Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G210400.1
Synonym Sb10g025710
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
-
UniProt C5Z738
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G079700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G070900 expressed protein -
3 Sobic.004G272000 - -
4 Sobic.004G089801 - -
5 Sobic.004G007200 - -
6 Sobic.002G365300 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G343733 - -
8 Sobic.010G187950 - -
9 Sobic.002G215600 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed -
10 Sobic.007G173400 - -
11 Sobic.003G059500 verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G139900 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.007G187500 - -
14 Sobic.002G221000 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G347833 - -
16 Sobic.001G005100 lipid binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G167500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.004G045000 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
19 Sobic.003G390000 cytochrome P450, putative, expressed -
20 Sobic.010G000401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic009G079700 Sobic009G079700 Sobic010G210400--Sobic009G079700 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic010G210400--Sobic001G070900 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic010G210400--Sobic004G272000 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic010G210400--Sobic004G089801 Sobic004G007200 Sobic004G007200 Sobic010G210400--Sobic004G007200 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic010G210400--Sobic002G365300 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic010G210400--Sobic004G343733 Sobic010G187950 Sobic010G187950 Sobic010G210400--Sobic010G187950 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic010G210400--Sobic002G215600 Sobic009G079700--Sobic010G210400 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic009G079700--Sobic005G110553 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic009G079700--Sobic001G334400 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic009G079700--Sobic006G268100 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic009G079700--Sobic002G274000 Sobic009G079700--Sobic004G007200 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic009G079700--Sobic009G183650 Sobic009G079700--Sobic004G343733 Sobic008G153300 Sobic008G153300 Sobic009G079700--Sobic008G153300 Sobic002G180200 Sobic002G180200 Sobic001G070900--Sobic002G180200 Sobic001G070900--Sobic010G210400 Sobic003G390000 Sobic003G390000 Sobic001G070900--Sobic003G390000 Sobic001G070900--Sobic004G343733 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic001G070900--Sobic001G208166 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic001G070900--Sobic002G162601 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic001G070900--Sobic002G070500 Sobic003G108401 Sobic003G108401 Sobic001G070900--Sobic003G108401 Sobic009G163000 Sobic009G163000 Sobic001G070900--Sobic009G163000 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic004G272000--Sobic008G026500 Sobic004G272000--Sobic004G089801 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic004G272000--Sobic001G084133 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic004G272000--Sobic005G230900 Sobic004G272000--Sobic002G365300 Sobic002G221000 Sobic002G221000 Sobic004G272000--Sobic002G221000 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic004G272000--Sobic004G007166 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic004G272000--Sobic001G005100 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic004G272000--Sobic008G176266 Sobic004G089801--Sobic001G084133 Sobic004G089801--Sobic004G272000 Sobic004G089801--Sobic001G005100 Sobic003G356500 Sobic003G356500 Sobic004G089801--Sobic003G356500 Sobic003G059500 Sobic003G059500 Sobic004G089801--Sobic003G059500 Sobic004G089801--Sobic002G365300 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic004G089801--Sobic006G222200 Sobic004G089801--Sobic005G230900 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic004G089801--Sobic002G033100 Sobic006G024400 Sobic006G024400 Sobic004G007200--Sobic006G024400 Sobic003G234300 Sobic003G234300 Sobic004G007200--Sobic003G234300 Sobic004G007200--Sobic009G079700 Sobic002G037700 Sobic002G037700 Sobic004G007200--Sobic002G037700 Sobic004G007200--Sobic010G210400 Sobic004G007200--Sobic002G215600 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic004G007200--Sobic006G111400 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic004G007200--Sobic001G367900 Sobic008G159800 Sobic008G159800 Sobic004G007200--Sobic008G159800 Sobic002G365300--Sobic008G026500 Sobic002G365300--Sobic004G089801 Sobic001G523050 Sobic001G523050 Sobic002G365300--Sobic001G523050 Sobic002G365300--Sobic004G272000 Sobic002G365300--Sobic001G005100 Sobic002G365300--Sobic003G059500 Sobic010G000401 Sobic010G000401 Sobic002G365300--Sobic010G000401 Sobic002G365300--Sobic001G084133 Sobic002G365300--Sobic005G230900 Sobic010G054400 Sobic010G054400 Sobic004G343733--Sobic010G054400 Sobic004G343733--Sobic002G180200 Sobic009G047033 Sobic009G047033 Sobic004G343733--Sobic009G047033 Sobic004G343733--Sobic001G070900 Sobic007G182400 Sobic007G182400 Sobic004G343733--Sobic007G182400 Sobic010G213100 Sobic010G213100 Sobic004G343733--Sobic010G213100 Sobic001G062000 Sobic001G062000 Sobic004G343733--Sobic001G062000 Sobic004G343733--Sobic009G079700 Sobic003G091900 Sobic003G091900 Sobic004G343733--Sobic003G091900 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic010G187950--Sobic001G228500 Sobic007G224700 Sobic007G224700 Sobic010G187950--Sobic007G224700 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic010G187950--Sobic002G043201 Sobic010G015400 Sobic010G015400 Sobic010G187950--Sobic010G015400 Sobic010G187950--Sobic008G153300 Sobic004G167500 Sobic004G167500 Sobic010G187950--Sobic004G167500 Sobic002G426201 Sobic002G426201 Sobic010G187950--Sobic002G426201 Sobic010G187950--Sobic002G215600 Sobic010G187950--Sobic002G274000 Sobic006G049000 Sobic006G049000 Sobic002G215600--Sobic006G049000 Sobic002G215600--Sobic008G153300 Sobic002G215600--Sobic003G059500 Sobic002G215600--Sobic004G167500 Sobic004G045000 Sobic004G045000 Sobic002G215600--Sobic004G045000 Sobic002G215600--Sobic003G356500 Sobic003G438100 Sobic003G438100 Sobic002G215600--Sobic003G438100 Sobic001G468900 Sobic001G468900 Sobic002G215600--Sobic001G468900 Sobic002G215600--Sobic001G367900
Octagon: transcription factors


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