Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G174200.1
Synonym Sb01g015170
Functional annotation GRAS family transcription factor containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QJH3
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF60
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G37650 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g40080.1 : GRAS family transcription factor containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G175100 carrier, putative, expressed -
2 Sobic.002G262250 - -
3 Sobic.004G352750 - -
4 Sobic.005G109101 - -
5 Sobic.007G175000 carrier, putative, expressed -
6 Sobic.001G208133 - -
7 Sobic.001G387400 expressed protein -
8 Sobic.002G326300 TKL_IRAK_DUF26-lh.9 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
9 Sobic.008G187450 - -
10 Sobic.009G011050 - -
11 Sobic.002G375500 protein kinase domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G486400 - -
13 Sobic.003G030100 pentatricopeptide, putative, expressed -
14 Sobic.001G257600 - -
15 Sobic.003G311300 GRF zinc finger family protein, expressed -
16 Sobic.003G108300 expressed protein -
17 Sobic.007G134700 formin, putative, expressed -
18 Sobic.006G038050 - -
19 Sobic.010G274700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@receptor kinase, putative, expressed -
20 Sobic.007G038100 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G174200 Sobic001G174200 Sobic007G175100 Sobic007G175100 Sobic001G174200--Sobic007G175100 Sobic002G262250 Sobic002G262250 Sobic001G174200--Sobic002G262250 Sobic004G352750 Sobic004G352750 Sobic001G174200--Sobic004G352750 Sobic005G109101 Sobic005G109101 Sobic001G174200--Sobic005G109101 Sobic007G175000 Sobic007G175000 Sobic001G174200--Sobic007G175000 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic001G174200--Sobic001G208133 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic001G174200--Sobic001G387400 Sobic002G326300 Sobic002G326300 Sobic001G174200--Sobic002G326300 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic001G174200--Sobic008G187450 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic007G175100--Sobic002G375500 Sobic007G175100--Sobic007G175000 Sobic007G038100 Sobic007G038100 Sobic007G175100--Sobic007G038100 Sobic007G175100--Sobic001G174200 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic007G175100--Sobic010G274700 Sobic003G057000 Sobic003G057000 Sobic007G175100--Sobic003G057000 Sobic001G174100 Sobic001G174100 Sobic007G175100--Sobic001G174100 Sobic001G145550 Sobic001G145550 Sobic007G175100--Sobic001G145550 Sobic001G422001 Sobic001G422001 Sobic007G175100--Sobic001G422001 Sobic002G262250--Sobic001G174200 Sobic001G486400 Sobic001G486400 Sobic002G262250--Sobic001G486400 Sobic002G262250--Sobic008G187450 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic002G262250--Sobic008G060800 Sobic001G221700 Sobic001G221700 Sobic002G262250--Sobic001G221700 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic002G262250--Sobic008G053800 Sobic002G262250--Sobic005G109101 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic002G262250--Sobic005G198150 Sobic002G262250--Sobic010G274700 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic004G352750--Sobic003G031300 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic004G352750--Sobic003G311300 Sobic004G352750--Sobic001G208133 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic004G352750--Sobic004G079400 Sobic004G352750--Sobic001G174200 Sobic001G257600 Sobic001G257600 Sobic004G352750--Sobic001G257600 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic004G352750--Sobic006G239200 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic004G352750--Sobic009G011050 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic004G352750--Sobic003G030100 Sobic005G109101--Sobic009G011050 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic005G109101--Sobic006G038050 Sobic005G109101--Sobic001G208133 Sobic005G109101--Sobic003G311300 Sobic005G109101--Sobic001G174200 Sobic005G109101--Sobic006G239200 Sobic005G109101--Sobic008G060800 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic005G109101--Sobic006G037800 Sobic005G109101--Sobic003G031300 Sobic007G175000--Sobic007G175100 Sobic003G210500 Sobic003G210500 Sobic007G175000--Sobic003G210500 Sobic007G175000--Sobic007G038100 Sobic007G175000--Sobic001G174200 Sobic007G175000--Sobic002G375500 Sobic009G037500 Sobic009G037500 Sobic007G175000--Sobic009G037500 Sobic007G175000--Sobic001G145550 Sobic007G149950 Sobic007G149950 Sobic007G175000--Sobic007G149950 Sobic005G150700 Sobic005G150700 Sobic007G175000--Sobic005G150700 Sobic001G208133--Sobic003G311300 Sobic001G208133--Sobic006G239200 Sobic001G208133--Sobic009G011050 Sobic001G208133--Sobic003G031300 Sobic001G208133--Sobic006G038050 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic001G208133--Sobic001G202800 Sobic001G208133--Sobic004G079400 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic001G208133--Sobic007G134700 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic001G208133--Sobic004G039000 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic001G387400--Sobic004G007166 Sobic001G387400--Sobic001G174200 Sobic001G387400--Sobic008G187450 Sobic001G387400--Sobic004G039000 Sobic003G254850 Sobic003G254850 Sobic001G387400--Sobic003G254850 Sobic001G387400--Sobic004G352750 Sobic001G234766 Sobic001G234766 Sobic001G387400--Sobic001G234766 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic001G387400--Sobic007G043050 Sobic001G387400--Sobic001G208133 Sobic002G326300--Sobic001G174200 Sobic002G326300--Sobic001G486400 Sobic002G326300--Sobic004G352750 Sobic009G056950 Sobic009G056950 Sobic002G326300--Sobic009G056950 Sobic002G326300--Sobic005G109101 Sobic002G326300--Sobic009G011050 Sobic002G326300--Sobic001G234766 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic002G326300--Sobic010G228800 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic002G326300--Sobic006G224600 Sobic008G187450--Sobic004G007166 Sobic008G187450--Sobic005G198150 Sobic008G187450--Sobic002G262250 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic008G187450--Sobic007G203600 Sobic008G187450--Sobic001G387400 Sobic008G187450--Sobic001G174200 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic008G187450--Sobic009G028650 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic008G187450--Sobic003G340500 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic008G187450--Sobic008G176266
Octagon: transcription factors


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