Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G139501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RDS7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G270300 Mlo family(PubMedID : 29491869)@MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
2 Sobic.002G123700 - -
3 Sobic.005G120101 - -
4 Sobic.003G030200 phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, putative, expressed K01598: PPCDC, phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
5 Sobic.003G301950 - -
6 Sobic.004G305300 - -
7 Sobic.003G118500 OsFBLD1 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G079600 expressed protein -
9 Sobic.004G149000 - -
10 Sobic.003G150700 pectinacetylesterase domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G203600 Regulator of chromosome condensation domain containing protein, expressed -
12 Sobic.009G147600 pentatricopeptide, putative, expressed -
13 Sobic.002G197400 expressed protein -
14 Sobic.001G104100 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@ACT domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G227100 cyclin-dependent kinase inhibitor, putative, expressed -
16 Sobic.002G110600 regulatory protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G276400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Alpha-amylase isozime 2 precursor AMY3 (Os)(PubMedID : 27208977)@alpha-amylase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.004G026000 ankyrin repeat domain-containing protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
19 Sobic.008G160100 - -
20 Sobic.006G121200 high affinity nitrate transporter, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G139501 Sobic006G139501 Sobic006G270300 Sobic006G270300 Sobic006G139501--Sobic006G270300 Sobic002G123700 Sobic002G123700 Sobic006G139501--Sobic002G123700 Sobic005G120101 Sobic005G120101 Sobic006G139501--Sobic005G120101 Sobic003G030200 Sobic003G030200 Sobic006G139501--Sobic003G030200 Sobic003G301950 Sobic003G301950 Sobic006G139501--Sobic003G301950 Sobic004G305300 Sobic004G305300 Sobic006G139501--Sobic004G305300 Sobic003G118500 Sobic003G118500 Sobic006G139501--Sobic003G118500 Sobic003G079600 Sobic003G079600 Sobic006G139501--Sobic003G079600 Sobic004G149000 Sobic004G149000 Sobic006G139501--Sobic004G149000 Sobic002G227100 Sobic002G227100 Sobic006G270300--Sobic002G227100 Sobic004G203600 Sobic004G203600 Sobic006G270300--Sobic004G203600 Sobic007G200300 Sobic007G200300 Sobic006G270300--Sobic007G200300 Sobic002G280001 Sobic002G280001 Sobic006G270300--Sobic002G280001 Sobic006G270300--Sobic004G149000 Sobic006G270300--Sobic003G079600 Sobic003G150700 Sobic003G150700 Sobic006G270300--Sobic003G150700 Sobic006G270300--Sobic002G123700 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic006G270300--Sobic006G111400 Sobic006G121200 Sobic006G121200 Sobic002G123700--Sobic006G121200 Sobic007G213500 Sobic007G213500 Sobic002G123700--Sobic007G213500 Sobic004G026000 Sobic004G026000 Sobic002G123700--Sobic004G026000 Sobic002G123700--Sobic004G203600 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic002G123700--Sobic001G468200 Sobic002G320700 Sobic002G320700 Sobic002G123700--Sobic002G320700 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic002G123700--Sobic001G368000 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic002G123700--Sobic001G483200 Sobic009G235100 Sobic009G235100 Sobic002G123700--Sobic009G235100 Sobic009G163000 Sobic009G163000 Sobic005G120101--Sobic009G163000 Sobic005G120101--Sobic006G139501 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic005G120101--Sobic001G230600 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic005G120101--Sobic002G162601 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic005G120101--Sobic001G070900 Sobic001G398100 Sobic001G398100 Sobic005G120101--Sobic001G398100 Sobic002G180200 Sobic002G180200 Sobic005G120101--Sobic002G180200 Sobic001G515350 Sobic001G515350 Sobic005G120101--Sobic001G515350 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic005G120101--Sobic001G208166 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic003G030200--Sobic001G312801 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic003G030200--Sobic001G490600 Sobic009G147600 Sobic009G147600 Sobic003G030200--Sobic009G147600 Sobic001G191400 Sobic001G191400 Sobic003G030200--Sobic001G191400 Sobic003G030200--Sobic001G368000 Sobic003G106100 Sobic003G106100 Sobic003G030200--Sobic003G106100 Sobic003G030200--Sobic007G213500 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic003G030200--Sobic007G017300 Sobic003G030200--Sobic003G301950 Sobic001G082700 Sobic001G082700 Sobic003G301950--Sobic001G082700 Sobic002G387000 Sobic002G387000 Sobic003G301950--Sobic002G387000 Sobic003G301950--Sobic003G030200 Sobic002G197400 Sobic002G197400 Sobic003G301950--Sobic002G197400 Sobic003G301950--Sobic009G147600 Sobic007G189900 Sobic007G189900 Sobic003G301950--Sobic007G189900 Sobic004G091300 Sobic004G091300 Sobic003G301950--Sobic004G091300 Sobic003G301950--Sobic001G312801 Sobic003G276400 Sobic003G276400 Sobic003G301950--Sobic003G276400 Sobic001G350300 Sobic001G350300 Sobic004G305300--Sobic001G350300 Sobic006G170800 Sobic006G170800 Sobic004G305300--Sobic006G170800 Sobic004G305300--Sobic003G118500 Sobic001G191300 Sobic001G191300 Sobic004G305300--Sobic001G191300 Sobic001G104100 Sobic001G104100 Sobic004G305300--Sobic001G104100 Sobic002G085600 Sobic002G085600 Sobic004G305300--Sobic002G085600 Sobic004G350600 Sobic004G350600 Sobic004G305300--Sobic004G350600 Sobic002G399000 Sobic002G399000 Sobic004G305300--Sobic002G399000 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic004G305300--Sobic007G077466 Sobic003G118500--Sobic004G305300 Sobic003G118500--Sobic001G104100 Sobic003G118500--Sobic001G191300 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic003G118500--Sobic004G310400 Sobic003G118500--Sobic001G350300 Sobic003G118500--Sobic004G026000 Sobic001G096200 Sobic001G096200 Sobic003G118500--Sobic001G096200 Sobic003G118500--Sobic007G077466 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic003G118500--Sobic003G362800 Sobic003G079600--Sobic003G150700 Sobic009G208000 Sobic009G208000 Sobic003G079600--Sobic009G208000 Sobic003G079600--Sobic004G149000 Sobic003G079600--Sobic002G227100 Sobic003G040300 Sobic003G040300 Sobic003G079600--Sobic003G040300 Sobic003G079600--Sobic006G270300 Sobic007G010400 Sobic007G010400 Sobic003G079600--Sobic007G010400 Sobic004G181000 Sobic004G181000 Sobic003G079600--Sobic004G181000 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic003G079600--Sobic002G001500 Sobic004G149000--Sobic007G200300 Sobic004G081000 Sobic004G081000 Sobic004G149000--Sobic004G081000 Sobic004G149000--Sobic009G147600 Sobic004G149000--Sobic002G227100 Sobic004G149000--Sobic002G280001 Sobic004G149000--Sobic002G320700 Sobic004G149000--Sobic006G270300 Sobic004G149000--Sobic003G079600 Sobic006G169600 Sobic006G169600 Sobic004G149000--Sobic006G169600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.