Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G387400.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QNJ5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g17426.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G007166 - -
2 Sobic.001G174200 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
3 Sobic.008G187450 - -
4 Sobic.004G039000 expressed protein -
5 Sobic.003G254850 - -
6 Sobic.004G352750 - -
7 Sobic.001G234766 - -
8 Sobic.007G043050 - -
9 Sobic.001G208133 - -
10 Sobic.001G257600 - -
11 Sobic.007G203600 transferase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G175000 carrier, putative, expressed -
13 Sobic.007G175100 carrier, putative, expressed -
14 Sobic.008G176266 - -
15 Sobic.004G347833 - -
16 Sobic.002G262250 - -
17 Sobic.005G148300 - -
18 Sobic.009G011050 - -
19 Sobic.002G070500 anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
20 Sobic.009G056950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic001G387400--Sobic004G007166 Sobic001G174200 Sobic001G174200 Sobic001G387400--Sobic001G174200 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic001G387400--Sobic008G187450 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic001G387400--Sobic004G039000 Sobic003G254850 Sobic003G254850 Sobic001G387400--Sobic003G254850 Sobic004G352750 Sobic004G352750 Sobic001G387400--Sobic004G352750 Sobic001G234766 Sobic001G234766 Sobic001G387400--Sobic001G234766 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic001G387400--Sobic007G043050 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic001G387400--Sobic001G208133 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic004G007166--Sobic008G176266 Sobic004G007166--Sobic001G387400 Sobic004G007166--Sobic008G187450 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic004G007166--Sobic002G070500 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic004G007166--Sobic004G272000 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic004G007166--Sobic007G203600 Sobic004G007166--Sobic007G043050 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic004G007166--Sobic009G028650 Sobic004G007166--Sobic001G174200 Sobic007G175100 Sobic007G175100 Sobic001G174200--Sobic007G175100 Sobic002G262250 Sobic002G262250 Sobic001G174200--Sobic002G262250 Sobic001G174200--Sobic004G352750 Sobic005G109101 Sobic005G109101 Sobic001G174200--Sobic005G109101 Sobic007G175000 Sobic007G175000 Sobic001G174200--Sobic007G175000 Sobic001G174200--Sobic001G208133 Sobic001G174200--Sobic001G387400 Sobic002G326300 Sobic002G326300 Sobic001G174200--Sobic002G326300 Sobic001G174200--Sobic008G187450 Sobic008G187450--Sobic004G007166 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic008G187450--Sobic005G198150 Sobic008G187450--Sobic002G262250 Sobic008G187450--Sobic007G203600 Sobic008G187450--Sobic001G387400 Sobic008G187450--Sobic001G174200 Sobic008G187450--Sobic009G028650 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic008G187450--Sobic003G340500 Sobic008G187450--Sobic008G176266 Sobic004G039000--Sobic001G208133 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic004G039000--Sobic001G202800 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic004G039000--Sobic004G092950 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic004G039000--Sobic002G117800 Sobic002G428301 Sobic002G428301 Sobic004G039000--Sobic002G428301 Sobic004G039000--Sobic003G254850 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic004G039000--Sobic009G011050 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic004G039000--Sobic006G239200 Sobic002G325000 Sobic002G325000 Sobic004G039000--Sobic002G325000 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic003G254850--Sobic007G134700 Sobic003G254850--Sobic001G202800 Sobic003G254850--Sobic009G011050 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic003G254850--Sobic006G037800 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic003G254850--Sobic010G225175 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic003G254850--Sobic008G056000 Sobic003G254850--Sobic004G039000 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic003G254850--Sobic010G149000 Sobic009G188200 Sobic009G188200 Sobic003G254850--Sobic009G188200 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic004G352750--Sobic003G031300 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic004G352750--Sobic003G311300 Sobic004G352750--Sobic001G208133 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic004G352750--Sobic004G079400 Sobic004G352750--Sobic001G174200 Sobic001G257600 Sobic001G257600 Sobic004G352750--Sobic001G257600 Sobic004G352750--Sobic006G239200 Sobic004G352750--Sobic009G011050 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic004G352750--Sobic003G030100 Sobic001G234766--Sobic002G326300 Sobic009G074000 Sobic009G074000 Sobic001G234766--Sobic009G074000 Sobic007G173400 Sobic007G173400 Sobic001G234766--Sobic007G173400 Sobic001G234766--Sobic001G387400 Sobic010G160850 Sobic010G160850 Sobic001G234766--Sobic010G160850 Sobic004G347833 Sobic004G347833 Sobic001G234766--Sobic004G347833 Sobic009G056950 Sobic009G056950 Sobic001G234766--Sobic009G056950 Sobic001G234766--Sobic007G175100 Sobic001G182100 Sobic001G182100 Sobic001G234766--Sobic001G182100 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic007G043050--Sobic001G519500 Sobic006G007700 Sobic006G007700 Sobic007G043050--Sobic006G007700 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic007G043050--Sobic001G369701 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic007G043050--Sobic010G165925 Sobic007G043050--Sobic007G203600 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic007G043050--Sobic007G003250 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic007G043050--Sobic006G196800 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic007G043050--Sobic005G107250 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic007G043050--Sobic010G263151 Sobic001G208133--Sobic003G311300 Sobic001G208133--Sobic006G239200 Sobic001G208133--Sobic009G011050 Sobic001G208133--Sobic003G031300 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic001G208133--Sobic006G038050 Sobic001G208133--Sobic001G202800 Sobic001G208133--Sobic004G079400 Sobic001G208133--Sobic007G134700 Sobic001G208133--Sobic004G039000
Octagon: transcription factors


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