001G523050 Sobic002G365300--Sobic004G272000 Sobic002G365300--Sobic001G005100 Sobic003G059500 Sobic003G059500 Sobic002G365300--Sobic003G059500 Sobic010G000401 Sobic010G000401 Sobic002G365300--Sobic010G000401 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic002G365300--Sobic001G084133 Sobic002G365300--Sobic005G230900 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic010G129900--Sobic007G069750 Sobic010G129900--Sobic004G055400 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic010G129900--Sobic005G199500 Sobic001G112300 Sobic001G112300 Sobic010G129900--Sobic001G112300 Sobic010G129900--Sobic001G403900 Sobic002G237400 Sobic002G237400 Sobic010G129900--Sobic002G237400 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic010G129900--Sobic002G213050 Sobic010G129900--Sobic001G221750 Sobic002G162900 Sobic002G162900 Sobic010G129900--Sobic002G162900 Sobic008G154500 Sobic008G154500 Sobic001G403900--Sobic008G154500 Sobic001G403900--Sobic010G129900 Sobic001G403900--Sobic001G005100 Sobic001G403900--Sobic004G055400 Sobic001G403900--Sobic007G069750 Sobic001G403900--Sobic002G162900 Sobic006G223850 Sobic006G223850 Sobic001G403900--Sobic006G223850 Sobic001G403900--Sobic005G199500 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic001G403900--Sobic006G107332 Sobic001G221750--Sobic006G222200 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic001G221750--Sobic002G033100 Sobic001G221750--Sobic010G129900 Sobic001G221750--Sobic001G112300 Sobic006G155400 Sobic006G155400 Sobic001G221750--Sobic006G155400 Sobic001G221750--Sobic001G005100 Sobic005G150250 Sobic005G150250 Sobic001G221750--Sobic005G150250 Sobic001G221750--Sobic007G069750 Sobic001G221750--Sobic002G237400 Sobic004G055400--Sobic010G129900 Sobic004G055400--Sobic002G162900 Sobic004G055400--Sobic007G069750 Sobic004G055400--Sobic005G199500 Sobic003G278800 Sobic003G278800 Sobic004G055400--Sobic003G278800 Sobic010G083100 Sobic010G083100 Sobic004G055400--Sobic010G083100 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic004G055400--Sobic006G018500 Sobic004G055400--Sobic001G112300 Sobic004G055400--Sobic002G213050 Sobic006G222200--Sobic001G221750 Sobic006G222200--Sobic005G150250 Sobic006G222200--Sobic002G033100 Sobic006G222200--Sobic006G155400 Sobic006G222200--Sobic001G005100 Sobic006G222200--Sobic010G129900 Sobic006G222200--Sobic001G112300 Sobic006G222200--Sobic001G084133 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic006G222200--Sobic003G245000 Sobic001G005100--Sobic003G278800 Sobic001G005100--Sobic002G033100 Sobic001G005100--Sobic002G162900 Sobic001G005100--Sobic001G403900 Sobic001G005100--Sobic006G222200 Sobic001G005100--Sobic010G000401 Sobic001G005100--Sobic001G221750 Sobic001G005100--Sobic004G089801 Sobic001G005100--Sobic004G055400 Sobic004G272000--Sobic008G026500 Sobic004G272000--Sobic004G089801 Sobic004G272000--Sobic001G084133 Sobic004G272000--Sobic005G230900 Sobic004G272000--Sobic002G365300 Sobic004G272000--Sobic002G221000 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic004G272000--Sobic004G007166 Sobic004G272000--Sobic001G005100 Sobic004G272000--Sobic008G176266
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.