Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G154500.1
Synonym Sb08g020370
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R6X6
Pfam PF04043
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004857; enzyme inhibitor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g40760.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G403900 ECAGL1 - ECA1 gametogenesis related family protein precursor, expressed -
2 Sobic.002G221000 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G107332 - -
4 Sobic.001G005100 lipid binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.006G220100 - -
6 Sobic.002G185000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed -
7 Sobic.010G129900 expressed protein -
8 Sobic.001G195866 - -
9 Sobic.004G055400 - -
10 Sobic.001G221750 - -
11 Sobic.010G083100 CXE carboxylesterase, putative, expressed -
12 Sobic.007G069750 - -
13 Sobic.002G162900 - -
14 Sobic.005G199500 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
15 Sobic.001G055300 expressed protein -
16 Sobic.001G418300 - -
17 Sobic.006G281300 - -
18 Sobic.006G223850 - -
19 Sobic.008G026500 - -
20 Sobic.001G523050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G154500 Sobic008G154500 Sobic001G403900 Sobic001G403900 Sobic008G154500--Sobic001G403900 Sobic002G221000 Sobic002G221000 Sobic008G154500--Sobic002G221000 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic008G154500--Sobic006G107332 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic008G154500--Sobic001G005100 Sobic006G220100 Sobic006G220100 Sobic008G154500--Sobic006G220100 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic008G154500--Sobic002G185000 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic008G154500--Sobic010G129900 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic008G154500--Sobic001G195866 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic008G154500--Sobic004G055400 Sobic001G403900--Sobic008G154500 Sobic001G403900--Sobic010G129900 Sobic001G403900--Sobic001G005100 Sobic001G403900--Sobic004G055400 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic001G403900--Sobic007G069750 Sobic002G162900 Sobic002G162900 Sobic001G403900--Sobic002G162900 Sobic006G223850 Sobic006G223850 Sobic001G403900--Sobic006G223850 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic001G403900--Sobic005G199500 Sobic001G403900--Sobic006G107332 Sobic002G221000--Sobic008G154500 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic002G221000--Sobic004G272000 Sobic003G390000 Sobic003G390000 Sobic002G221000--Sobic003G390000 Sobic002G221000--Sobic001G403900 Sobic002G221000--Sobic001G005100 Sobic002G221000--Sobic001G195866 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic002G221000--Sobic008G176266 Sobic002G221000--Sobic006G220100 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic002G221000--Sobic008G026500 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic006G107332--Sobic001G055300 Sobic006G107332--Sobic002G185000 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic006G107332--Sobic003G372950 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic006G107332--Sobic005G057600 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic006G107332--Sobic004G286450 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic006G107332--Sobic003G064000 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic006G107332--Sobic007G059800 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic006G107332--Sobic008G154200 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic006G107332--Sobic004G201200 Sobic003G278800 Sobic003G278800 Sobic001G005100--Sobic003G278800 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic001G005100--Sobic002G033100 Sobic001G005100--Sobic002G162900 Sobic001G005100--Sobic001G403900 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic001G005100--Sobic006G222200 Sobic010G000401 Sobic010G000401 Sobic001G005100--Sobic010G000401 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic001G005100--Sobic001G221750 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic001G005100--Sobic004G089801 Sobic001G005100--Sobic004G055400 Sobic006G220100--Sobic008G154500 Sobic006G220100--Sobic002G221000 Sobic006G220100--Sobic001G403900 Sobic006G220100--Sobic001G005100 Sobic006G220100--Sobic004G272000 Sobic006G220100--Sobic004G055400 Sobic006G220100--Sobic008G176266 Sobic006G220100--Sobic010G129900 Sobic006G220100--Sobic001G221750 Sobic002G185000--Sobic006G107332 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic002G185000--Sobic001G418300 Sobic002G185000--Sobic001G055300 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic002G185000--Sobic001G025201 Sobic002G185000--Sobic007G059800 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic002G185000--Sobic010G133800 Sobic002G185000--Sobic003G372950 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic002G185000--Sobic004G026900 Sobic002G185000--Sobic004G201200 Sobic010G129900--Sobic007G069750 Sobic010G129900--Sobic004G055400 Sobic010G129900--Sobic005G199500 Sobic001G112300 Sobic001G112300 Sobic010G129900--Sobic001G112300 Sobic010G129900--Sobic001G403900 Sobic002G237400 Sobic002G237400 Sobic010G129900--Sobic002G237400 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic010G129900--Sobic002G213050 Sobic010G129900--Sobic001G221750 Sobic010G129900--Sobic002G162900 Sobic009G218450 Sobic009G218450 Sobic001G195866--Sobic009G218450 Sobic010G135700 Sobic010G135700 Sobic001G195866--Sobic010G135700 Sobic001G221700 Sobic001G221700 Sobic001G195866--Sobic001G221700 Sobic003G348300 Sobic003G348300 Sobic001G195866--Sobic003G348300 Sobic001G195866--Sobic002G221000 Sobic002G262250 Sobic002G262250 Sobic001G195866--Sobic002G262250 Sobic001G195866--Sobic008G154500 Sobic003G217566 Sobic003G217566 Sobic001G195866--Sobic003G217566 Sobic001G486400 Sobic001G486400 Sobic001G195866--Sobic001G486400 Sobic004G055400--Sobic010G129900 Sobic004G055400--Sobic002G162900 Sobic004G055400--Sobic007G069750 Sobic004G055400--Sobic005G199500 Sobic004G055400--Sobic003G278800 Sobic010G083100 Sobic010G083100 Sobic004G055400--Sobic010G083100 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic004G055400--Sobic006G018500 Sobic004G055400--Sobic001G112300 Sobic004G055400--Sobic002G213050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.